（12）個體發生學是研究生物個體的發生，從胚卵逐漸發育以至形成完全的個體過程的一門學科。
（13）大即大的秘密，指自然的秘密。犁然，清楚明白的意思。
（14）官品官指器官。嚴複在《天演論·能實》的按語中說：\"晚近生學家，謂有生者如人禽蟲魚草木之屬，為有官之物，是名官品。
而金石水土無官，曰非官品。\"這裏魯迅沿用了嚴複的用語，\"官品\"指生物，\"非官品\"指無生物。
（15）盤古我國古代神話中開天辟地的人。《太平禦覽》卷二引三國吳徐整《三五曆記》說：\"天地混沌如雞子，盤古生其中萬八千歲。天地開辟，陽清為天，陰濁為地。盤古在其中，一日九變，神於天，聖於地。天日高一丈，地日厚一丈，盤古日長一丈；如此萬八千歲，天數極高，地數極深，盤古極長。\"又清代馬筘《繹史》卷一曾引徐整《五運曆年紀》說：\"首生盤古，垂死化身，氣成風雲，聲為雷霆；左眼為日，右眼為月；四肢五體為四極五嶽，血液為江河，筋脈為地裏；肌肉為田土，發髭為星辰；皮毛為草木，齒骨為金石；精髓為珠玉，汗流為雨澤；身之諸蟲，因風所感，化為黎。\"南朝梁任靶《述異記》也有類似的記載。按正文中說的女媧似應為盤古。
（16）上下未形即天地尚未形成。冥昭瞢暗，即晝夜不分，混混沌沌的意思。見《楚辭·天問》：\"上下未形，何由考之？冥昭瞢暗，誰能極之？\"
（17）屈靈均（約前３４０-約前２７８）名平，字原，又字靈均，戰國後期楚國詩人。作品有《離騷》、《九歌》、《九章》、《天問》等。
\"載山，何以安之\"，見《天問》。漢代王逸注引劉向《列仙傳》說：\"有巨靈之，背負蓬萊之山而，舞戲滄海之中。\"鼓掌。
（18）摩西（Ｍｏｓｅｓ）《聖經》故事中古代猶太人的領袖，猶太教的創始人。《創世記》是《舊約》摩西五書之一，《舊約全書》的第一卷，共五十章，前兩章記上帝創造天地萬物的故事。
（19）摶埴揉合粘土。
（20）法王即教皇。
（21）黑格爾諡之曰世界史之大欺罔者海克爾在《宇宙之謎》一書中曾說：\"羅馬教整個曆史，。。。。。。隻不過是一部由謊言和欺詐無恥編造起來的東西而已，。。。。。。他們大多數是無恥的巫師和騙子。\"
（22）宗教改萌即宗教改革，指歐洲十四世紀至十六世紀基督教內反對羅馬教皇封建統治的資產階級性質的革命運動。其中比較溫和的一派代表市民階級（如德國的路德），激進的一派代表被壓迫的農民和城市貧民（如德國的閔采爾）。宗教改革對歐洲曆史的發展起了推進作用。
（23）景教基督教的一支，又稱聶斯托利派，唐太宗貞觀九年（６３５）傳入我國，稱為景教。作者在這裏是泛指整個基督教而言。
（24）歌白尼（１４７３-１５４３）通譯哥白尼，波蘭天文學家，宇宙太陽中心說的創立人。他推翻了在天文學上統治了一千餘年的地心天動學說，動搖了歐洲中世紀神權論的基礎，不僅是天文學史上一次重大的革命，而且引起了人類宇宙觀的革新。他的《天體運行》一書，是把自然科學從神學的勢力下解放出來的巨著之一。
（25）韋賽黎（１５１４-１５６４）通譯維薩裏，比利時人體解剖學家。他第一個采用屍體解剖的方法講授解剖學，並以自己的實驗研究為根據，寫成了《人體的構造》一書。
（26）歐斯泰幾（約１５２０-１５７４）意大利解剖學家。他發現\"歐氏管\"和\"歐氏瓣膜\"。著有《解剖學圖解》等。
（27）獍驗即解剖。獍，劈的意思。
（28）林那（１７０７-１７７８）通譯林奈，瑞典生物學家，動植物係統分類的創造者。他定出了五個互相依屬的分類的名稱：綱、目、屬、種和變種，奠定了分類學的基礎。主要著作有《自然界係統》（即文中所說的《天物係統論》零）等。
（29）諾亞時洪水之難《舊約全書·創世記》第七章載：上古洪水泛濫，生物盡滅；但諾亞（Ｎｏａｈ）得上帝啟示，造方舟避難，此後地球上的生物，包括人類，都是方舟中的生物傳下來的。
（30）蘭麻克（１７４４-１８２９）通譯拉馬克，法國生物學家，生物進化論的先驅者。最先提出生物進化的學說（即拉馬克主義）。他在一八○九年作的《動物學哲學》一書中提出\"直接順應說\"（即\"環境說\"），認為生物進化的主要原因，是由於受環境的直接影響，器官用進廢退，而後天獲得的性狀又可以遺傳。它有力地反對了宗教的\"神造論\"和\"物種不變論\"，在科學上為達爾文學說的創立準備了條件。
主要著作還有《法國植物誌》、《對有生命天然物體的觀察》（即文中所說的《生體論》）等。
（31）寇偉（１７６９-１８３２）通譯居維葉，法國動物學家、古生物學家。一八一二年作《化石骨骼論》，創立了古生物學。但他是一個加爾文教徒，不相信進化論，確信種的不變性，從不同地層有不同生物的事實，臆造出形而上學的\"地球革命說\"（即\"激變論\"）以符合化石上的事實。恩格斯批判他說：\"居維葉關於地球經曆多次革命的理論在詞句上是革命的，而在實質上是反動的。\"（見《自然辯證法》）主要著作有《地球表麵的生物進化》、《比較解剖學教程》等。按他的《化石骨骼論》作於拉馬克的《動物學哲學》之後三年，文中說\"寇偉實先之\"，疑有誤。
（32）\"變動說\"今稱\"激變論\"或\"災變論\"。
（33）聖契黎（１７７２-１８４４）通譯聖希雷爾，法國動物學家。
他認為生物是由以前為數不多的物種經過變化而繁生，變化的原因是由環境的影響。著有《哺乳動物自然史》、《大型獸類分類論》等。一八三○年他和居維葉在巴黎法國科學院（即文中所說的\"巴黎學士會院\"）的辯論，是科學史上有名的事件。
（34）瞿提（１７４９-１８３２）通譯歌德，德國詩人、學者。他在動植物學、解剖學上都有貢獻，同時是進化論思想的先驅者之一。在這方麵的主要著作有《植物形態學》（即文中所說的《植物形態論》）等。
（35）康德（１７２４-１８０４）德國哲學家，唯心主義者。他早期主要研究自然哲學，一七五五年出版《自然通史和天體論》，提出關於太陽係起源的星雲假說，對於進化論思想體係的創立有很大啟發。後期著重於所謂\"批判哲學\"的研究，企圖調和唯物論與唯心論、科學與宗教的衝突。其重要哲學著作有《純粹理性批判》、《實踐理性批判》等。
（36）倭堪（１７７９-１８５１）通譯奧鏗，德國自然科學家、自然哲學家。他在哲學上傾向泛神論。著有《自然哲學教本》等。
（37）細胞說德國植物學家施萊登（Ｍ．Ｊ．Ｓｃｈｌｅｉｄｅｎ）和德國動物學家施旺（Ｔ．Ｓｃｈｗａｎｎ）於一八三九年所創立的學說，認為一切動植物都是由細胞發育而來，並且是由細胞和細胞產物所構成的。
恩格斯認為，細胞學說是十九世紀自然科學三大發現之一。
（38）華累斯（１８２３-１９１３）通譯華萊士，英國動物學家，自然選擇說的建立者之一。他的和達爾文的關於自然選擇理論的論文在一八五八年七月林奈學會上同時宣讀。但他在哲學上是一個唯心主義的心靈論者。著有《動物的地理分布》、《海島上的生命》等。天擇論，即自然選擇論。
（39）生學即生物學。
（40）內籀即歸納法。
（41）壁克耳通譯\"貝格爾\"，一艘英國海軍的勘探船。
（42）儀的目的。
（43）同係，飼養的意思。
（44）按十傳應為二千四十八。
（45）局脊通作口止局口止脊，拘束的意思。
（46）根幹細胞即受精卵。
（47）阿彌巴通譯阿米巴，拉丁文Ａｍｏｅｂａ的音譯，即變形蟲。
（48）班陀黎那即實球藻，單細胞生物進化到多細胞生物中間階段的一種生物。它的身體由八個、十六十或三十二個細胞組成一個實心的球體。
（49）原腸即消化腔。按實球藻無此器官，到腔腸動物才有。
（50）希特拉即水螅，腔腸動物的一種。
（51）按這裏所說的太古代以及下文的中古代、近古代三個地質曆史年代，現在通作古生代、中生代、新生代。又這裏所說的僦羅紀及下文的迭逢紀、石墨紀，現在通作誌留紀、泥盆紀、石炭紀，各是古生代中的一紀。
（52）無脊椎動物化石，作者當時未見，現已多有發現。
（53）穆那羅原生動物的一種。
（54）爪哇之猿人化石世界上最早發現的猿人化石。一八九一年由荷蘭人類學家杜伯亞在印度尼西亞爪哇特裏尼爾發現，計有頭蓋骨一具，臼齒二枚，左側股骨一根。形態特征，介於猿與人之間。據推斷，其地質年代屬更新世中期，距今約五十萬年前。
（55）那格黎（１８１７-１８９１）通譯耐格裏，瑞士植物學家。他研究種子的起源，創造了水藻新分類法。著有《自然科學的種的概念和發生》等。
（56）質力不滅律即物質不滅定律和能量不滅定律。