豐田大將判斷對敵人航空攻擊成功，命令航空部隊、在岩國附近的誌摩清英中將指揮的第二遊擊部隊追擊。在12日至16日間進行的台灣航空戰中，聯合艦隊司令部判斷擊沉11艘空母、擊傷8艘。大本營對此進行了公開發表。但此次損失了約二百二十架飛機的航空攻擊，幾近於徒勞無功。美海軍方麵的資料是，那時美空母機動部隊是以9艘正規空母、8艘巡洋艦改造空母為主力的共計90多艘組成的大艦隊，沒有被擊沉1艘，不過是2艘巡洋艦受到損傷。
沒能夠確認台灣航空戰的戰果，是在於美日戰力相差過於懸殊，日本方飛機也沒有富餘前去調查。如果能有報告上那樣的戰果的話，美空母機動部隊也不會有5天時間在日本國近海行動。毫無疑問，豐田大將以下的聯合艦隊司令部的有關人員見解過於膚淺。
這點說明了與「阿」號作戰前一樣，對於美日方戰力的認識一點也沒改變。導致這種結果，是沒有冷靜地判斷情況，而是基於重大的責任並抱有希望，事實上，這樣的心態在聯合艦隊的有關航空人員中也不在少數。因此，飛行員即便誇大報告了戰果，各級指揮官和參謀也寧願相信這樣的結果。
台灣航空戰後，美進攻部隊在萊特島和周邊登陸。
10月15日，美空母機動部隊繼續空襲馬尼拉方麵，17日，敵部隊襲擊了萊特島東方的蘇祿安島，得到通知後，豐田大將下令「捷一號作戰警戒」，栗田健男中將指揮的第一遊擊部隊從林加泊地進入文萊，決心前進。
聯合艦隊司令長官豐田副武大將在戰後解釋這個作戰計劃時說的很清楚，如果菲律賓落入美國人之手，則意味著南方資源地帶和日本本土的徹底隔離，這時候第二艦隊怎麼辦？回到已經油庫見底的內地來的話是一堆廢鐵，呆在荷屬東印度附近的話因為無法得到本土的彈藥補充還是一堆廢鐵，看起來那麼威武挺拔的戰列艦，世界上最大的大和武藏就是這樣已經淪為了廢鐵，沒什麼可惜不可惜的。豐田有一句沒有說出來，而大家都心領神會的話就是對於聯合艦隊和軍令部來說，戰爭已經結束了，日本已經徹底失敗了，已經要亡國了，不可能還會有第二種結果了。亡國之軍還能有軍艦嗎？不能，一定要在還沒有完全亡國之前，為這些凝聚了幾代日本海軍軍人夢想的軍艦們尤其是戰列艦尋找一個墳地。
預定參加此次作戰的聯合艦隊，已經失去了有組織的戰鬥力。向呂宋島東方海麵出動的是小澤中將指揮的機動部隊本隊，向菲律賓中部方麵進擊的是栗田中將指揮的第一遊擊部隊，從菲律賓南部駛向萊特灣的是西村祥治中將指揮的第一遊擊部隊支隊和誌摩中將指揮的第二遊擊部隊。基地航空部隊是福留繁中將指揮的第二航空艦隊、大西瀧治郎中將指揮的第一航空艦隊。但都被美艦隊各個擊破，全盤來看完全是無功而返。
萊特灣海戰時的各部隊戰法，與日本海軍的傳統作戰方針和《海戰要務令》開頭說的“戰鬥的要訣是先發製人和集中”原則相反。先發製人常常是主動戰鬥，集中則是全力攻擊敵人分散的力量。
這次海戰中，值得大書特書的是，神風特別攻擊隊擊沉、擊傷數艘美護衛空母。但特別攻擊隊也未能對正規空母報一箭之仇。而且從聯合艦隊的整體來看，相比付出的犧牲，得到的戰果微不足道。這次海戰後，聯合艦隊實質上成了隻剩若幹航空部隊和潛水部隊的小部隊。
1945年1月，在菲律賓的陸海軍部隊雖然經過三個月的殊死奮戰，該方麵最終還是被美軍占領。美進攻部隊於2月中旬在硫磺島、3月下旬在衝繩本島登陸時，聯合艦隊隻能以所在部隊和以撞擊攻擊為主的航空部隊反擊。此時，海軍部隊為了戰爭的勝利，已經處於了為戰鬥而戰鬥的狀態。
昭和20年4月上旬，豐田大將企圖進行和航空部隊與潛水部隊不同的特別攻擊，投入了以戰艦大和號為基幹的第一遊擊部隊。豐田大將為了支援衝繩方麵勇敢戰鬥的陸海軍部隊，將第二艦隊司令長官伊藤整一中將指揮的以戰艦「大和」、1艘輕巡、8艘驅逐艦組成的部隊命名為海上特攻隊。命令該隊於4月6日從豐後水道出擊，7日突入衝繩西方海麵，攻擊敵水上艦艇和運輸船隊。「大和」作為大艦，對航空攻擊薄弱，這從菲律賓海戰時被擊沉的「武藏」便可清楚得知。豐田大將在特攻隊出擊時訓示：茲編成海上特攻隊，實施壯烈無比的突入作戰，以此一舉振我帝國海軍聲威，發揚帝國海軍海上部隊光榮傳統，榮光後世。戰後，豐田如此向美軍調查團解釋他關於大和參加菊水作戰的決定：“衝繩一旦失陷，本土決戰勢必如城門失火、危在旦夕。當此危機關頭，海軍必須窮盡一切辦法挽救時局，而唯一可用的艦隊力量就是大和號……當時我認為，盡管作戰勝利的可能性還不到50%，但萬一成功就是奇跡。而如果選擇全無作為、枯坐待斃的話，留在港內的巨艦早晚為美軍繳械，官兵則被虐殺，這是軍人的榮譽所不能容忍的。我們明知作戰不可能取勝，也深知大犧牲必然導致大痛苦，但就權當聊勝於無了。”這個特別的作戰指導，若考慮這時點的狀況，也有其存在的理由。應該看到，豐田大將作為聯合艦隊司令長官在任期內竭盡航空、水中、海上特攻隊等攻擊手段的最大原因，不可否認是「阿」號作戰的失敗。
在「阿」號作戰中預想敵我之間的艦隊決戰（馬裏亞納海戰）前，如果豐田大將就像他對全軍訓示的那樣，如其所言賭上皇國興廢來指導作戰的話，此後戰鬥的情況很可能會大不相同。「大和」在「阿」號作戰時也應被給予其活躍的舞台。
作為聯合艦隊司令長官的豐田大將雖然讓人感覺鬥誌旺盛，但卻留下了指導航空作戰受挫、延誤了戰爭的印象。