南宋後期軍訓情況開展受到當時種種因素製約，相比宋孝宗時期已經有一定差距，當時軍訓存在諸多問題，但是也並不像《宋史》所說“訓練之製大壞矣”。還是有積極的一麵。
一、水軍訓練的興盛
南宋對水軍訓練一直比較重視，至南宋後期，由於陸戰不利，再加上江南地區適於水戰，“東南沮洳，非用武之地，故多以舟師勝。”水軍訓練廣受重視“今沿江諸軍鹹有棹船士，每按試中流，上下如飛，北人駭愕。”
嘉定年間程卓在福建，為了剿滅海盜，加強當地水軍訓練，“及論三山海寇所以難製者，以兵將皆不習海道之險。欲擇選統領及所用廵兵，使之朝夕閱習，長於水戰，則盜之長技無所施矣。”
宋元戰事開啟後，南宋地理形勢適合水戰，並且南宋軍陸戰能力與元軍相差甚遠，所以南宋政府更加注重水軍建設與訓練。淳祐年間，王埜知鎮江府，兼都大提舉浙西兵船，“巡江，引水軍大閱，舳艫相銜幾三十裏。”寶祐六年（1258），檢閱沿海水軍，“舟船上下，旗幟精明，砲擊檣衝，觀者如堵，以為自有沿海製司所未見也。”
正是緣於南宋水軍訓練精良，實力強大，相反元（蒙古）軍隊則缺乏足夠水軍，導致其始終無法突破南宋江淮防線。嘉熙二年（1238）九月，元軍圍廬州，杜杲在擊破圍城部隊後，“又練舟師扼淮河”，水陸並重，加強防守力量。
紹定年間李全陰謀攻宋，知道宋水軍實力，所以首先訓練自己的水軍。“全知東南利舟師，謀習水戰，米商至，悉並舟糴之，留其柁工，一以教十。”並且多次檢閱水軍戰術演習。
元方依靠南宋降將劉整訓練水軍之後，這才能與南宋水上力量相抗衡，襄樊之戰中元軍就是憑借水軍封鎖兩城對外聯係，並最終取勝。隨後進行的陽邏堡之戰、丁家洲之戰、焦山之戰都是宋元雙方水上決戰，元軍擊潰了宋軍水師主力，直逼臨安。此後張世傑水軍仍然支撐南宋殘局達三年之久，不能否認南宋水軍之強大，而這樣的強大正是建立在良好訓練的基礎之上。
二、軍訓的正常發展
宋光宗、宋寧宗、宋理宗都曾經效仿宋前代君主，舉行講武活動，檢閱軍隊訓練，這是其重視軍事訓練的直觀體現。《淳祐臨安誌》記載臨安城內有“教場”：“在府治之西，閱府隅將兵，旬射於此。”
《慶元條法事類》中規定州縣長官要經常檢閱軍隊訓練情況，並要向樞密院上報具體情形：
諸軍教閱，差將校逐日分番部押，其早教仍輪兵官一員巡按，每營置印曆，錄巡教官姓名，五日一赴州縣，張吏書押。州長吏時往提按點名，分隊教射。闕兵器者，於甲仗庫借支。每軍指占出戰或封椿者，亦聽權借，當日內卻還。拍試者準此。三路總管司，餘帥司躬親按視。非逐司所在，即轉運、提點刑獄司各據逐年應分巡州準此，遇按，仍取印曆檢察。每季舉行訖申樞密院。
對成績優異者進行賞賜，“諸監司按閱弓手，其武藝優異者，以銀楪子賞之。”所以開禧二年（1206），趙萬年守襄陽，“四圍鉦鼓震天鳴，虜騎平明盡逼城。萬弩應弦因退走，卻疑城上有神兵。”時任考工郎的李孟傳又建議改革訓練考核體製：“武舉及軍士比試，專取其力，臨敵難以必勝。唐世取人由步射、弓弩以至馬射，各以其中之多寡為等級，宜采取行之。”
各地駐軍依舊定時進行軍訓檢閱，劉過描寫了明州大閱情景：
書生燈窗困毛錐，說著刀劍何時持。忽聞殷殷金鼓震，驚起塊坐筋骸衰。國朝訓武重秋獮，列都敢不張其威。萬家軿首遮道看，我亦役逐人後隨。武夫櫜鞬陣整整，虎豹拏攫旌旗麾。人言吳兒盡脆弱，身發文斷勇未知。不見拔山昔項羽，何必燕趙士始奇。軍容燦燦生光輝，悲風慘淡殺氣怒。對此忽作邊頭思，熊羆不嘩曉爭出。萬騎馳突寒打圍，紛紛血毛腥原野。箭竹正墮驚鴻飛，將軍仰笑兵軍賀。金帛填委深溝池，十年文窮坐百拙。感慨一賦從軍詩。
紹熙年間，王阮知濠州，“請複曹瑋方田，修種世衡射法，日講守備，與邊民親訪北境事宜。終阮在濠，金不敢南侵。”
嘉定十一年（1218），宋寧宗命令江淮沿線正規軍及民兵嚴格訓練，“三衙江上諸軍並兩淮忠義、義勇、民兵，令主帥、製置司、郡守各嚴閱習。”顯示了弓弩訓練的良好效果。