所以三陰病都有其髒氣不足的內在原因，傷寒使其發病，是誘發因素，這就是病進。這時的治療，實際已屬內傷雜病的範疇，所以仲景定名為傷寒雜病論，後人分之。既言傷寒，仲景在這裏強調了一個特殊概念：一是其人陽氣不充足，發熱為局部性的，不會形成精血枯竭。因此雖發熱不死。二是地域多在寒冷地區。三是多在秋冬陰盛時期，因為陽氣不斷被損傷，所以總為寒證，陽氣不足。《傷寒論》全書就是以此為前提進行論述的。第六條太陽病，發熱而渴，不惡寒者，為溫病。對此作了嚴格的界定。至於其中列入了一些溫病，尤其是陽明、少陰、厥陰篇中較多，其目的是借賓定主，教人正確辨證施治，切不可憑概念用藥。人處東西南北，地勢有高低不同，體質有陰陽之異，飲食有寒溫之喜。臨床中，甚至每一個人，除了基本稟賦外，氣血、津液、精液及陰陽的變化在病理狀態下是不斷發生的，寒化、熱化是不斷轉化的，沒有界定。臨床醫生對此必須全麵理解才不會致誤。書中有些條款實際已屬溫病範疇，這是臨床中常見的，要完全避開是不可能的。凡陽氣偏盛，或津液、陰血不足者，被外邪所傷，陽鬱必從熱化，口渴、陽脈是其證候。治此不可單用辛溫之陽藥，使之再助陽邪而傷陰液，或陰陽俱亡。
所謂禁汗、禁火、禁炙者，原因雖多，其本質主要是這一條。傷寒以腎陽定存亡，溫病以腎陰定存亡。差別雖大，其來源並不是六淫性質決定的，根本在於稟賦及氣血、津液的多少。即使是傷寒病人，火劫傷津液太過，也會化為溫病。這裏雖然講的外邪致病，在外邪已解的情況下，內傷雜病的治療又何嚐不與此相同呢。各經中羅列了不少與外感病相似的內傷病，它們或為傷寒引發，或因此加重，其目的都是為了叫醫者正確鑒別。知此，知彼；知正，知反；知傷寒與溫病，與內傷的區別、聯係及轉化，才算掌握了《傷寒論》的機理。總之，著書者在理論上可分傷寒、溫病、內傷雜病。在臨床中，卻應以脈證為主，四診合參，辨證求因，審因論治；不可為理論上的流派所拘束，如此方為醫生。解《傷寒論》、讀《傷寒論》者，均不可囿於書中。
仲景原序
餘每覽越人入虢之診，望齊侯之色，未嚐不慨然歎其才秀也。怪當今居世之士，曾不留神醫藥，精究方術，上以療君親之疾，下以救貧賤之厄，中以保身長全，以養其身。但競逐榮勢，企踵權豪，孜孜汲汲，惟名利是務。崇飾其末，忽棄其本，華其外而悴其內。皮之不存，毛將安附焉！卒然遭邪風之氣，嬰非常之疾，患及禍至，而方震慄。降誌屈節，欽望巫祝，告窮歸天，束手受敗。齎百年之壽命，持至貴之重器，委以凡醫，恣其所措，咄嗟嗚呼！厥身以斃，神明消滅，變為異物。痛夫，舉世昏迷，莫能覺悟。不惜性命，若是輕生，彼何榮勢之雲哉。而進不能愛人知人，退不能愛己知己。遇災值禍，身居厄地，蒙蒙昧昧，惷若遊魂，哀乎趨勢之士！馳競浮華，不固根本，忘軀徇物，危若冰穀，至於是也。餘宗族素多，向餘二百，建安紀年以來，猶未十稔，其死亡者，三分有二，傷寒者十居其七。感往昔之淪喪，傷橫天之莫救，乃勤求古訓，博采眾方，撰用《素問》、《九卷》、《八十一難》、《陰陽大論》、《胎臚藥錄》，並《平脈辨證》，為《傷寒雜病論》，合十六卷。雖未能盡愈諸病，庶可以見病知源。若能尋餘所集，思過半矣。夫天布五行以運萬類，人稟五常以有五髒，經絡府俞，陰陽會通，玄冥幽微，變化極難，自非才高識妙，豈能探其理致哉。上古有神農、黃帝、岐伯、伯高、雷公、少俞、少師、仲文，中世有長桑、扁鵲，漢有公乘、陽慶及倉公，下此以往，未之聞世。觀今之醫，不思念求經旨，以演其所知。各承家技，始終順舊。省疾問病，務在口給。相對斯須，便處湯藥。按寸不及尺，握手不及足；人迎、趺陽三部不參；動數發息，不滿五十；短期未知決診，九候曾無髣!。明堂厥庭，盡不見察，所謂窺管而已。夫欲視死別生，實為難矣。孔子雲，生而知之者上，學則亞之，多聞博識，知之次也。餘宿尚方術，請事斯語。漢長沙太守南陽仲景撰。