曆時52天的決戰結束了，東北野戰軍的指戰員們實在太累了，11月3日，東野總部發布命令，讓全軍休整一個月，總結經驗，縫補軍衣，補充新兵，集訓俘虜，傷員歸隊，理發洗澡補睡眠，治病療傷擦槍炮，準備下一步新的戰鬥。
就在東北野戰軍休整期間，根據中央軍委11月1日發布的統一全軍編製及部隊番號的通令，東北野戰軍進行了整編。原來的12個主力縱隊改稱為軍，即：一縱改稱為中國人民解放軍第三十八軍，二縱改稱為中國人民解放軍第三十九軍，一直依次到十二縱改稱為中國人民解放軍第四十九軍。原來在長春起義的國民黨第六十軍，改編之後稱為中國人民解放軍第五十軍。原來的第一至三十六師依次改稱為第一一二至一四七師。按中央軍委的規定，每個軍都是三個師，根據東北的實際情況，經中央軍委批準，東北野戰軍的每一個軍都編入一個獨立師，這樣，東北野戰軍每個軍都是四個師，6～7萬人。與此同時，總部負責人也有所變化。為了讀者閱讀方便，現將全軍統一序列之後的東野編製與負責人排列於下：
司令員林彪。
政治委員羅榮桓。
參謀長劉亞樓，副參謀長曹祥仁。
政治部主任譚政，副主任陶鑄。
後勤部第一部長周純全，第二部長李聚奎。
後勤部政治委員陳沂。
炮兵司令部司令員（缺），政委邱創成，副司令員賈陶、蘇進、匡裕民，參謀長匡裕民（兼）。
炮兵縱隊司令員蘇進（兼），政委邱創成（兼），副司令兼參謀長匡裕民，副政委劉登瀛，政治部主任吳濤，副主任張誌毅。
鐵道縱隊司令員（缺），副司令員兼參謀長蘇進、李壽軒（後），政委（缺），副政委兼政治部主任何偉。
第一兵團司令員蕭勁光，政委蕭華，副司令員陳伯鈞，副政委兼政治部主任唐天際，參謀長解方。
第二兵團司令員程子華，政委黃克誠，參謀長黃誌勇。
第三十八軍軍長李天佑，政委兼政治部主任梁必業，副軍長兼參謀長曹裏懷，政治部副主任吳岱。三十八軍轄一一二、一一三、一一四、一五一師。
第三十九軍軍長劉震，政委吳法憲，副軍長吳信泉，參謀長王良太，政治部主任李雪三，副主任賀大增。三十九軍轄一一五、一一六、一一七、一五二師。
第四十軍軍長韓先楚，政委羅舜初，副軍長沙克，副政委劉西元，政治部主任卓雄。四十軍轄一一八、一一九、一二〇、一五三師。
第四十一軍軍長吳克華，政委莫文驊，副軍長胡奇才，副政委兼政治部主任歐陽文，參謀長李福澤。四十一軍轄一二一、一二二、一二三、一五四師。
第四十二軍軍長萬毅，政委劉興元，副軍長吳林，副政委唐凱，政治部主任郭成柱。四十二軍轄一二四、一二五、一二六、一五五師。
第四十三軍軍長洪學智，政委賴傳珠，副軍長楊國夫、李作鵬，副政委劉其人，第一參謀長雷震，第二參謀長黃一平，政治部主任鄧飛。四十三軍轄一二七、一二八、一二九、一五六師。
第四十四軍軍長鄧華，政委吳富善，副軍長曾克林，副政委兼政治部主任譚甫仁，參謀長高體乾。四十四軍轄一三〇、一三一、一三二、一五七師。
第四十五軍軍長黃永勝，政委邱會作，副軍長張天雲，參謀長黃鵠顯，政治部主任段德彰。四十五軍轄一三三、一三四、一三五、一五八師。
第四十六軍軍長詹才芳，政委李中權，副軍長楊梅生，參謀長袁淵，政治部主任王逸群。四十六軍轄一三六、一三七、一三八、一五九師。
第四十七軍軍長梁興初，政委周赤萍，副軍長方強，參謀長黃煒華，政治部主任孔石泉。四十七軍轄一三九、一四〇、一四一、一六〇師。