未知海域，原302鎮守府。
劉奕擦了擦頭上的汗水，又轉頭看了一眼身後茂密的叢林，心中不免有些無奈。
五天前，深海大型艦隊襲擊了這裏，整個鎮守府幾乎沒有幸存者，要知道每一個鎮守府在被攻陷後，深海都是要進行地毯式毀滅性搜索，對幸存者予以殲滅。
劉奕好不容易才躲過了搜查，從藏身處跑了出來。又回頭看了一眼平靜的海麵，終於長出了一口氣。
“艦娘建造完畢，請問是否進行下水儀式？”
一個毫無感情的機械合成音在他耳邊響起。
劉奕無奈，這才想起來先前發生的事情……
劉奕並非這個世界的原住民，他是從地球上穿越過來的。三個月前，他降臨到這個鎮守府中，並被一戶人家收留。
由此，他才得知了這個世界的大體情況。
實際上，不怎麼好……
真個世界由聯邦所控製，劃分為東南西北四大戰區，這裏屬於聯邦北部戰區北邊的未知海域。這個鎮守府是屬於前哨基地般的存在。
深海，是10年前出現在聯邦視野範圍內的，當時還沒有艦娘存在，人類自己生產的戰艦完全沒有任何還手之力，整個地球上的聯邦海域遭受嚴重的深海威脅。那黑暗的三年，被稱為威懾紀元，人類的所有海上活動被迫停止，連港口都找不出幾個完好的，大海上的一切信息都無法傳至內陸。慶幸的是，深海似乎對於陸地並不怎麼感興趣，也因此人類的陸地國家得以苟延殘喘……
在人類海域被快速侵蝕的三年後，一籌莫展的聯邦政府突然發現了一種生命體，可以有效的對抗深海威脅。她們的全稱為戰艦少女，簡稱艦娘，全部為女性，身上攜帶有神秘而強大的力量。
起初，她們是被在美國西海岸一次人類對深海反擊戰中，在聯邦海軍戰沉三支驅逐艦編隊後，這些神秘的少女突然闖出，指揮著她們完全是二戰甚至一戰時的戰艦，將那支將聯邦海軍打得抱頭鼠竄的小型深海艦隊全殲。至此，艦娘正式進入世人眼中。也就是從這時起，新紀元開始，這時，被稱為均衡紀元。
艦娘的相關信息被存入聯邦政府的中央數據庫，與此同時，指揮官這一艦娘的指揮團體也進入了政府高層的眼中。
經過長達十多年的發展，艦娘與統領她們的指揮官被合法化與正式化，一種新的體製由此誕生。
由指揮官統領，艦娘為主的鎮守府鎮守在海外各島上，負責巡邏並保衛附近海域航線，並對深海進行圍剿，確保聯邦航線安全完善。與此同時，聯邦則提供相應的物資援助，並負責建立海軍學院進行相應的培訓。
就這樣，整個地球生活回到了一個相對而言比較穩定的狀態。雖然海上時常打得不可開交，但是陸地上起碼還沒有太大的威脅。然而，上天似乎並不想讓人類就這麼安下心來……
大約在安定下來兩三年後，一個名為格裏芬的人工智能製造公司迅速崛起，成為軍工行業的大頭，而唯一的原因便是――他們研發出了當今世界上最強大的陸地戰爭機器，也就是――戰術人形。
戰術人形事實上是由單兵武器變化而來，基於艦娘的基礎之上研發而成。因此，戰術人形也都成為了女性角色，但這些並不重要，重要的是她們可以將武器發揮到最大威力，一把ak47可能在一個士兵手裏隻有5點傷害，可在人形手裏卻能打出50甚至100點傷害。
正當人類為此歡欣鼓舞之時，來自另一家人工智能公司卻傳來了極為不妙的消息……
那家名為鐵血的人形製造公司因為生產流水不當，導致所有人形失控暴走，工廠脫離控製，並對人類發起了大規模襲擊，鐵血也因此倒閉關門，總部被失控人形血洗。
至此，人類不得不委派格裏芬及其旗下人形指揮官進行協助防衛，雙方在廣袤無垠的大陸上展開了生死廝殺……