公元207年。
曹操頭風病大犯，疼痛使之終不得安，眠不成食不進。聞華佗能治百病，天下人稱之神醫，再者三年前華佗為陳登看病預言陳登之病定會在三年後再次複發而亡，果如他所言陳登印時而死。陳登為曹之親信，他之病印證了華佗的醫術之精。曹操逐請人招之。
華佗被招入曹營為曹治病，此後便常伴曹操身邊，每至曹犯頭風病時便用針紮之，針畢痛除。
午夜十分，大多人已經息下，唯有一見小屋仍投出暗淡的餘光，時有歎息發出。
咯吱一聲門被推開，隻見一老翁人在燈下研磨藥材。
“老師深夜未眠，為何事歎息？”藥童至屋裏，見華佗愁眉不展，便也添了幾分哀婉。
他自知老師生性古怪，喜愛四海為家為人治病，可是如今卻被困曹營，便如駿馬失去了草原。
“夜深人靜，思鄉之情意更濃也。”華佗未抬頭，又一長歎。
藥童機靈一動曰：“老師何不借夫人染疾為由，回家探病。”
華佗采之，翌日便以此由向曹操請辭，曹為安其之心，準其歸故探病。可過了多時佗未歸，令人再三去請，仍不得果。曹大怒，令人捉佗囚之於許縣，要誅之。
荀彧乃曹手下重臣，因陀醫術高明，救人無數，敬之。於是進諫勸曹不要殺陀，曹不聽言，勢必誅之。
微暗的燈火，在牢獄中輕輕的跳動，華佗端坐亂草堆中，俯首於案前，奮筆疾書。經三夜未眠未休他終於將一生的醫技醫德簡略記錄下來。
他自知活不過第二日，這一切都是由於他的孤高，不把曹賊的淫威放在眼裏，錯在己也，如今命已定，他並無大憾，隻憾一身醫技沒有得到承傳。
“吃吧，好好的飽吃一頓，明天上路也不必餓著。”牢頭將飯菜放在華佗麵前，麵無表情的說。
華佗未言，端起飯菜食不知味，想不到事情果然如他所料，隻可惜在他死前沒有機會再見除了牢頭以外的人，所以他決定將醫書交給牢頭。
華佗衝這正在打盹的人叫道：“官爺。”
那人立刻至夢中驚醒，左顧右盼，很不耐煩的走了過來。“什麼事。”
華佗從牢獄的柵欄裏遞給他一本小冊子。“這本小簿子你拿著吧，它可以救人無數。”
那膽小的牢頭知道華佗是因為得罪了曹操，才被處死，怕惹禍上身，拒絕了，他的好意。
華佗難過之餘，兩眼含淚，焚之。
“先生使不得。”正在這時荀彧突然出現在獄中，阻止了他，從而使得華氏醫技得以留傳。