當然，這些加起來，也比不上他們一路下降之後，穿出隧道時候看到的景象來得震撼。
“哦……真的是地下都市啊……”
淡金色的光輝裏，一座深埋地下，卻廣達上百平方公裏，遍布著植被、水係和超現代建築的半球形都市，展現在了少年麵前。
“這就是我們的秘密基地，nerv的總部，重建世界的關鍵，人類的要塞。”葛城美裏帶著自豪的聲音，是這樣介紹這座城市的。
地下城市雖然廣闊，不過表麵建築並不多，最特殊的就是位於空間正中那個如同金字塔般的金屬簡直，以及其緊靠著的倒立金字塔形的大水池。
無數蜘蛛網一樣的通道從上方的天頂周圍蔓延下來，最後彙總成幾條幹路，通入這座金字塔裏。
當然，這隻是表麵而已，包括了廣袤森林和河流的半球形空間，不過是這個巨大建築體係的休閑花園而已，在這個地下空間的下方，隱藏著數倍於此空間的建築群落，那才是用來作戰的要塞。
大約二十分鍾之後，葛城美裏和碇真嗣才七拐八拐地深入到了基地的內部，並被一位自稱叫做赤木律子的金發女學者指引，一路坐著氣墊船來到了一座上百米高，幾平方公裏大，充滿了深不見底的紅色水域的倉庫裏。
之後，赤木律子和葛城美裏帶著碇真嗣，穿過這個倉庫盡頭的自動門，進入了另一個黑暗的空曠艙室。
黑暗中，赤木律子的聲音傳來：“碇真嗣君，有些東西希望讓你看一下。”
隨即，燈光亮起。
少年抬頭看去，映入眼簾的，是一個猙獰的巨大金屬頭顱。
這個帶著獨角和外露牙齒的紫色頭顱，足有三四層樓高，雖然明顯是金屬構造的，看上去卻絲毫沒有“機器人”的感覺，反而讓人覺得是什麼遠古猛獸的鐵麵具一樣，即使寂靜地擺在那裏，也給人一種恐怖的壓迫感。
“人造的究極泛用人形決戰兵器，人造人類——evangelin——之初號機，我們人類最後的王牌。”赤木律子用幾乎沒有情感的聲音介紹道。
“這也是我父親的工作？”碇真嗣問道。
“是的……”答案不是來自金發或者紫發的女子，而是來自巨人頭顱的上方，少年順著聲音再次將頭抬高，才看見那個居高臨下俯視著自己的中年男子，那人擁有著和少年近似的五官，不過更加陰鬱，好在連腮的胡子為他增添了幾分威嚴。他帶著意味深長的表情，對著少年說道：“好久不見。”
“父親……”少年低聲突出了這個名詞。
站在那裏的，正是他三年未見的父親——碇原堂。
三年的分別之後，這位父親給兒子的第二句話，是……
“出擊！”
然後，在身邊兩位女性的三言兩語之間，碇真嗣才真正明白了父親的意思。
“要我駕駛這個巨大的東西，去和外麵的那個巨人作戰？”
之前看到n2地雷那場超級爆炸之後，少年完全沒想過會有什麼東西可以在那樣的攻擊下幸存，即使是那恐怖的綠色巨人也一樣。然而不久之後，他卻在旁聽葛城美裏的電話的時候，得知那被命名為第四使徒的綠色巨人，在爆炸中僅僅被灼傷了表皮，本體毫無損失。（tv版裏的第三使徒水天使，在劇場版裏降格為第四使徒，因為原本的第八使徒胎天使被提前挖掘出來，頂替了第三使徒的位置，成為了冥河天使。）
……這是何等強大的怪物……
一瞬間，由於脫離了真實感，少年陷入了失語的境地。
……讓我出擊？太荒謬了……
……和那種怪物作戰？這算什麼命令……
……迎戰怪物，那是軍人的事情……
……這東西沒有專業駕駛員嗎？為什麼會找我這種中學一年生……
……半分鍾以前才告訴我什麼evngelin（而且我還完全沒有聽懂），然後就要我出戰……
……太荒謬了，父親，美裏小姐，赤木博士，你們在想什麼……
不過，比起這種荒謬感，更讓少年在意的，是他自己聽到這個命令時候，內心產生的反應。
……我應該害怕才對吧？……
……那種單槍匹馬挑戰軍隊，在無數炮火下毫發無傷，核彈都炸不死的大怪物，即使我能駕駛這個什麼eva的大家夥，也不可能取勝吧……
……失敗了，就會死掉，絕對沒有幸免的機會……
……麵對這樣的危機，為什麼我卻沒有絲毫恐懼呢？唯一的情緒，反而是……
……憤怒……
驀然，少年抬起頭，問道：“您叫我來，就是為了這件事？為什麼……一定是我？”
碇原堂冷然道：“是的，因為別人做不到。”
“也就是說，父親，您花費了十幾年時間，遠離家人，投入了不知多少億的經費，聚攏了成千上萬的工作人員，建造了這麼龐大的地下都市和巨人，等到交戰的時候，卻發現沒有培養出足夠的預備駕駛員？”少年的聲音裏帶著憤怒，以挑釁般的語氣說道：“還是說，這東西不是什麼‘泛用兵器’，而是您為我量身定做的大玩具，除了我，沒別人能使用它？”
被稱為父親的人，皺起了眉頭，以正常父親絕不會有的語氣說道：“eva是怎樣的兵器，你可以自己閱讀說明書，你要駕駛就坐上它，否則從哪裏來就回哪裏去。”
父子二人陷入了沉默，不過少年沒有低下頭，也沒有因為恐懼而顫抖，反而倔強地和父親對視著。
十幾秒之後，爆炸聲和震動打斷了對峙。
被稱為使徒的綠色巨人，已經治好了被n2地雷炸傷的軀體，突入到了第三新東京市的市區，並以不知何種原理的探測，找到了地下都市的位置，直接射出十字形的光炮進行打擊。
第一炮打在外圍，掃平了大片地表城區的樓群，卻隻是震動了地下都市，不過對方第二炮已經轟擊到了城市的表層裝甲，不過沒有找準方位，隻是破壞了邊角，引發了大火。
碇原堂收回了對峙的目光，轉頭向著身邊的屏幕下令————
臨時更換駕駛員，把之前出擊受傷的，名為“麗”的駕駛員送過來。（在漫畫版裏，碇真嗣見到葛城美裏之前，綾波麗已經駕駛初號機出戰過了，但是被擊敗，自身也受了重傷，所以之後才以繃帶裝出場。在劇場版裏，開篇時候紅色山坡上的巨大人形白圈，暗示了這場戰鬥的發生。）
敵人已經近在咫尺，自家兒子卻忽然爆發叛逆期，作為基地的司令，自然需要有所取舍。
隻是不知為何，碇真嗣總覺得自己能從父親低沉的聲音裏，聽出一種陰謀的感覺。
片刻之後，另一邊的自動門打開，三個醫護人員推著一張白色救護床趕了進來，床邊還架著輸液杆，顯然躺在床上的人依舊處於危險狀態。
病床和少年擦身而過，碇真嗣看清了那床上躺著的女子。
淒豔。
這是他瞬間唯一的感覺，一種不可名狀的感覺從少年心中彌漫開來。
床上躺著的，是一個大約十三四歲模樣的清秀女孩，卻有著一頭帶著淡藍色澤的白發，病態般的蒼白肌膚，和晶紅色的奇異眼瞳，仿佛不是人間的生物，而是來自夢境的精靈一般詭麗。
她的右手似乎是已經骨折，打著夾板裹著厚厚的繃帶，左手腕、額頭和左眼也同樣被繃帶包裹著，不知傷到了哪裏，靜靜躺在病床上，顯得格外單薄嬌弱。她身上穿的卻不是一般病人適用的寬鬆病服，而是一套怪異的無袖白色緊身衣，將少女剛剛開始發育的玲瓏身材完全勾勒了出來，但在那緊身衣下，也隱隱露出了許多繃帶包紮的痕跡，顯然她的傷勢不隻是外表顯出的那些。
不過，比起外貌而言，真正另少年心悸的，是她晶紅眼瞳中，那空洞到死寂的沉靜。
……為什麼？明明已經傷到這個地步，還要被派出去送死，眼中卻沒有任何驚慌、恐懼或者怨恨呢……
當疑問劃過少年心頭的時候，使徒的第三次炮擊再次到來。這一回，對方已經找準了位置，一擊打在金字塔的正上方，奇異的光束直接貫穿了地下都市上層的二十幾層裝甲防護，炮火餘波不止，更湧入地下空間，在金字塔上方，綻開了一個巨大的光芒十字架。