三、以生物來說是演化，以同體來說是緣起（用）
在《觀念生物學》一書中提到，約莫三十八億年前，海底誕生了第一個細胞，由於這個細胞不斷的演化，形成今日多樣性的物種。可以說，追本溯源，現今地球上所有的物種都是來自於這個細胞，因此在顯微鏡下，所看到的魚類、兩棲類、爬蟲類、鳥類、哺乳類的胚胎，早期發育幾乎長得一模一樣。達爾文的《物種源始》提到，所有生命有一個共同起源，經過不斷地變化、分支、淘汰，和由簡至繁的演化，生命才越趨複雜，而人類則是一個極致表現。
在漫長的生命演化史上，物種不斷地存在、滅絕，目前存在地球的物種約有三千萬之多，每一個物種又和其他物種相關聯，無法單獨存在，例如：植物靠昆蟲來傳播花粉，它們也成為昆蟲和其他動物的食物；當然，如果能如《賢愚經》所說的“如蜂采華，但取其味，不損色香”，就是動物與植物最美妙的相處方式了。魚兒在水中覓食，同時也成為其他動物的腹中物；幸而魚能產卵，數量之多，難以估計。萬物是如此相依相存，形成一個巨大的生物圈。
三十八億多年來，由最初的單一細胞，隨著環境的變遷，演化到今日有三千萬個的多樣物種，雖然生物圈的變化是如此巨大，但總不出二千五百年前佛陀所言“一即一切”、“多從一有”、“法不孤起，仗境方生”的因緣法則。
生命的密碼展現在用上，以佛教而言是緣起。世間的萬事萬物，既非憑空而有，也不能單獨存在，必須種種因緣條件和合才能成立。一旦因緣散失，事物本身也就歸於烏有，這種說明“諸法因緣生，諸法因緣滅”的因果定律，稱之為“緣起”。
緣起是佛教的根本教理，也是宇宙人生本來的、必然的、普遍的理則。當初佛陀在菩提樹下金剛座上，夜睹明星，證悟成佛，他所證悟的就是緣起法。緣起法表現在有情生命的流轉上，稱為“十二緣起”；表現在世間事事物物的生成上，則稱為“因緣所生法”。
所謂“十二緣起”是指：有情眾生由予累劫的“無明”煩惱，造作各種“行”為，因此產生業“識”。隨著阿賴耶識在母體子宮裏漸漸孕育成生命體，是為“名色”；名是生命體的精神部分，色則指物質部分。數月之後，生命體的眼、耳、鼻、舌、身、意六根成熟，稱為“六入”；胎兒脫離母體後漸漸開始接“觸”外境，並對外界的苦樂感“受”，產生“愛”染欲望，進而有了執“取”的行動。結果由於身、口、意行為的造作，又種下了後“有”的生命體。有了“生”終將難免“老死”，“死”又是另一期生命的開始。所以，生命的流轉是無始無終的生死輪回，而十二因緣正是有情眾生生死流轉的根源。
如何才能跳脫生死輪回，得到解脫？唯有泯滅生死根本的“無明煩惱”，“無明滅則行滅，行滅則識滅，識滅則名色滅，名色滅則六入滅，六入滅則觸滅，觸滅則受滅，受滅則愛滅，愛滅則取滅，取滅則有滅，有滅則生滅，生滅則老死憂悲苦惱滅”，如此才能究竟解脫。
宇宙中一切事物都是相依相成，眾生之間也具有同體共生的關係。我們每個人能在世間生存，必須依靠眾多的因緣，例如：父母的生養，家人的照顧，師長的教導，朋友的幫助，長官的提攜，大眾的服務，社會的供給，政府的保護等等。事實上，不隻是人與人之間，就是人與物、人與境，也都是同體共生、互為因緣。以全球暖化為例，由於人類大量使用化石燃料，製造過多的二氧化碳，致使地球溫度升高，南北極冰川融化，海平麵上升，陸地淹沒，氣候變化，天災增加，生物麵臨生存的危機，而人又怎可能幸免於難呢？反之，我們如果能夠減少使用石化燃料，降低二氧化碳排放量，可使地球暖化稍獲抑製，對於全球生態的好處多多，對自身的生存，又何嚐不是有所助益？