“好，我們到了，是夢違地區哦。”
“MIU~~~”
從飛雲市出發——跨越“合眾”地區的地盤線24號水路，坐在黑色龜殼上的包子頭少女以期待的眼神望著大海對麵那具有濃厚現代氣息的城市，趴在少女肩膀上的長著葉子般耳朵的棕色精靈也興奮的叫了幾聲。
她的名字叫芽衣——挫敗了合眾最大精靈犯罪組織“等離子團”的訓練家。
巨人洞穴的戰鬥已經過去兩個月，在這段期間裏她挑戰了合眾聯盟的四天王和新任聯盟冠軍艾莉絲，最終通關。不過因為自身還有著紫衫博士的委托而辭去了聯盟冠軍的職務成為合眾地區任期最短的聯盟冠軍。【一周目通關】
一個月後，被等離子團所破壞的城鎮逐漸恢複了過去的光輝，芽衣也來到了等離子團的“王國”——N的城堡，在索羅亞克的引導下芽衣與N相遇並了解了他的過去。在戰勝N後，N引導芽衣得到了傳說中的精靈“捷克羅姆”所化身的黑夜之石。【二周目劇情】
又過了一個月，完成精靈圖鑒的芽衣興高采烈的來到了紫衫博士的精靈研究所，
“我看看……合眾地區遇到的精靈數量是301。好厲害！好厲害！！你收集了合眾地區所有精靈的資料！真是恭喜了……對了，你有沒興趣去夢違地區走走？”
於是在紫衫博士的推薦下，芽衣踏上了大海對岸的夢違地區，不過由於夢違地區氣候與合眾不似，芽衣把她所收服的精靈留在了家中。
本來隻打算帶渡海用的肋骨海龜，不過從鬆露那得到的伊布所進化的葉精靈也堅持跟了過來。
[葉精靈果然是跟著你跑了，因為一直找不到啊。]
來到夢違地區的精靈中心，在電腦對麵的小女孩鬆露送了一口氣。
“所以我現在隻能帶上葉精靈一起旅行了，抱歉讓你擔心啦。”
“MIU~！”
[是嗎，那麼我先幫你把葉精靈的精靈球傳送到岡崎大學好了。]
“真是謝謝你了鬆露。”
結束了通信，芽衣從重要道具口袋中拿出了紫衫博士給的便條。
“那麼，夢違地區的旅行就正式開始了！”
在舒展身體的同時，剛剛還很疲勞的肋骨海龜也恢複了精神。在這裏不知道會遇到怎樣的精靈……對了這裏會有道館和聯盟大賽嗎？
芽衣開始想象在夢違地區會遇到怎樣的人，會發生什麼事而無法自拔的時候，重要道具口袋中的某樣東西開始震動，或者應該說開始躁動起來。
暗夜之石？怎麼會在這種時候……
從口袋中取出的暗夜之石發出細微的光芒，像是要引導芽衣一樣，芽衣的大腦在某個人……大概是“捷克羅姆”的指示下對大腿下達了命令，穿過繁華的城市後在高而陡的石梯前停了下來。
“這裏是……神社嗎？”
以前在書中看過，在一些地區中崇奉與祭祀神道教中各神靈的社屋，像是合眾地區也有鎮子會放有古代精靈的銅像。
“這裏是博麗神社哦。”
“？”
芽衣朝著身後的聲源望去，站在那的是一個穿著很有中式風格，手中卻拿著西洋大陽傘的金發美少女。
“博麗神社？”
“一個沒什麼名氣的神社，不要太在意。”
成熟豔麗的氣息讓芽衣窒息，望著她的眼睛仿佛就會被吸進去一樣。
“你是外地來的？”
“……啊，是的，我叫芽衣，合眾地區的精靈訓練師。”