一、微生物
（一）微生物的定義
微生物（microorganism）是一切肉眼看不見或看不清楚的微小生物的總稱。微生物種類繁多、形態各異、營養龐雜，但都表現為簡單、低等的生命形態；微生物包括非細胞型微生物、原核細胞型微生物和真核細胞型微生物。
（二）微生物的特點
1.個體微小、結構簡單
微生物形體微小。觀察微生物必須借助於顯微鏡甚至電子顯微鏡，將其放大幾千倍至幾十萬倍。測量微生物需用測微尺，細菌以微米（μm）為計量單位；病毒以納米（nm）為計量單位。
微生物結構簡單。大多數微生物是單細胞生物，一個細胞就是一個生物個體。病毒由核酸和蛋白質組成，沒有細胞結構；亞病毒僅由核酸組成；朊病毒則僅由蛋白質組成。
2.代謝活躍、類型多樣
微生物代謝活躍。由於其個體小，比表麵積大（細菌表麵積大約為12m2/g幹重），微生物能從環境中快速攝取各種營養物質，並將大量代謝產物排出體外。例如，乳酸杆菌每小時產生的代謝產物（乳酸）可多達其體重的1000至10000倍。
微生物代謝類型多樣。①基質廣泛。既能利用無機物（二氧化碳），也能利用有機物作為碳源。②能源譜寬。既能利用太陽能，也能利用化學能作為能源。③適應性強。既能進行有氧呼吸，也能進行發酵或無氧呼吸。④代謝產物多樣。既可產生無機產物，也可產生有機產物；既可產生小分子有機物，也可以產生大分子有機物。
3.繁殖迅速、容易變異
微生物繁殖很快。生長旺盛時，有些細菌每20min就能增殖一代，24h可增殖72代。如果沒有其他條件限製，經過一晝夜，1個細菌就可增至47萬億億（4.7×1021）個。若設1012個細菌的幹重為1g，則在1天內，生物量將從10-12g增加到4.7×109g。
微生物容易變異。每一世代，細菌出現自發突變的頻率約為10-6（即在100萬個細菌中有1個發生基因突變），液體培養中的細菌濃度可達108個/mL，這意味著在每毫升培養液中，就有100個細菌發生基因突變。
4.抗逆性強、休眠期長
微生物抗逆性很強。高溫菌可在2.65×107Pa和300℃的高壓高溫條件下生活；嗜酸菌可在pH 0.5的強酸性條件下生活；嗜鹽菌則可在鹽濃度30%以上的“死海”中生活。
微生物休眠期很長。在不利條件下，微生物可進入休眠狀態，有些種類形成特殊休眠體（如細菌芽孢）。據報道，有些細菌芽孢在休眠幾百甚至上千年後仍有活力。
5.種類繁多、數量巨大
微生物種類繁多。它包括病毒、細菌、古菌、放線菌、真菌、藻類和原生動物等類群。據估計，微生物種類數目約為50萬～600萬種，有記載的約為20萬種（1995年），其中病毒4000多種，原核生物3500多種，真菌9萬多種，原生動物和藻類10萬多種。
微生物數量巨大。在溫度和濕度適宜、養分豐富的土壤耕作層中，每克土壤的微生物含量高達數億個。
6.分布廣泛、分類界級寬
微生物分布廣泛。在自然界，不論是土壤、水體和空氣，還是植物、動物和人體的內部或表麵，都存在大量微生物。上至8萬多米的高空，下至3000多米的油井；冷至南北極地，熱至幾百攝氏度的深海火山口，都有微生物蹤跡。
微生物的分類界級很寬。在反映生物係統發育的三域分類係統中，微生物包含了細菌域和古菌域的全部生物，以及真核生物域的部分生物。
（三）微生物的分類、鑒定和命名
由於微生物種類繁多，為了便於各類微生物的識別、研究和應用，有必要對其進行分類、鑒定和命名。
1.微生物分類
分類（classification）是根據一定原則對微生物進行分群歸類，把相似或相近的微生物放在一個分類單位中。從大到小，微生物的分類單位依次是域（domain）、界（kingdom）、門（phylum）、綱（class）、目（order）、科（family）、屬（genus）、種（species）。在主要分類單位之間，還經常加進次要分類單位，如亞門（subphylum）、亞綱（subclass）、亞目（suborder）、亞科（subfamily）、亞種（subspecies）、變種（variety）。