太元紀2000年，達到社會發展頂峰的人族為滿足日益增長的人口和物質需要，大肆砍伐破壞原始森林，興建工廠，發展極端科技，並源源不斷的製造出了各種汙染源。
過分的擴張和發展甚至侵犯到了慣於生活在原始生態環境中的魔族領地。這些魔人平日靠納取各種動植物純潔的生命精華為生，過著隱世的生活。然而這次，他們被人族魯莽自私的行為激怒了，在魔帝幻曦君的帶領下，魔人不惜撕毀與人族幾千年來定下的“互不戰契約”，向人族宣戰。
大戰初，麵對身懷異能魔族軍，過分依賴科技武器的人族潰敗如流，人族領地大量喪失。幸而魔族是個“少數民族”，盡管魔力無窮，但畢竟魔人數量稀少，因此當魔族勢如破竹地攻陷了人族三分之二的領土後，戰爭的腳步便放慢了。
得以喘息機會的人族，生產和科技都遭到了嚴重的打擊，人口急劇下滑，社會治安紊亂，各地都出現了為搶奪生存資源的暴民和武裝軍，呈無政府狀態，瀕臨滅族的邊緣。
這時，一個叫呼延庭的人出現，他號稱太元曆創始者的後人，繼承了“金、木、水、火、土”五大元靈的能力，並修煉有強大法能等級。他帶領他的五個弟子在短短的兩年內鍛煉出了一支500人的異能軍，後人稱“征魔軍”。
與此同時，占領了人族領地的幻曦君，一麵在追擊人族，一麵帶領魔人在新的領土上進行生態改造，恢複森林並種植各種魔族植物。可他萬萬沒有想到的是，盡管已毀滅了一切可見的科技和人造物品，但這塊新奪的領土上仍殘留了各種致命的汙染源，而且並不能像他想象中那樣易於淨化。慢慢地，新長出的植物被汙染了，魔人納食了被汙染植物的生命精華，雖不足以危及魔人性命，卻在不知不覺中異化了大部分魔人的習性，他們開始變得凶殘、好戰、貪婪和嗜血……原本純淨的魔族內部漸漸出現了分化。
太元紀2005年，由呼延庭親率的一小支征魔突擊隊，在叛變的魔人帶路下潛入幻曦君寢宮，他們召喚出五大元靈，結成“五極封印”。幻曦君就這樣在睡夢中一絲未掙紮地被永久封印了。
失去了帝王的魔人，沒有了向心力，更不再團結。征魔軍乘勝追擊，終於將魔族人如數趕回了老家。
人族終於重返家園。然而，由於戰爭的破壞和魔人對人族勞動結晶的刻意損毀，使得生產力發展水平嚴重倒退，能源和資源緊缺，四處狼藉。幸而有呼延庭的弟子想盡千方百計，不畏勞苦艱難，率領各地百姓重建家園。人族慢慢地發展起來，地並陸續成立了多個國家。
叛變了的魔人，接受了呼延庭的洗禮，洗去了魔性和異能，留在了人族的領地，獨自成立了一個小國——“幽”。同時呼延庭為了保護“幽”，定下了人族永不侵略“幽”的契約，並保留了當中異能最強的納蘭銘德和齊莨二人的異能以守護“幽”。
之後，呼延庭銷聲匿跡。