不過，南京政府不比北京政府，“司法獨立”已經成了一黨專政時期的蒙人幌子。因此，陳獨秀還是被判有期徒刑十三年，經上訴後改為八年。曾從莫斯科跑到土耳其見過托洛茨基的彭述之，與他同刑期，其他同案犯各領刑五年和兩年六個月。
就在陳獨秀服刑期間，在大西南的遵義城內的一幢黔省軍閥的棄樓裏，被蘇聯人指派擔當中共領袖的那幾個從莫斯科回國的後生們，已經被毛澤東聯絡張聞天、王稼祥等人轟下台來，中國共產黨自此開始走上了陳獨秀所向往的獨立自主的道路。
連蘇聯人都不知道中共核心層發生了如此之大的變故，更遑論獄中的陳獨秀！
說到這會兒，該說說陳獨秀的個人問題了。
民國九年（1920年）從北京回到滬上後，陳獨秀與第二任夫人的關係也未恢複到昔日在杭州時的融洽，後來竟不在家住了！高君曼不得不帶著兩個子女去了南京。陳獨秀在那裏購置了一處麵積挺大的空地，出錢蓋了幾間房子，讓高君曼帶著兩個孩子住到了那裏，每月三十元的生活費，由上海亞東圖書館的老板汪孟鄒寄去，再將此錢從陳的版稅裏扣除。
鐵石心腸的陳獨秀甚至沒給前後兩位高夫人送終，高家姊妹先後在南京與安慶謝世時，他都沒到場，都是親友幫助料理的後事。前麵說了，他連一首懷舊的韻句也不肯留下，盡管他留給後人不少非常有功底的舊體詩。
高君曼走了，成為中共總書記的陳獨秀成了無拘無束的男人。民國十五年（1926年）的一個多月裏，他居然失蹤了！黨內所有的人，包括單線與他聯係的黨中央秘書兼會計任作民都不知道他的下落，連其長子、中共廣東區委書記陳延年前來黨中央彙報工作時，也見不上當總書記的老爹一麵。任作民隻能以暗語在報上刊登了尋人啟事，卻仍未有回音！於是，大家悲痛欲絕，都以為領袖已慘遭反動軍閥的暗算。
萬不料，就在陳延年離開黨中央機關去往客輪碼頭以後，捂得嚴嚴實實的總書記卻出現了！
陳獨秀一臉輕鬆地告訴同誌們，前段時間，他因患傷寒病住院了，見了報紙上的尋人啟事，就來了。
在哪家醫院住過？出院後又住在哪裏？有人服侍嗎？麵對同誌們的詢問，“老頭子”卻不再言語—盡管彼時陳獨秀隻有四十七歲，但中共早期重要幹部都是二三十歲的年輕人，所以他們當麵稱總書記為“老先生”，背後卻全都昵稱為“老頭子”。倒也是啊，你想，連他大兒子
陳延年都已經二十八歲了，他能不老嗎？有人在黨的會議上記錄陳的講話時，幹脆隻寫一個“老”字。
對了，趕緊派人叫回已經登船的陳延年同誌！就這樣，陳延年才見到了本以為已橫遭不測的父親。
那時，已經有人隱約知道陳獨秀似與一位神秘女士同居，但那位女士姓甚名誰，卻從來沒有人知道。若想打探總書記的口風？嘿嘿，老頭子鬼著呢！愣是不肯向小夥子們泄露片言隻語！
直到半個多世紀後，深得陳獨秀信任的原中共中央出版部部長鄭超麟才意外地獲知，那位女子叫施芝英，是一名有地位有身份的青年醫生。但大夥兒不知道的是，這位施醫生是何時出現在“老頭子”生活中的。是否與前陣子老鬧胃病的老先生頻頻去醫院看病有關？高君曼帶孩子離滬是否與此事有關？他和她在一起多長時間了？為什麼最終沒走到一起？這一切，因追隨陳獨秀而受盡磨難的鄭超麟老人，與他同時代略知此事的極少數黨內同誌一樣，永遠不知道了！
施芝英與陳獨秀的地下戀情，隱瞞得實在太久！直到半個多世紀後的中共十一屆三中全會召開後，才得到確認。起因是有在新疆工作的兩男一女向中共中央寫信，稱他們是陳獨秀的外孫，因為三人的母親陳虹是陳獨秀與其外婆施芝英所生的唯一女兒，但其母與外婆已經先後於“文化大革命”前後病故，請求落實政策，雲雲。中央遂安排有關部門調查落實，查明陳獨秀在上海期間確曾與一位叫施芝英的女士同居數年。但原在上海電影製片廠工作的陳虹與陳獨秀並無親緣關係。早在1937年9月，陳獨秀出獄後，就對到漢口找過他求助的陳虹說過：“你不是我女兒，你是你母親的養女。”在那個時代，養女通常是花錢買來的使喚丫頭。當時的國民黨報紙還曾借機譏諷前中共領導人是“屙屎不揩屁股”。
據說，施女士一直住在上海的某條弄堂裏，丈夫先她而亡。有與她為鄰的老太太在她家中見過掛著的女主人年輕時的大幅照片，是一位相貌美麗且氣質高雅的美人。據有心人考證，施女士也是安徽人，比陳獨秀小二十二歲。人們考證不出的是：她與中共最高領導人長期秘密同居，知道這位老病人和老情人的真實身份嗎？最後為何分手以致陳獨秀沒了住處？她嫁了別人以後能把真情告訴丈夫嗎？但可以肯定的是，她把一生中最美好的年齡段的一段戀情，告訴過養女陳虹，而陳虹又傳講給了自己的兒女們。於是，這才有了思想大解放時期的那次信訪與調查。
陳獨秀從神秘女人那兒搬出來後，倉促間擠住在年輕的同誌家中湊合，後又找了住處搬了出去。某次，鄭超麟去那幢秘密住處時，意外撞見“老頭子”屋裏竟有一個舞女模樣的人！陳獨秀難耐寂寞又一證也。
被中共開除後的陳獨秀，依然待在上海。盡管已年近半百，他又把後樓鄰居的一個二十歲的小女子潘蘭珍發展為生活伴侶。見過潘氏的人稱，潘很摩登，是“七分人材，三分打扮”的時尚女性（這很容易讓我們想起當今上海的年輕女子）。陳獨秀麵對比自己小二十九歲的小潘，倒是堅持組織原則，一直沒告訴人家自己的真實姓名與身份。直到某次兩人吵架，小潘一氣之下跑回浦東娘家住了一個多月，有一天突然從報紙上看到了被捕的“共黨魁首”照片時，才極為驚愕地獲悉：原來，夫君即那個久被國民政府通緝的大名鼎鼎的共黨領袖陳獨秀！
你說，像陳獨秀這樣的大思想家，這樣不肯為世俗改變自己的奇人，和哪個女人能有長久的共同語言？莫道“舊派女人”大眾女士高曉嵐最終被棄，就是在京受過高等教育的“新女性”小眾女士高君曼不也一樣嗎？更何況之後的那個連大字也識不得幾個的像女兒一樣的潘蘭珍呢？
對了，陳與潘的結合曾令他的“托派”同誌大惑不解，他們背地裏議論“為何此女願嫁老倌，更驚歎陳獵豔技術之高明”（濮清泉語）。罷！罷！莫以俗念論英雄，燕雀安知鴻鵠心？陳獨秀乃時代之超人，曠古之狂才，哪裏是傳統道德觀念所能旌表的良人？
因失去自由，陳獨秀結束了對異性的追求史，上海英美煙廠女工潘蘭珍成了這位總是駭世驚俗的人的愛情終結者。
潘氏從來沒得到妻子的名分——陳獨秀對最親近的人也隻稱潘為“女友”，而且，潘氏長年不識郎君真麵目。按說，被騙也久，幽怨深矣！況且家裏被抄，私物盡失，何不借機離去？可這位時髦少婦，偏偏忠貞感人，不顧陳的勸阻，頻繁趕往南京探監，後幹脆從上海搬到南京租一處陋室住下，以便每天白天進獄中照料陳獨秀——對外就稱她是陳的“學生”，可見陳氏人格魅力確實非凡。
而受到南京模範監獄優待的陳獨秀也真叫“本色”，盡管身陷牢獄，卻依然精力充沛，不光讀書看報賦詩題字，而且還頻見訪客，當然見得最多的是潘“學生”。潘氏被特許天天入監送飯並照顧陳獨秀，朝九晚五，像上班一樣。於是，老夫少妻相逢，便有了極為罕見的“獄中春景”被看守窺見。典獄長聞報後，左右為難，隻得把陳的同案兼親戚濮清泉提來，大發牢騷：“陳先生近來忘了他是在坐監，把我們這裏當做旅館了。此事傳出去，豈不要叫我同他一樣坐牢嗎？”末了，這位先前崇拜過陳獨秀，“以為他的道德文章可以做青年模範”的“黨國”牢頭大為感慨：“現在看來，陳先生文章雖好，道德有限。”而陳獨秀聽到濮的相勸後，竟“毫無赧顏”地反問道：“難道我不能有個伴侶嗎？”
喏！這就是陳獨秀，一個我行我素，絕不肯委曲自己的偉丈夫！