道生一，一生二，二生三，三生萬物。自宇宙誕生以來源生界由於其特殊的位置，為各個平行世界所必爭之地，每個文明都在源生界留有自己的曆史，他們都認為源生界是其他六大界的主世界，就如同六大界均有屬於自己的子世界一般，六大界就是源生界的子世界。
六大界中屬神河與冥河最強，依靠兩條河流，誕生了已知史上最強大的兩個文明，並發現了主世界，源生界。兩個文明為了爭奪主世界展開第一次形體戰爭（神河體與幻體），兩敗俱傷，退居神河與冥河休養生息。
戰後兩者為了對抗對方，開始研究對方的生物基因。
神河文明於毗鄰的兩個子世界建立超神學院，開始研究基因工程。
在天使之城（天使出現後命名）通過生物基因創造了新生神河體種族——天使，而在靈界強化部分生物的靈魂，凝結為幻體意識，同時對冥河的忌憚，神河留下了部分自己的基因，用於監測靈族的成長。靈族與天使由於神河文明的基因工程迅速成為靈界與天使之城的主導者。
冥河文明通過幻體靈魂強行奪舍整個修羅界的神河體文明，誕生出修羅界特有的神河體，魔族。同時進行神河體基因和凶獸基因融合，創造出第三大形體，獸體。獸體身體素質強悍，但智慧形態不足，文明發展緩慢。
公元前20萬年，神河文明與冥河文明消散於虛空，兩個文明幾乎所有的一切都被湮滅，隻留下兩條河流以及少量存於源生界中的文明。
公元前20萬年至公元前3萬年，四大界文明高速發展，源生界開始誕生智慧生物，為了決定源生界的主導權，展開了第二次形體戰爭，獸族、靈族戰敗，天使之城與修羅界的神河體成為源生界的主導者。（獸人獸體，靈族幻體），同時靈界靈族元氣大傷，靈界由神河體主導。
公元前28000年，天使紀元元年，天使之城內戰爆發，天使王華燁墮落，天使聖戰爆發，凱莎弑殺華燁，華燁戰敗而逃，天使之城驅逐所有男性天使，廢除天宮秩序，成立梅洛天庭，建立三王時代。天刃王（凱莎）天啟王（凉冰）天基王（鶴熙）。由於聖戰造成天使之城內核枯竭，天使之城1000年間將毫無生命，於是利用超神學院大時鍾打開蟲洞，於源生界建立一個新的天使之城，占據了整個星雲，並將其命名為天使星雲。
公元前15000年，天使紀元17000年，天刃王凱莎為了滿足自己的鐵血統治建立正義秩序，發動戰爭，凱莎勝利，天使之城進入凱莎統治的正義時代。同時鶴熙失蹤，凉冰去往古神河文明的神河學院擔任導師。（超神學院與此時被迫遷出天使之城，研究成果隨之被兩個文明所分離。）
公元前11000年，天使紀元13000年，凉冰墮落，占領惡魔星雲自立為王，以自由墮落為信仰，其信徒尊其為莫甘娜，其手下呼其莫甘娜女王。同時與凱莎發動幾次聖戰都無法完全消滅彼此，直至現在。
同時期，超神學院學者，卡爾，冥河文明後裔，冥河文明湮滅後，一直沉睡，於三王時期蘇醒，並幻體寄生加入超神學院當一名學者，凉冰墮落後，重歸幻體，竊走古神河遺產大時鍾，回歸冥河以北，建立死歌書院，並利用冥河與獸人帝國的空間蟲洞統禦獸族，利用智慧幫其建立獸體文明，獸族尊其為神。並且利用大時鍾於冥河星雲建立新生代冥河文明，並於太陽係冥王星建立大規模空間跳躍蟲洞，窺視地球。
公元前10000年左右，神河文明再次追隨古神河的研究成果——xk-08係列，研製出fxk-01號以及fxk-02號基因工程樣品，同時發現終極恐懼，神河基因工程虛空研究組的人一夜之間消失殆盡，唯一存活下來的隻有超神學院校長以及留存的fxk-01和fxk-02號，以及xk係列6-8號，而校長基蘭帶著這些東西消失與世界上，眾人隻知道他還活著，卻不知身在何處，或許化為意識消散於宇宙也說不定。
公元前4000年靈界與修羅界發展迅速，產生了極高的文明，由於沒有神河文明以及冥河文明的壓製，天使也自顧不暇，兩大界決定入侵源生界新生的智慧生物世界，地球，奪取兩大文明曾存放於地球上的遺產及古基因密碼。
源生界：地球：華夏
公元前4000年，靈界與修羅界來到源生界，通過生物基因製造第一批源生界的超級基因戰士。大戰曆經數百年，黃帝於逐鹿之戰大勝蚩尤，源生界歸於靈界主導，同時原靈界神河文明基因者回歸神河，以神居之。
修羅界魔族退居冥界冥河之南，自封冥王哈迪斯。
公元前1044年，神河文明內部出現矛盾，為了發展各派係勢力，其在源生界投下了當初古神河文明僅剩的神河基因，同時還投放了一件xk-5，在當時命名為奇門遁甲，並發動了封神大戰，以武王伐紂為開始，商湯滅亡為結束，而此戰隕落了神河文明損失慘重，故此商湯之後不見仙。