作為第一支抵達科索沃的外國維和部隊，俄羅斯部隊的突然進入顯然是在事先沒有同北約達成一致的情況下行動的。美國副總統戈爾在接受美國廣播公司電視采訪時說，他對俄羅斯軍隊進入南聯盟“感到吃驚”。北約其他國家和世界輿論也“感到吃驚”。
俄羅斯外長伊萬諾夫隨後發明聲明說，俄羅斯的這支維和部隊擅自進入科索沃是“一種錯誤”，必須撤出。但俄羅斯國防部一位高級人士12日說，俄軍這支部隊未接到從普裏什蒂納撤出的任何命令。俄羅斯總統辦公廳副主任普裏霍季科當天在莫斯科舉行的新聞發布會上說，俄軍是根據葉利欽總統的指令進入科索沃的。他說，葉利欽總統時刻關注巴爾幹事態的發展，有關科索沃形勢的報告隨時送到他那裏。軍人的責任就是嚴格履行總統的指令。
首先進入科索沃的俄軍屬於俄空降兵。這支200人的隊伍是7個半小時內從波黑急行軍500千米到達南斯拉夫的。當時北約國家的軍隊仍在做進入科索沃的準備。
輿論認為，俄軍快捷、神秘地進入科索沃，政治意義非凡，可同當年第二次世界大戰中蘇聯紅軍與美英軍隊搶攻法西斯德國首都柏林相媲美。由於蘇聯紅軍的火速突襲，使得1945年5月3日法西斯德國分別向蘇軍和美英軍隊無條件投降。蘇軍的這一果斷軍事行動，打破了法西斯統治集團企圖隻將柏林交給美英軍隊的計劃。俄羅斯的這次行動表明，俄國領導人在國際事務中是富有經驗的，俄將在戰後科索沃問題上繼續發揮重要影響。
就在俄羅斯部隊進駐普裏什蒂納4個小時後，由200多名英國士兵組成的第一批北約地麵部隊在直升機的掩護下，於6月12日5時22分通過馬其頓和南聯盟邊界的布拉采口岸進入科索沃省。這支部隊主要是英國第五空降旅傘兵團士兵，其中包括一些尼泊爾廓爾喀雇傭兵。
英軍部隊啟程前，包括美國“齊諾克”直升機在內的北約直升機正將1600名執行排雷任務的工兵中的一部分先送進科索沃。因為北約部隊懷疑在布拉采至科索沃首府普裏什蒂納的高速公路上的橋梁及隧道裏，可能埋有大量地雷和其他爆炸物。
6月12日，北約共有6000多名士兵從-馬其頓進入科索沃。還有一隊德國士兵從阿爾巴尼亞與南聯盟邊界莫裏納口岸開進科索沃。
但是，北約和俄羅斯在科索沃維和的指揮權問題上始終沒達成一致。美國總統克林頓6月13日與俄羅斷總統葉利欽就科索沃維和問題進行了一個小時的電話交談，雙方同意北約和俄羅斯軍事領導人會談，以解決俄羅斯部隊首先進入科索沃首府普裏什蒂納的問題。克林頓在會談中強調，美國需要維護北約的“統一指揮”和科索沃維和部隊的“有效性”。但是，俄羅斯就是不答應把部隊交給北約指揮。
當天，美國副國務卿塔爾博特在同俄羅斯外長伊萬諾夫就科索沃維和問題進行會談後說，科索沃將有俄羅斯軍隊的維和區，美國希望俄羅斯在科索沃發揮同其在巴爾幹利益相稱的認真負責的作用，但是不希望俄再作出令人意外的舉動。而伊萬諾夫說，俄羅斯已經在相當程度上消除了美方因俄軍進入科索沃而產生的不安。他說，各國維和部隊在科索沃的部署方式不必根據波黑模式，已進入科索沃的俄軍將不再改變部署地。
在6月13日，北約軍隊進入科索沃的人數已在1萬到1.5萬人。美國國務卿奧爾布賴特在接受美國全國廣播公司采訪時說，北約軍隊進入科索沃的人數遠遠超過俄羅斯，人們不必過高估計俄軍隊首先進入科索沃的重要性，也不必為此“過於激動”，此事正通過合適的渠道來處理。
然而，到了6月15日，占領了普裏什蒂納機場的俄羅斯200名軍人仍然與同樣想占領此地的英國軍隊和法國軍隊對峙著。而南聯盟軍隊已有序地撤出科索沃。到6月16日已撤出1.5萬名軍警、50％的裝甲車和25％的坦克。
科索沃維和行動的這一序幕，頗具戲劇性和象征意義，預示著維和道路不會平坦。可以說，科索沃將成為美俄關係演進的舞台，成為雙方爭奪歐洲安全事務發言權和決定權的焦點。
隨著北約部隊開進科索沃，“科索沃解放軍”也回來布防，暴力事件已開始發生。俄羅斯國防部6月14日表示，如果北約駐科索沃維和部隊縱容“科索沃解放軍”為所欲為，俄將被迫采取措施，向聯合國安理會提出重新討論科索沃問題的建議。
科索沃的阿族難民開始返回家鄉。但是，阿族難民們沒有想到，過去美麗的家園現在已是滿目彈痕。他們有些人不知道是要感謝北約還是要詛咒北約。而新的塞族難民又出現了。他們擔心“科索沃解放軍”回來反攻倒算。於是，過去居住在科索沃的塞族人，紛紛往塞爾維亞方向逃跑，也有的逃往波黑等地區。