黨風不純，腐敗問題嚴重，新時期的整黨沒有采取大轟大嗡、大搞“群眾運動”的方式，而采取“不打棍子、不扣帽子、不抓辮子、不裝袋子”的政策，取得了可喜的成效。
整黨的進程和基本估價
這次整黨是在經曆十年內亂的災難之後，國家和社會處於改革、開放、搞活經濟的新的曆史環境中進行的。“文化大革命”中，在“左”傾錯誤理論指導下，特別是由於林彪、江青兩個反革命集團的倒行逆施，黨的思想、作風、紀律、組織遭到了空前破壞，黨的優良傳統和幹部隊伍遭到了嚴重摧殘，黨在群眾中曆來享有的崇高威望和聲譽遭到了極大損害。經過十一屆三中全會以後的撥亂反正，這種狀況雖然有了根本改變，但在整黨開始前，“文化大革命”遺留下來的黨內思想、作風、組織三個嚴重不純和紀律鬆弛的問題，仍相當嚴重。黨和國家工作重點的轉移，社會主義現代化建設的開展，堅持四項基本原則，反對資產階級自由化，實行改革、開放、搞活經濟的新政策，給黨和人民的事業帶來了巨大生機，整個國家和社會生活都處在空前活躍和急劇深刻的變動之中。新情況新問題層出不窮。在這種曆史條件下進行整黨，一方麵黨內外群眾必然會深切地關注並寄予很高的期望，另一方麵必然會遇到許多事前難以完全估計到的問題。這就決定了這次整黨具有很大的艱巨性和複雜性，不可能是一帆風順的。任何一個曆史問題，都要把它放在一定的曆史環境中去加以考察，這是馬克思主義的一個根本要求。我們在總結整黨工作時，也應按照這個要求去做。對整黨的成績、存在問題和經驗教訓，都要放到上述總的曆史環境中去分析和估價，以便得到比較符合實際的結論。
這次整黨實際上是分三期進行的。第一期是中央、國家機關各部委和各省、區、市一級單位以及解放軍各大單位，第二期是地、縣兩級單位，第三期主要是農村的區、鄉、村。三期整黨，基本上都是按照中央整黨決定中規定的四項基本任務和基本的方針、政策、部署進行的，並注意了從每期整黨單位的實際出發，根據整黨形勢和建設、改革形勢發展的需要，在突出解決的重點問題上，各自有所側重.第一期整黨中，為了加強領導，中指委和中央軍委共派出了有850人參加的90個整黨工作聯絡員小組，並成立了中央和國家機關10個口的整黨工作指導小組。結合整黨的過程，中指委先後發出了11個通知和其他文件。這些文件，是中央整黨決定精神的具體化，對第一期和以後各期的整黨工作都起了重要指導作用。第二期整黨開始時，中指委發出專門通知，針對當時黨內和社會上出現的幾股新的不正之風，及其嚴重幹擾改革和四化建設的順利進行、嚴重侵蝕黨的組織和幹部隊伍的情況，明確指出：要把增強黨員的黨性，糾正新的不正之風，保證改革的順利進行，促進政治經濟形勢繼續健康地發展，作為地、縣兩級整黨的突出重點來抓。第三期整黨開始時，中指委也及時發出專門通知，對農村整黨的具體的要求、方法、步驟作了全麵安排。各省、區、市共派出宣講員和聯絡員63萬人，深入農村幫助整黨。1986年5月、6月，中指委還分片召開了省、區、市黨委書記整黨工作座談會，進一步明確了農村整黨的根本指導思想，要求把解決區、鄉、村黨員幹部中存在的嚴重以權謀私和嚴重違法亂紀問題，作為突出的重點認真抓好，並切實加強農村領導班子的建設。這些會議，對推進農村整黨工作起了很好的指導作用。今年初以來，在黨中央的領導下，又在政治思想領域裏開展了黨內反對資產階級自由化的鬥爭，對廣大黨員普遍進行堅持四項基本原則的正麵教育，著重解決政治原則和政治方向的問題。我們應該充分認識這一鬥爭的重要性。從黨的建設角度來說，更應把這項工作看成是整黨的深入補課。三期整黨作為整黨工作的全過程，是相互聯係、相互促進的。上一期為下一期提供了經驗和教訓，下一期反映出來的問題又促進上一期整黨單位回過頭去進一步解決，形成了“以上啟下、以下促上”的特點。這有力他說明，這次整黨確定的從黨的中央機關到基層組織的自上而下、分期分批展開的原則，是正確的。
綜觀整黨工作的全過程及其各個方麵，中指委認為，這次整黨是有成績的，有不少地方、部門和單位的成績還比較顯著，而且一期比一期整得好些，各級黨組織和整黨辦事機構做了大量的認真的工作，廣大黨員和黨員幹部積極參加整黨，廣大黨外群眾和朋友熱情支持整黨。總的說來，全黨在思想、作風、紀律、組織四個方麵，都比整黨前有了進步，黨內存在的三個嚴重不純的狀況已經有了改變，同時積累了一些正確處理黨內矛盾和問題的重要經驗。這些都為新時期黨的建設的加強和發展，奠定了一個比較良好的基礎。但是，整黨工作發展不平衡，有一部分單位包括一些高、中級黨政領導機關，沒有全麵完成整黨的四項基本任務，有的甚至走了過場，以致影響和損害了整黨工作在群眾中的聲譽。整黨搞得比較好的單位，在黨風和其他方麵也還遺留了一些問題，需要在今後經常的黨的建設中繼續加以解決。這就是對這次整黨的總的估計。