噬菌體是個變龍，有時對人類有益，有時卻又對人類有害，益是因為它會“吃”掉那些在人體內的致病病菌，起到治病的神奇效果。而害則是因為它可能會“吃”掉一些益菌或其他本身屬於害菌但被人利用做一些有益的事的細菌（如：大腸杆菌、葡萄球菌、酵母菌等），給人類的健康和生活帶來了很多損失。
噬菌體因為它所具有的許多特殊的性質，已經成為人類重要的研究對象。人類通過它來探討核酸（DNA和RNA）的複製、轉錄、重組，基因表達的調節控製，病毒與宿主的關係等，極大地促進了病毒學、分子生物學、遺傳學等領域的飛速發展。
噬菌體，它作為一種基因的載體，成了基因工程的研究中不可或缺的神奇工具。人類依靠著噬菌體特異性的裂解作用，成功地將致病菌極其精細地分解為不同類型，用它來追蹤細菌性疾病流行病學的傳染源，萬無一失。在臨床醫學中，人們也經常利用噬菌體來診治某些細菌性感染的疾病。另外還可利用對溶性菌的誘導現象來進行一些抗腫瘤藥物的篩選和對致癌物質的檢查。
噬菌體的汙染也可能給發酵工業（如食品工業、抗生素工業等）造成巨大打擊，因此，嚴密地防治這種汙染的發生。