必須考慮的一個現實是，在金帳汗國的行政架構之下，花剌子模帝國與保加爾國已經不再是兩個獨立的國家，而是作為統一的帝國的一部分。相應的結果是，原來分屬兩國的伊斯蘭教勢力，現在融合成了一股統一的勢力，也就是說，在統一的金帳汗國治下，伊斯蘭教領袖的影響力壯大了。這可以部分解釋前麵交代過的一個情節：別兒哥放下尊嚴以求得巴哈兒昔的接見。
4.塵歸塵，土歸土
別兒哥對伊斯蘭教的重視，在布哈拉得到集中體現。正如前麵已經交代過的，
[1]Thomas S.Noonan，“Suzdalia’s Eastern Trade in the Century before the Mongol Conquest.”，Turcica，vol.19，1978.
這裏正是別兒哥的皈依之地。而特別值得一提的是，這裏並非金帳汗國的屬地。布哈拉所在的中亞河中地區，原本屬於察哈台汗國。不過，在察哈台於公元1242年去世後，河中地區實際上處於蒙古帝國中央的直接治理之下。因此，布哈拉城內不僅有察哈台家族的勢力，也有術赤家族的勢力。
公元1259年農曆7月蒙哥大汗去世後，托雷與正妻所生的四子阿裏不哥，在哈剌和林召集西北諸王舉行庫裏台大會，宣布自己為蒙古帝國大汗。隨後，他將河中地區交由察哈台的孫子阿魯忽管理，而布哈拉城的穆斯林精英與術赤家族的勢力卻效忠於別兒哥。為了爭奪這座中亞的伊斯蘭教文化中心，換句話說，為了爭奪對中亞伊斯蘭教的影響力，別兒哥與阿魯忽展開了激烈的爭奪戰。
然而最有意思的是，最終能影響這場爭奪戰結果的，主要是阿裏不哥和忽必烈，而不是別兒哥和阿魯忽。
在盧布魯克寫給路易九世的報告中，阿裏不哥的宗教傾向是基督教，但這並不意味著他不了解布哈拉的重要性。他之所以將布哈拉交給阿魯忽，而不是別兒哥，很可能是出於這樣一種考慮：如果別兒哥擁有了布哈拉，金帳汗國會因為得到伊斯蘭教的支持而坐大，伊斯蘭教則會因為金帳汗國的支持而進一步擴張。
這兩種結果都不是阿裏不哥希望看到的。於是，他選擇將河中地區交還給察哈台的後人。他想通過這個煞費苦心的安排達到兩個目的：其一，維持中亞地區的實力平衡；其二，團結察哈台家族的勢力，從而實現鞏固自己大汗之位的終極目的。但是，阿裏不哥萬萬沒有想到的是，正是他倚為心腹的阿魯忽，在關鍵的時候背叛了他。
公元1260年農曆3月，阿裏不哥的親二哥忽必烈在開平府召集了庫裏台大會，並被推舉為大汗。隨後，忽必烈揮師北上，與阿裏不哥展開決戰。公元1261年，物資緊缺的阿裏不哥派人去河中地區征收賦稅。然而，阿魯忽早已經在暗中投靠了
忽必烈，他將阿裏不哥的使臣拘押並處死了。在忽必烈大汗的支持下，阿魯忽鞏固了對包括布哈拉在內的中亞河中地區的統治。
在這場爭奪大汗之位的鬥爭中，別兒哥扮演著中立者的角色。在蒙哥大汗去世之後，別兒哥已經無人可以依靠：阿裏不哥明顯不信任他；忽必烈則與旭烈兀——他的仇人——有著牢不可破的聯盟關係。對這位金帳汗國可汗而言，無論是誰最終登上大汗之位，對自己都未必是好事。
來自蒙古帝國內部的潛在威脅，迫使別兒哥向外尋找新的盟友。他的宗教信仰為他指明了方向。因為有著共同的仇敵——旭烈兀，以及共同的信仰——伊斯蘭教，埃及馬穆魯克蘇丹貝巴斯成為別兒哥的選擇。
貝巴斯與旭烈兀之間的恩怨，始於後者對敘利亞的入侵，在公元1260年的艾因賈魯戰役前後達至高潮。關於這方麵的內容，前文已有比較詳細的闡述。對此戰失利耿耿於懷的旭烈兀一直在伺機報複。
至於別兒哥與旭烈兀之間的恩怨，則源於對阿塞拜疆地區的爭奪。阿塞拜疆位於裏海的西麵，處於金帳汗國與伊爾汗國之間。它的戰略價值在於，它有一片極為出色的牧場，“蒙古人特別喜愛庫拉河下遊駐冬的木甘草原，以及適於夏天放牧的覆蓋著豐美青草的哈剌塔黑的山坡。”[1]
成吉思汗去世之前，曾將阿塞拜疆分封給術赤家族，但是蒙哥大汗登位之後，又將這塊地方封給了弟弟旭烈兀。盡管別兒哥對這種安排十分不滿，但他並沒有表現出來，直至蒙哥去世才開始爭奪。
別兒哥對伊斯蘭教的宗教情感，使他與旭烈兀之間的矛盾加深。據英國曆史學家尼科爾考證，旭烈兀大軍於公元1258年攻陷巴格達、處死阿巴斯帝國最後一名
[1]格列科夫，雅庫博夫斯基：《金帳汗國興衰史》，商務印書館，1985年。
哈裏發的行為，讓別兒哥極為憤怒。他曾如此向蒙哥大汗表示抗議：“他（旭烈兀）洗劫了穆斯林的所有的城市，並處死了哈裏發。在真主的幫助下，我將讓他為這如此多無辜的鮮血付出代價。”[1]