1601年10月，天文觀測界的一代宗師、丹麥天文學家第穀與世長辭。在彌留之際，他把平生積累下來的所有寶貴觀測資料都饋贈給了他的學生，一個30歲的德國天文學家開普勒。開普勒幼年時患過小兒麻痹症，雙眼視力不濟，但他克服了種種困難，在天文觀測方麵仍做出了許多重大貢獻。他於1604年發現了著名的蛇夫座超新星（現稱開普勒新星），也觀測過1607大彗星（後來證實，即是哈雷彗星）。他還深入研究了光學，在伽利略望遠鏡的基礎上發明了“開普勒式望遠鏡”。當然他的最偉大貢獻還在於發現了行星運動的開普勒三定律。
然而金無足赤，開普勒也有輕率失誤時。1607年5月18日，他正在觀測太陽，突然發現太陽圓麵上有個小黑點。可惜的是，開普勒當時沒有“跟蹤追擊”，而漫不經心地認為這是金星淩日。當時人們還不會計算，其實金星的淩日要到1631年才出現。為什麼開普勒會這樣大意？這完全是因為傳統觀念的束縛。因為當時人們的頭腦中，太陽是天上的火球，是最完美的球，完美的東西是不應當有缺陷的。
在開普勒時代，教廷擁有至高無上的權力。他們竭力宣揚，太陽是上帝創造的，萬能的主不會造一個有瑕疵的天體。因此太陽、月亮都是最光滑、最標準、最完美的球體，任何懷疑都被視為褻瀆神靈的異端邪說。
甚至在伽利略已經發現並證實了黑子確實存在於太陽表麵後，多數人還是不敢相信眼睛看到的事實。當時有個名叫席奈爾的天主教士，他也用望遠鏡觀測太陽，也發現了那些黑點。席奈爾惶惶不安，但不管他如何調節儀器，也不論他如何揉拭眼睛，都無法使這些黑點消隱。萬般無奈，他隻能跑去求助於他的主教。聽著席奈爾氣喘籲籲的敘述，主教早已不耐煩起來，他打斷席奈爾的話說道：“去吧，孩子，放心好了，這一定是你那該死的玻璃出了毛病；不然是你太累了，眼睛上有缺陷，才使你錯誤地把它當成了太陽上的黑斑。”
《漢書》上的黑子記載為世界最早的黑子記錄，與此相對照的是，我國很早就有了太陽黑子的記錄。在春秋早期的《周易》中就有“日中見鬥”及“日中見沫”等記載。現在世界公認最早的黑子記錄也在我國：《漢書·五行誌》中就記載了河平元年（公元前28年）三月乙未（應為已未之誤，相當於5月10日），日出黃，有黑氣，大如錢，居日中央。從漢代到明朝，至少有100多次關於太陽黑子的確切記錄。在公元三四世紀的晉代，我國已開始正式采用“黑子”這個名詞了。
日冕
現在知道，太陽表麵上不僅有黑子，還有許多奇特的東西，如米粒、超米粒、光斑……
黑子在日麵上呈暗黑色，“米粒”則比日麵更亮一些，它的溫度平均比日麵高300多攝氏度。因為它是從太陽內部升上來的“氣流”，所以在激烈地變化著，每顆“米粒”的壽命不過幾分鍾。千萬別誤解了，把“米粒”看做小東西，實際上，太陽上的“米粒”大得非凡，平均長1000千米左右，而兩米粒間的距離約1500千米。日麵上的“米粒”約有250萬顆，總麵積可占太陽表麵的40％左右。