永遠的加拉帕戈斯群島項目
“永遠的加拉帕戈斯群島項目”的基本理念是確保加拉帕戈斯群島生態係統的完整性，為當地人開展的旨在減少偷獵行為的舉措提供直接的支持；在環境管理問題上為厄瓜多爾人提供培訓；探索符合環保目標的具有可持續性的新的經濟發展模式。
自1998年以來，野生救援協會一直在與加拉帕戈斯群島國家公園管理局和當地社區保持密切的合作夥伴關係，扮演技術顧問和中間人的角色。野生救援協會的目標是通過與所有方麵合作來為該群島日益增長的問題尋找和平、可持續的解決方案。加拉帕戈斯群島及其附近水域的保護工作麵臨著一係列重大的挑戰，野生救援協會與當地的合作夥伴共同努力應對入侵物種、濫捕或非法捕魚、汙染和發展問題以及新的經濟發展手段等挑戰。
入侵物種：由於非本地的動物、昆蟲和植物進入了該群島，當地已經有數個物種滅絕，但仍然有入侵物種在進入該群島，外來物種是當地獨特的陸棲野生動物麵臨的主要威脅。
濫捕或非法捕魚：來自於當地的、厄瓜多爾本土和外國的漁民所從事的非法的捕魚作業對該群島的自然保護區造成了破壞。受這些非法的捕魚方式影響最大的物種包括鯊魚、金槍魚、龍蝦和海參。非法捕魚作業所捕撈的副漁獲物中有海豚和海龜，因此，也有海豚和海龜因為上述作業而喪生。
汙染和發展問題：伴隨人口過快增長和旅遊業擴大而產生的發展和汙染問題對陸棲和海洋野生動物都造成了威脅。“傑西卡”號油輪是一艘為旅遊船隻和厄瓜多爾海軍輸送燃油和柴油燃料的油輪，該油輪曾發生擱淺溢油的事故，這一事故讓世人看到了當地所麵臨的來自汙染的威脅。
新的經濟發展手段：海參捕撈業和手工龍蝦捕撈業都存在濫捕的問題，在捕撈壓力和不良捕撈方式的情況下，上述漁業是無法恢複的。進一步捕撈隻會加劇對海洋生態係統的負麵影響，加大對另外一種資源的壓力，即鯊魚。與漁民合作探索新的經濟發展手段是一項需要優先重視的工作。
鯊魚保護項目
野生救援協會的“鯊魚保護項目”的目的是減少濫捕；對鯊魚製品的過度消費；一些浪費鯊魚資源的做法，例如在海上割掉鯊魚鰭和在不必要的情況下把鯊魚作為副漁獲物捕撈上來等因素對鯊魚造成的威脅。還要提高數據收集和研究工作的質量，倡導依據國際協議和公約為某些具體的鯊魚物種做好保護工作，以支持各海洋保護區和其他實現鯊魚保護措施的重要區域。
自2000年以來，野生救援協會的“鯊魚保護項目”提高了國際社會保護鯊魚的意識，重點宣傳了在全球層麵上保護鯊魚資源的重要性。這一成績為以下工作的實質進展作出了貢獻：歐洲聯盟規定禁止在海上割取鯊魚；有兩個鯊魚物種得到國際保護；聯合國就解決海上割鰭問題通過了一項決議；亞洲的魚翅主要消費國和地區的魚翅消費量大幅度下降。除了努力提高消費者的意識並開展旨在降低需求的宣傳活動之外，野生救援協會的工作重點還有兩個重要區域：中美洲和南美洲，這兩個區域是鯊魚鰭的重要來源。與此同時，野生救援協會繼續努力推動強化有關鯊魚保護的國際法律，並積極倡導鯊魚作為旅遊資源對各國政府的經濟價值要大於鯊魚肉或鯊魚鰭的經濟價值的觀點。
美國野生救援協會在中國的工作開始於2000年，野生動物保護行動於2004年在北京設立了辦事處，並在中國組織了一些融媒體宣傳和教育於一體的活動。
2004年9月，野生動物保護行動與中國野生動物保護協會共同開展了第二批綠色廚藝大使表彰活動；同年又與首都高校12個綠色團體合作主辦了首都高校環境文化周，主要內容有舉辦環保攝影大賽，此前，還舉辦了“野生動物保護行動”北京高校巡展，向在校學生宣傳保護野生動物的觀念。
野生動物保護行動中國項目注重加強與媒體、政府決策部門、商業團體、國內外野生資源保護組織和教育部門的聯係。成龍（野生動物保護行動的國際形象大使）、李寧、章子怡、李安、梁朝偉、劉歡、楊紫瓊等世界著名人士和奧運冠軍都應邀錄製了電視和廣播節目，通過這樣的活動，野生動物保護行動鼓勵個人、政府和公司積極地參與到保護野生動物的活動中來。