學生社團是現代大學生基於共同的興趣和愛好自發組成的、按照章程自主開展活動的群眾性團體和學生組織。社團以其鮮明的開放性、平等性、自主性及多樣性等特點，已迅速成為校園文化的一支奇葩，它在推動校園文化建設、優化成才環境、豐富大學生活、升華學生思想境界、鍛煉學生強健體魄、促進學生心理健康、提高學生綜合素質等方麵發揮了重要的載體作用。參與學生社團，已成為學生豐富校園生活、培養興趣愛好、參與學校活動、擴大求知領域、增加交友範圍、豐富內心世界的重要形式。學院為順應時代發展和學生成長的要求，按照“大力扶持理論學習型社團，熱情鼓勵學術科技型社團，正確引導興趣愛好型社團，積極倡導社會公益型社團”的指導思想，切實加強學生社團的建設與管理，充分發揮學生社團在校園文化建設和學生素質拓展中的重要作用。
一、順應學生成長要求，大力發展學生社團
1.學生社團的創建
2001年，升格學院後，由團委、學生會牽頭開始籌建社團，每個部門下掛一個社團，最初批準成立的社團有：武術協會、籃球協會、舞蹈協會、攝影協會、棋友協會和書法協會。但是，最初的學生社團由於處於探索階段，缺乏相應的專業指導，而且是分散於學生會各部門管理的，學生興趣不是很高，參加人數不多，社團活動沒有真正開展起來。
2003年3月，經學工處、團委研究決定，學生會增設社團部，在學院團委的指導下，學生會社團部統一協調管理各社團的具體工作。為便於開展工作，社團部製定了《江蘇牧醫學院學生社團管理條例》，《江蘇牧醫學院“優秀社團”評比細則》等文件，並邀請相關老師指導社團活動。社團部的成立，使各個協會活動的開展有了一定的組織保障。這一年中，社團不斷發展壯大，先後成立了計算機協會、足球協會、乒乓球協會、清源文學社、大學生誌願者協會等，“三個代表”理論學習小組也在籌備之中。第一任社團部負責人潘大耐同學是通過競選產生的。
2.社團的穩步發展
2004年3月，隨著社團的不斷發展壯大，社團部成功完成了社團幹部的換屆，第二屆社團幹部人數由原來的幾人發展到31人。為進一步加強社團管理，充分調動社團成員的積極性，吸引更多的同學加入社團，為社團的進一步發展壯大謀求更加廣闊的空間，學生會社團部向院團委提出了組建“社團聯合會”的申請。
2004年10月，院團委正式批準撤消學生會社團部，成立學生“社團聯合會”（簡稱“社聯”）。社團聯合會仍然由學生會統一管理，社團聯合會的會長通過競選產生，社團聯合會會長負責社團的具體工作。隨後的一年中，“社聯”得到了很大的發展：一是將“社聯”所屬各協會劃分為理論學習、體育健身、文學藝術、學術科技和誌願服務等5類，並將相關係在2004級學生中成立的愛心寵物協會、大學生藝術團和綠舟環保協會並入“社聯”，至此“社聯”共有成員19個。二是建立健全了“社聯”的管理機構，成立了秘書部、財務部、監察部、組織宣傳部、信息部和外聯部，並製定了相應的工作職責，各部門分工協作共同做好“社聯”的管理工作。三是加強了“社聯”的財務管理，各社團所收會費統一上繳“社聯”財務部管理，其中30%作為“社聯”重大活動的資金，70%用於支出本社團活動經費。實行嚴格的經費申請和報批製度，每次活動前進行活動經費的資金預算並向“社聯”提出申請，活動後進行決算並向“社聯”核報。
2005年9月，在經過一年的運行和發展後，“社聯”正式從院學生會分離出來，成為直屬院團委的群眾性團體。隨後的一學年，新成立了大學生演講辯論協會、吉他協會、繪畫協會、收藏愛好者協會和軍事愛好者協會，社團數量增加到24個。到目前為止，學院共有院級學生社團31個，其中理論學習類社團2個，體育健身類社團9個，文學藝術類社團12個，學術科技類社團5個，公益服務類社團3個，總計注冊社團成員3000餘人。
3.精品社團簡介
（1）“三個代表”理論學習小組
“三個代表”理論學習小組是學院團委領導下的理論學習型社團，成立於2004年10月。由具有較高思想政治素質的學生組成，現有會員132人。該協會旨在以“三個代表”為指導思想，“堅定政治方向，學習科學理論，推進素質教育”為宗旨，通過舉辦講座、特色活動、學習體會討論等形式學習貫徹“三個代表”的重要思想，成為學院大學生學習實踐理論的重要平台。
（2）清源文學社
清源，源於朱熹的“問渠哪得清如許，為有源頭活水來”。清源是一股文學的小溪，從心底的源頭流出，散發著文字的幽香，熏陶著人的心境。愛好文學的人，隻有不斷地研究文學，不斷地品評吸收，心底的源頭才會有活水源源不斷流出，才思才會敏捷，從而達到文不加點、文從字順的程度。清源文學社成立於2003年4月，其宗旨是：引領校園文化，提升人文素質；理念是：文以清心，源源不斷；目標是：建設校園文學芳草地，為同學們提供文學條件。憑著對清源事業的執著追求，清源人創辦了院級刊物《清源》報紙；積極開展文學交流活動，探討校園文學的性質、方向和任務；通過文學作品展覽、文學講座等來普及文學知識，傳播推廣先進的創作思想和理念。文學社設有記者團、編輯部、策劃部、外聯部等4個部門，其中記者團具體負責校園內的大事采訪、撰搞；編輯部具體負責《清源》報的采稿、審稿、定稿、編輯、排版、出版工作；策劃部具體負責特色活動，為活躍文學氛圍而出謀劃策並做出具體的節目安排，靈活性較大。外聯部負責文學社的對外交流以及報紙的廣告讚助，提高文學社的校外影響力。各部門各司其職，相互協調，相互配合，發揮團結合作的精神，使文學社工作體係日益完善化、成熟化。
（3）支點英語協會
該協會成立於2004年3月，現有會員215名。協會的宗旨是：通過開展各種有英語特色的活動來豐富同學們的課餘文化生活，營造良好的學習英語的氛圍，讓同學們更多地了解英語文化，更有效地提高英語水平，特別是英語交流能力。英語協會下設學習部、秘書部、編輯部、組織宣傳部、外聯部。各部門相互協調，積極開展豐富多彩的活動。如經常承辦“中英文娛晚會”、聖誕舞會，定期出版《英語沙龍報》等，深受同學們歡迎。
（4）愛心寵物協會
該協會成立於2004年10月，是由全院動物愛好者組成的學生團體。旨在提高大學生的動物保護和福利意識，倡導“科學養寵、文明養寵”理念，推動學生了解動物、尊重動物、善待動物，改善寵物的生存環境。協會目前的日常工作主要包括：宣傳相關政策法規，為流浪遺棄小動物提供救助，宣傳“科學養寵、文明養寵”理念，提高伴侶動物主人的綜合素質和社會責任感。協會結合學院自身的實際情況，先後開展了多種有意義的活動，如去牧場觀看寵物、義務打掃學院動物房、開展各類寵物展等，這些活動的開展既培養了會員對寵物的感情，豐富了會員的課外生活，又鍛煉了會員團結奮鬥、吃苦耐勞、樂於奉獻的精神。
（5）計算機愛好者協會
該協會成立於2003年5月，現有會員163人。協會本著“普及計算機知識，提高計算機技術水平”的宗旨，不斷為廣大會員和同學服務。協會定期開展各種形式的常規活動，如每周日的技術講座、程序教學、計算機知識大賽等。協會以提高會員計算機水平為己任，幫助同學們發展自己的愛好特長，同時義務為大家提供軟件資源、計算機谘詢、購機指導和電腦維護等相關服務。