5000千年前，三界大亂，魔猿應劫而生，集三界焦慮、緊張、憤怒、沮喪、悲傷、痛苦等一切負麵因素，魔功大成，嗜殺成性，不論你是妖是魔是鬼，是人是仙是靈，統統見一殺一。三界人人自危。人魔妖鬼仙靈最終結成統一戰線，利用上古大神女媧的九九歸靈陣，集六族最強之人全身功力，造就盤古血脈唯一傳人齊麟，使得齊麟成為不遜與遠古大神的大神通。
最終，齊麟與魔猿決戰與九幽之地，那一戰打的是昏天暗地，整個九幽之府幾乎被毀於一旦，可就是齊麟也不敵魔猿，魔猿造就三界混亂，生靈塗炭，絕望、悲痛充滿世間，魔猿也越來越強大，當齊麟去找他時，魔猿已經成長為遠超上古魔神蚩尤的存在。
齊麟不敵，但他有著盤古般的心腸，遠古盤古開天辟地，以身化為大地萬物，如今，他齊麟就要與魔猿同歸於盡，還天地一個清靜。做好準備的齊麟引動體內六族力量，撲向魔猿，同魔猿化作一尊天地間永恒不變的頑石。三界歸於平靜，萬物複蘇。
隻是那一戰之後，九幽世界很久都沒能恢複，氣候嚴寒，狂風湧動，地震火山，災難層出不窮，有一天，齊麟與魔猿所化的頑石下方，岩漿湧動，地層開裂。最終形成火山，噴發得岩漿將頑石衝了出去。
東海花果山，突然一天飛來一塊石頭，那便是那顆頑石了，它立於山峰的最高處，自行吸收著日月精華，日積月累，不知不覺中3000千年過去了。
這一天風和日麗，頑石受天真地秀，日精月華，突然崩裂，從內滾出一圓石，遇風化為一石猴，那便是現代所言傳的齊天大聖孫悟空，此時石猴還不叫孫悟空，在花果山上他也有一個響亮的名稱，美猴王。
西去學藝，大鬧天空，鎮壓五行山下，最後得觀世音菩薩點化，保東土大唐和尚唐三藏西去求取真經，然而，天有不測風雲，天地間有史以來最大的一次劫難正在慢慢生成。
原來，在大日如來釋迦穆尼成就金身之時，曾經斬三身，去邪惡，那如來所去的邪惡逃到當年齊麟和魔猿決戰之地九幽世界，漸漸成型，吸收九幽之氣，幽暗中收集三界穢氣，日漸強大，自稱魔神，有人說，最慈善的佛，墜落後將成為最強大的魔，那麼，由佛祖邪惡所化的魔呢。那是不遜色於當時魔猿的強大存在。
魔神在九幽之地，魔猿與齊麟決戰之地發現，現今世上對他威脅最大的乃是頑石所化的石猴孫悟空，而此時悟空正保護著唐三藏剛到獅駝嶺，魔神派遣小妖綁走唐三藏，隨著不斷的追查，悟空遇到了為找族姐被群妖圍攻的胡媚兒，趕走已被魔神控製心智的牛魔王，悟空從胡媚兒口中得知族姐知道魔神的相關事情，遂準備尋找胡媚兒的族姐。
二人結伴而行，在傲來國遇到龍馬敖烈，三人商量現到花果山休息，從敖烈那裏得知龍族有一寶物，隻要有曾用過物品，就可在三界之內尋找那人蹤跡，悟空隻身一人前往東海，但是遲了，魔神已經神不知鬼不覺地破壞了龍族的寶庫。
失望而歸，回到花果山，卻發現花果山慘遭屠戮，敖烈不知去向，隻有胡媚兒因之前到傲來國玩耍逃過一劫，然而，悟空卻懷疑胡媚兒通敵，胡媚兒氣急離開，悟空則繼續尋找魔神蹤跡。
在建業附近的鬼村，悟空再次見到胡媚兒，然而胡媚兒卻以到彌留之際，胡媚兒告訴悟空她沒有通敵，而且，她已經發現了魔神的蹤跡，她的傷也是魔神手下打的，此時悟空才發現他已經對胡媚兒情根深種，百般後悔的悟空自毀神通，逆轉所有修為救活胡媚兒，就在兩人準備離去之時，魔神去而複返，正好見到虛弱的悟空，修為盡失悟空用身體擋住魔神叫胡媚兒逃走，但胡媚兒卻得知悟空法力盡失，說什麼也不走。
“哈哈，好一對苦命鴛鴦，那麼我就大人大量送你們一起上路吧，”魔神以為就此能除去心頭大患，高興異常。
然而，此時的悟空卻發生了變化，不，他已經不是悟空，在悟空救胡媚兒之時，他所用的是仙靈之氣，現在修為盡失，也就是說，她的仙靈之氣全部給了胡媚兒，包括齊麟留下的仙靈之氣，現在悟空身受重傷，體內的魔猿再度複蘇，“天真的小兒，你以為你能贏麼，”悟空口中的聲音陰深深的，掄起手中的金箍棒就砸向魔神。