之後，南北出現了這樣的現象：努爾哈赤在南方治國強兵，布占泰在北方壯大實力。朝鮮王國邊防體察使韓孝純描述當時的情形：老酋（指努爾哈赤）崛強，忽酋（指布占泰）繼起，而兩者都知道治兵自強。
眼見努爾哈赤短短數年收服多個部落，大有吞並東海各部之勢，布占泰心急如焚，立馬進軍，掠取諸部。布占泰力量不足，每次出兵必請兵葉赫、蒙古各部，因此，攻勢迅猛，如龍卷洗劫。到萬曆三十四年（1606年），布占泰的兵鋒幾乎染指了女真各部，並且水、陸並進，人、畜、穀物盡掠。
布占泰在軍事上的一係列勝利，早已引起努爾哈赤的不安與關注。凡是布占泰的動靜，不論大小，悉數偵察，並且及時向明廷邊官打小報告。一來可以取得明廷的信賴，二來為自己的行動清掃障礙，尋找借口。
萬曆三十五年（1607年）正月，東海瓦爾喀部來到建州，向努爾哈赤表示：部落遙遠，不得已歸附烏拉，但不堪重負，請求派兵接取家眷，歸附建州。
努爾哈赤欣然同意。同年三月，派弟弟舒爾哈齊、大兒子褚英、次子代讚與大臣費英東、扈爾漢等率軍三千前去迎接。從這支隊伍的陣勢，不難看出努爾哈赤對這次行動的重視，對其後果也是考慮周到的。
因瓦爾喀部靠近朝鮮，所以努爾哈赤在派出一支隊伍後，另寄出一封書信給朝鮮王國邊官，說明意圖，另外歸還了部分被掠來的朝鮮人口。這一行動，進一步為建州進兵掃除了障礙，使朝鮮邊防軍保持中立。
舒爾哈齊等收取五百戶居民後，令兩大臣費英東、扈爾漢率兵三百，護送先行。當護送隊伍走到圖們江右岸烏碣岩時，突然遭遇萬餘名烏拉兵的阻截，處境十分危急。
兩大臣立刻采取緊急措施，一麵急令五百戶結陣於烏碣岩之巔，以一百兵守衛。另以二百兵與烏拉兵對峙。同時，快馬加鞭求助於後繼隊伍。
烏拉兵前來挑戰，建州大將楊古利率眾奮勇迎擊，陣斬烏拉七人，烏拉兵被迫後退。兩軍各自隔江紮營。傍晚，舒爾哈齊等後繼隊伍趕到。
第二天上午，烏拉與建州兩軍接戰。戰不幾合，代善生擒烏拉大將父子，將其斬於馬下。而後又斬次將兩名。烏拉眾兵見主將失利，紛紛潰散，建州兵勇猛追擊，交戰激烈，自午時戰至日暮，烏拉兵死傷達三千人。建州獲馬五千匹，兵甲三千副。這就是烏碣岩大戰。
烏碣岩大戰使烏拉與建州兩部的力量對比發生了有利於建州的變化，戰爭中努爾哈赤的軍隊既消滅了烏拉的有生力量，又收編東海女真兵多達五六千，實力進一步增強。
大敗之後的布占泰有意投靠努爾哈赤，但是葉赫部又拋出了橄欖枝，這次的橄欖枝還是東哥妹妹。布占泰也無法抵擋東哥的誘惑，斷絕了與努爾哈赤的聯係，並逐漸疏遠了建州三女，還常以骲箭擊射努爾哈赤的女兒，以此羞辱她們。
終於在萬曆四十年（1612年）九月，努爾哈赤統率三萬大兵向烏拉進發。布占泰閉城不應戰，幾次以突襲的方式騷擾建州兵卒，使其疲憊不堪。
努爾哈赤下令攻占烏拉大城周圍的各個小城，縱火焚毀沿河六城的房屋、穀物。
布占泰沒有辦法，隻得遣使求和，接連派出三次使者，努爾哈赤均不予理睬。布占泰隻得親自求見，請求退兵。努爾哈赤身披明甲，騎跨白馬，走出軍營，步入烏拉河，站立河中，水至馬腹，厲聲斥責。布占泰唯唯叩首，悉心尊聽。最後努爾哈赤提出退兵的條件：將烏拉部眾大臣和布占泰的兒子送來建州作為人質。
幾天之後，他留下千餘士兵駐紮烏拉，其餘全部撤回。
萬曆四十一年（1613年）正月，烏拉布占泰不僅沒送人質到建州，反而準備將子女和十七大臣的兒子送往葉赫，並聘娶葉赫老女，囚禁建州三女。努爾哈赤大怒，親自統率大軍再征烏拉。
布占泰統兵三萬，出城迎戰。初戰時，兩軍弓箭手對射，槍林箭雨，殺氣淩雲。而後努爾哈赤揮刀拍馬衝入敵陣，眾將士亦緊隨衝殺。大軍如潮水般湧向烏拉軍陣，烏拉兵一時之間陣腳大亂，兵潰如山倒，紛紛棄甲奔逃。
建州大將安費揚古豎起雲梯，率先登城。努爾哈赤從容入城，坐西門城樓上觀戰。曠野之上，布占泰全軍崩潰，隻率百名親兵，勉強脫身。行至城下，見建州大旗高懸於城樓之上，他大驚失色，催馬欲逃，卻又被代善的兵卒團團圍住。