書中的軍事製度主要仿造明朝，分為衛所製、營兵製。
衛所製:由軍戶組成，軍戶世代從軍，最高單位是衛，有一省節度使節製。軍戶在戍守區實施屯田實際上是處於半農半兵。為了保證對衛所軍的控製，中層以下的軍官甚至可以世襲罔替。屬於義務兵，人數多。
5600名軍人為一衛，1120人為一所，一般每衛設左、右、中、前、後5個
千戶所；120人為一個百戶所，百戶所設總旗2個（每總旗轄50人）、小旗10個（每小旗轄10人）。
營兵製：由募兵組成，最高單位是軍鎮。無屯田職責，專職作戰，人數少。
五人為一伍設伍長
五伍為一什設什長
五什為一隊設隊正
五隊為一哨設千總
三哨為一標設標統
兩標為一營設參將
三營為一鎮設總兵
另外軍中尚有僉事（掌管軍紀）經曆（掌管文書出納）照磨（掌管考核）鎮撫（掌管軍械）都是兩個係統共通的職位。
軍鎮都設置在邊疆，遠離京師的地方，一鎮大約有一萬至一萬五千萬人不等。
總體而言營兵的戰鬥力比衛所軍高出很多。邊疆地區會設置兵備府專門配合營兵行動，特別是為其供應後勤糧草、軍械製造。
另外拱衛京師的禁軍自成一軍不在兩者之列。不為兵部節製，營兵、衛所都為兵部調動