1、隱墨（首次出現：第三章）
墨家產於於春秋戰國之交，既是與儒家齊名的學術團體，也是一群以兼愛、非攻為信念的民間軍事組織。墨者在各國上層推行墨家的主張，在底層則竭力幫助弱勢百姓、替弱國守城。因而，墨者擅長格鬥、機關術和守城術。首領稱為巨子。秦漢時，墨者轉變為“俠”。正所謂“儒以文亂法，俠以武犯禁”。
秦尊法，漢尊儒，朝廷對於地方豪強、遊俠必定鏟除。墨者仍照舊特立獨行、自食其力，豪不依賴朝廷，獨成一派，因此往往直接被作為盜賊團體剿滅。隱墨是墨家的最後一個分支。其成員身負墨家絕技（如追求簡單實效的“墨家劍法”，機關術等），組織嚴密、行事低調，平時假扮為商販走卒、隱於市中，遇事以暗號接洽，避免被朝廷發現，故號“隱墨”。此任巨子仍然是相裏霜葵的父親相裏鬆柏。墨讓在十二年前因與相裏鬆柏理念不同，出走隱墨。現為袁術的幕僚。
2、青城劍派（首次出現：第四章）
春秋戰國時期，鑄鐵造劍的中心在吳、越、晉等地。秦漢以來，礦產豐富的蜀地也成為煉鐵的產地。卓文君之父卓王孫，便是冶鐵世家。王莽之亂後，朝廷取消了自武帝開始的鹽鐵專賣，蜀地的鐵器已經是供應全國。
約從漢光武帝後期起，益州的青城山因附近礦產、水源純粹，逐漸成為優秀鐵匠的聚集之地。經驗豐富的鐵匠們在青城山上研究兵器的鑄造之理、合作造劍，年輕的鐵匠亦慕名上山學習鍛造技法。久而久之，青城山便形成了一個門派，尤其以造名劍名刀聞名天下。嚴格說來，現任掌門蒲元的祖父蒲恪是青城劍派的真正創始人。
青城劍派中弟子有等級區別，由人與劍靈的感應水平而定。共分三等，最初為“鑄劍師”，須從鑄劍的方法逐步練起，依從古時典籍與心中體悟，不斷嚐試，直至鑄出稱得上有靈之劍。隨後便是“聽劍師”，此時因長期與劍中靈氣打交道，逐漸便可感知劍中之靈，彈指之間，便可分辨劍之高低優劣、聽出一把劍的潛力何如。最後則是“馭劍師”，馭劍師可隨心所欲駕馭劍靈，人劍合一，此時可發揮出一把名劍的真正威力。從根源來說，青城劍派是專門鑽研五行金氣的門派。
3、巫山派（首次出現：第六章）
巫山自古便是練氣的絕佳場所。春秋戰國天下大亂之時，大約有一支避入巫山神女峰的母係氏族，以修仙練氣為業，久而久之，竟流出神女峰下有巫山神女的傳說。自那以後，慕名去巫山修行之士越來越多。在神女峰絕壁之上，有一深洞，名為捕麟窟。在巫山修行的俠客，每當突破自身境界，便會將心得體會寫下，書在竹簡、絲帛、金石、麻布或木牘之上，放置於捕麟窟中，留於後人。久而久之，捕麟窟便成為一處武學勝地。
數十年前，十常侍亂政。巫山中卻出現了一個名叫封無魄的練氣高手，他生於巫山，八歲時突破練氣之境，十五歲時已敗盡英雄豪傑，天下再無敵手。隨後回到神女峰，入捕麟窟中二十年，竟然將洞中千百年來以各種文字寫成的練氣要訣一一領會，進而貫通五行氣脈，寫出一部《修真禦氣經》。但寫成後不久，精血衰竭，不到四十歲便駕鶴西去了。
二十年多前，巫山神女在神女峰驀然現世，命所有在巫山的修行者以封無魄的《修真禦氣經》為宗，並聽從神女號令。自此，世上便有了巫山派一說。巫山的修行者們均成為巫山弟子，修了洞府宅第，訂了門規，拜師傳武，招收學徒。封無魄被尊為巫山派的開山祖師，其屍身經年不腐，乃是巫山派的聖器，又捕麟窟設為門派禁地。有了《修真禦氣經》為指導，代代相際，門派很快就壯大起來，如今已有近千人之多。巫山派平時由一代弟子管理，巫山神女是名義上巫山派的掌門。