中央機構：中書省，領六部，主持全國政務。樞密院，執掌軍事。禦史台，負責督察。地方行政機構：行省，行省是朝廷委派重臣到各地署事，行使中書省職權的派出機構，“行中書省”的簡稱軍事機構：宿衛軍隊，由皇帝或親信大臣直接節製。擔任京城(大都和上都)防衛的軍隊是侍衛親軍。三十餘衛，衛設都指揮使或率使，隸屬於樞密院。鎮戍軍，負責鎮守全國各地。軍隊包括蒙古軍、探馬赤軍、漢軍、新附軍等。
正一品：職官：太師、太傅、太保、中書令、中書省右左丞相文散官：開府儀同三司、儀同三司、特進、崇進、金紫/銀青榮祿大夫。爵：王。勳官：上柱國
從一品：職官：中書省平章政事、行省丞相/平章政事、樞密院/大撫軍院知院、禦史大夫、宣政院/宣徽院/太禧宗禋院院使、大宗正府劄魯忽赤、大司農司大司農、翰林國史院承旨、集賢院大學士、詹事院詹事文散官：光祿大夫、榮祿大夫爵：郡王。勳官：柱國
正二品：職官：中書省/行省右左丞、樞密/宣政院/宣徽院/詹事院同知、禦史中丞、大都督府大都督、大司農/群牧監卿、太常禮儀院/典瑞院/太史院/太醫院/將作院/中政院/儲政院/資正院院使、翰林國史/集賢院學士、奎章閣學士院大學士、侍正府侍正、內史府內史、大都/上都留守司留守文散官：資德大夫、資政大夫、資善大夫武散官：龍虎衛上將軍、金吾衛上將軍、驃騎衛上將軍內散官：中散大夫爵：國公。勳官：上護軍
從二品：職官：中書省/行省參知政事、樞密院/宣政院/宣徽院副使、通政院院使、侍禦史、大司農少卿、太仆寺卿、翰林國史/集賢院侍讀/侍講學士、奎章閣學士院侍書學士、隆祥使司/崇福司司使、詹事院副詹事、宣慰司（都元帥府）宣慰使、大都督府大都督、都護府大都護、都總製庸田使司都總製庸田使文散官：正奉大夫、通奉大夫、中奉大夫武散官：奉國上將軍、鎮國上將軍、鎮國上將軍內散官：中引大夫爵：郡公。勳官：護軍
正三品：職官：中書省/樞密院斷事官、各部尚書、治書侍禦史、奎章閣學士院承製學士、各寺卿、內史府中尉/斷事官、都漕運使司運使、各衛/各親軍都指揮使司達魯花赤/都指揮使、左右衛率府率使、都萬戶府都萬戶、上路/上萬戶府/上總管府達魯花赤/萬戶/總管、左右都威衛使司使、元帥府達魯花赤/元帥、宣撫司達魯花赤/宣撫使、安撫司達魯花赤/安撫使、招討司達魯花赤/招討使、都轉運鹽使司都轉運使、總管府達魯花赤/總管、都水庸田使司庸田使文散官：正議大夫、通議大夫、嘉議大夫武散官：昭武大將軍、昭勇大將軍、昭毅大將軍內散官：中禦大夫爵：郡侯。勳官：上輕車都尉
從三品：職官：太常禮儀院/典瑞院/太史院/太醫院/中政院/儲政院僉院、通政院副使、大司農丞、翰林國史/集賢院直學士、國子監祭酒、宣政院斷事官、侍正府參府、武備寺同判、各監太監、都水監都水監、各衛/各親軍都指揮使司副指揮使、宣慰司/大都督府同知、左右衛率府副使、都萬戶府副都萬戶、大都督府副都督、上萬戶府副萬戶、中/下萬戶府達魯花赤/萬戶、下路/下總管府達魯花赤/總管、都總製庸田使司副使文散官：大中大夫、中大夫、亞中大夫武散官：安遠大將軍、定遠大將軍、懷遠大將軍內散官：侍中大夫司天散官：欽象大夫太醫散官：保宜大夫、保康大夫教坊散官：雲韶大夫、仙韶大夫爵：郡侯。勳官：輕車都尉