南聯盟的１０多名網民在一間小屋建立了一個網站。他們每天工作１８小時，用塞爾維亞文和英文兩種文字向來自全球訪問者提供有關戰爭的最新消息。網站將南聯盟境內所有地方電台的E－mail地址公之於眾，供人們查詢親友的生死下落。後來，網站業務擴大到提供諸如北約炸彈和導彈將於何時轟炸何地等預報性消息，哪些地區電力供應中斷等最新情況，以及全球各媒體有關戰爭的報道、統計數字等。事實證明，這些信息比較可靠。同時，許多慈善組織利用網絡籌款援助科索沃難民，或者傳送相關信息以引起全球關注。比如，一個題為“致親友”的版麵上，刊登有醫生對因空襲而心靈受創傷的孩子提出的醫療建議。
互聯網使戰爭進入了一個全新時代：任何人都可以憑一台電腦、一根電話線、一台調製解調器和一個鼠標參戰。３月２７日，北約開始轟炸後的第３天，一位來自貝爾格萊德的黑客開始用他的計算機自動地反複連接北約站點，占領帶寬、拖垮係統，達到“轟炸”北約站點的目的。另一位黑客每天向北約電子郵件係統發送約２０００份電子郵件，投放了５種計算機病毒。３月３０日，一群俄羅斯黑客加入，他們在一個名為“黑客地帶”的網站上聲明對北約宣戰。這個自稱“俄羅斯黑客聯盟”的組織號召全世界同行都加入網絡戰爭，襲擊北約成員國的網址，作為對南斯拉夫人民的聲援。１２００名黑客表態參戰，對北約網絡發動不間斷攻擊。他們分別襲擊了北約總部及其主要成員國的一些電腦網絡服務器，還破壞了美國領地波多黎各的幾個網站，在網頁上寫下了反對北約轟炸的抗議口號。
美國國防部稱，在北約空襲南聯盟期間，重要軍事網站幾乎每天都受到來自黑客的攻擊。特別是在北約轟炸中國駐南聯盟大使館後，憤怒的中國黑客接連不斷地給美國國防部和美軍重要軍事指揮係統發去數不勝數的電子郵件，造成網絡因嚴重過載而中斷。南聯盟黑客高手甚至在一個有關北約的網站主頁上插上了南聯盟國旗，致使這個網站癱瘓了好幾天。
黑客攻擊的主要目標是北約總部。３月２８日，北約用來在網上發布科索沃戰況的官方站點（www．nato．int）遭到貝爾格萊德黑客攻擊，服務器在PING空數據包“炸彈”的攻擊下服務癱瘓，網站被迫短時間關閉。３月３１日，北約電子郵件係統受到黑客侵襲，服務器阻塞。４月４日，病毒使北約軍隊通信陷入癱瘓，美國海軍陸戰隊所有作戰單元的E－mail均被“梅利莎”病毒阻塞。北約在貝爾格萊德的B９２無線電廣播網、北約布魯塞爾總部的網絡服務器和電子郵件服務器也受到貝爾格萊德黑客病毒攻擊。
北約成員國受到數目不詳的黑客攻擊與入侵，遭受了不可估量的經濟損失。在戰爭後期，北約同樣實施了大規模的網絡反擊，將病毒和欺騙性信息注入南聯盟網絡係統，致使南聯盟軍防空係統癱瘓，同時竊取敵軍大量機密情報。
如果說第二次世界大戰中唱主角的新聞媒體是廣播，越南戰爭中是電視，科索沃戰爭則變成了互聯網。科索沃戰爭使世界戰爭史上第一次出現了網絡戰區。４月１９日，美國國防部副部長哈默在一個信息安全研討會上，把以塞族黑客攻擊NATO站點為代表、與科索沃衝突有關的網絡安全事件稱為全球“第一次網絡戰爭”。