這些來自於草原的異族並不精通統治的藝術，他們更願意將所有反抗勢力屠戮一空，由投降之人治理地方，隻要表現恭順、交足貢品，他們就不會幹涉當地的事務。而早已習慣於當牆頭草的西域在看到異族凶殘的屠城後，立即選擇了投降。
“黑暗的千年”，對大國來說是恐怖的千年，對西域來說，卻是安寧的千年。因為比起不起眼的西域小國，選擇了抵抗並有著巨大人口的大國更容易遭到異族的猜忌和屠殺。獨立而繁榮的一千年過後，重新崛起的大食控製了西域，作為進攻華夏的橋頭堡，可激烈的內鬥和來自歐羅巴的軍事政治壓力，使這一野心勃勃的計劃不得不夭折，而西域的支配權也隨之易主，掌握在了華夏手中。
時至今日，華夏已經統治了西域近千年，帝國在此處設西域都護府，由一門忠烈的西北馬氏出任曆任西域都護，作為西北的屏障。大食的勢力雖然退走了，但唯獨尊教的信徒卻遍布西域，他們分為兩派，一方支持帝國的統治，另一方則采取完全相反的態度，誓要讓西域重歸獨尊的懷抱，而西域也成為了華夏領土中最不穩定的一州。命馬氏鎮守此地，也是帝國的無奈之舉，尋常人根本無法控製局勢，也隻有累世威名的將門和精忠報國的世家才能夠穩住，馬氏無疑是最佳人選。而事實也證明，這一開國以來的國策並沒有錯，在馬氏恩威並施的治理下，不但本地的反帝國派不敢造次，就是外國也無法對西域之地虎視眈眈，帝國的控製力在節節攀升，越來越多的唯獨尊教民選擇擁護帝國。
居住在大戈壁邊的巴依老爺就是其中的代表。身為西域豪門之一的巴依不但對本地人樂善好施，還親切地對待華夏人，逢年過節，他都會備好熱騰騰的飯菜去看望駐守邊疆的戰士，與他們同吃同樂。為此，巴依不但多次受到帝國的嘉獎，成為團結親善的旗幟，更與馬氏的宗主私交深厚、稱兄道弟，可謂西域炙手可熱的人物。
但巴依的另一個身份卻鮮有人知，他不但是獨尊之劍的成員，更是反帝國派的總領導人。在西域發生的反抗運動，十有八九出自於他的手筆。在巴依奢華的大宅之下，建有一個巨大的地下宮殿。據說，這是一個王國秘密建造的貴族避難與藏寶之處。巴依的父親偶然間發現了此處，並大發橫財，一躍成為了反帝國派的首領。加入獨尊之劍後，巴依的父親舉行了一次規模浩大的反抗襲擊，在與馬家軍交戰中飲彈而亡。在忠誠的侍衛的掩護下，他的身份並沒有暴露，並成功被轉移回家，秘密安葬，不知情的人得到的信息是暴病而亡。巴依繼承了父親的一切，但沒有繼承強硬的策略，在精心扶植小的反抗組織的同時，他極力將自己打造成帝國在西域的一麵招牌，增強自己對此地的影響力，伺機而動。
此時，可敬的巴依老爺正在用他平時對華夏親切和善的嘴臉，高聲疾呼著：
“獨尊忠誠的子民們！我最親愛的兄弟們！時機已經來臨了！準備起來，行動起來！拿出你們的武器和勇氣，將獨尊的敵人，該死的帝國，驅逐出神聖的西域！這裏，必須重新沐浴在獨尊的榮光之中！”