據我所，喜歡使用這名稱者是錢念劬，即錢玄同的老兄，發明者即使不是他，也總是他們同時的幾個新外交官吧，但是從喜歡開玩笑的這一點看來，大概還是他頂有這可能。”雖說從名稱上，1901年時總理衙門已改為外務部，但徽號針對主事者奕匡一派而發仍是大致沒錯。
丁未政潮最後以瞿鴻禨、岑春煊的被逐結束。不過錢恂畢竟是這一團體的邊緣成員，對他的直接影響並沒有立刻顯露出來。
一年之後錢恂由出使荷國大臣並保和會會議大臣，被轉任出使意大利大臣，並被賞二等第一寶星。不過隨著朝中光緒、慈禧死後滿漢權力新一輪的重新分配，錢恂的日子越來越不好過，屢受京城中外交部主事者的掣肘，在宣統元年農曆四月，曾發生了他的疏折被挖改日期，調換折封的事件。錢恂對此似乎非常惱火，連續谘呈外務部與軍機處，要求查清。此事不知後果，但隨後他又被穿小鞋，屢有疏折被扣壓。3個月後，錢恂被開缺，“著來京另候簡用”。此時，宦海浮沉20餘年的錢恂對於做官已心灰意冷，先是向朝廷請假3個月，要求回籍修墓，假期滿以後，又告病不出，上疏折“可否乞骸骨，準在江浙等省擇地就醫”。疏折上朱批“知道了”，於是錢恂回老家湖州開始歸潛生活。
4.歸潛
錢恂在湖州，住在陸心源的潛園。這是他半生遊宦生涯後，首次在家鄉長住。當年也曾留學日本的湖州地方士紳沈譜琴以晚輩禮執，請他代理過一個月的湖州府中學堂的監督。錢恂也頗不客氣，上任後就去聽老師的課，還大發意見。因為老師們挨了批評罷教，錢恂就叫弟弟錢玄同代國文，兒子稻孫代英文。辛亥革命時，湖州光複，錢恂曾出任湖州軍政府分府民政長，時沈譜琴是軍政府都督。
不過和大部分有過洋務維新經曆的上一代人一樣，錢恂一輩對革命的感情是喜憂參半的，錢稻孫後來寫此情節時說，“九月湖屬群匪盜乘機蠢動，先君被推出任湖州民政部長，郡屬賴以鎮定”。此種敘述口氣，今天看來略顯刺目，但卻在客觀上說出了辛亥地方革命的情形，也在主觀上說出了錢恂輩當時出山的心態。錢恂很明顯對這樣的職務不感興趣，鎮定地方的作用完成後，錢恂很快辭職。1912年2月至11月，錢恂任浙江圖書館首任館長（先稱總理，後改館長），對浙江的圖書古籍保護多有建樹，後發起對文瀾閣《四庫全書》的補抄，被稱為“乙卯補抄”。
1913年錢恂又赴北京，此後先後任過的職務有：1913年任職教育部社會教育司，時其婿董鴻禕任教育部次長，兒子稻孫在普通教育司任主事，好友夏曾佑是社會教育司的司長，同事有魯迅；同年被征為袁世凱總統府顧問；1914年任參政院參政，是年6月，參政張蔭棠、勞乃宣辭職，以錢恂、楊度代之；1917年任北京大學國史編纂處纂輯股纂輯員，是為蔡元培所聘，雖說意見不盡相同，但蔡元培對當年老師的兒子，還是要照顧的。在國史編纂處的同事有劉師培、屠寄、張相文、葉瀚、沈兼士、周作人等，屠寄、葉瀚均為其在張之洞幕時的舊知好友。稻孫述其父晚年“卜寓京師，自是於國政罕所可否，纂輯多舊文，亦未刊行”。
1927年2月24日，錢恂病逝於北京，其弟錢玄同所撰挽聯為：“卅載周遊，用新知新理，啟牗顓蒙，具上說下教精神，宜為國人所矜式。一生作事，務自潔自尊，不隨流俗，此特立獨行氣象，永詒子弟以楷模。大兄不死。”而錢恂生前自製挽聯為：“不亟求官已三世於茲，此保泰良方，願後嗣毋忘祖範；創議留學而五倫受毒，乃畢生憾事，盼兒曹稍蓋吾愆。”這則挽聯也由錢玄同書寫，錢玄同在2月25日的日記中寫，“在那邊寫了一副大兄自挽聯，雖然與我的宗旨正相反對”。兩相比較，其中的明顯差異，頗得晚年錢恂思想所歸之處。
二、錢恂著述考釋
1887年，尚未出道的錢恂還在薛福成幕中，父親的朋友譚獻在日記中這樣評價他，“招念劬來長談。雖學不純美，性又偏至，而銳敏有才識，固非凡才，於錢氏為鳳毛駒足也”。如果不考慮譚獻的其他主觀情感因素，性格偏至而學識雜駁的判斷倒確實是錢恂的特點。