水生蔬菜主要有茭白、蓮藕、慈菇和芋頭等。水生菜田與旱地菜田環境不同，田裏一般有水層，危害的雜草也多為水生和濕生雜草，所以除草劑也要適於有水條件。
1．茭白田化學除草技術
茭白依品種不同分為春、夏季種植，並在田間以地下休眠根莖越冬至初夏采收結束。主栽茭白品種春季定植後於當年秋季至翌年各收獲1次，生長期長達1年以上。茭白在定植後及越冬期均有大量雜草發生，人工除草用工量較大。茭白春、夏季定植後發生的雜草基本上與水稻田相似，越冬期雜草則與麥田、油菜田雜草相似。
（1）春夏定植茭白田。茭白與水稻一樣同屬禾本科作物，春、夏定植時其生長環境和雜草發生危害與水稻極為相似。所以，適用於水稻田的某些除草劑，能用到茭白田中進行雜草防除。可選用的除草劑有丁草胺、苄嘧磺隆（農得時）、惡草酮（惡草靈）、惡及其他複配劑等。
（2）茭白越冬期。茭白越冬期是茭白一生中雜草發生最嚴重的時期，由於此時茭白地上部分枯死，地下根莖處於休眠狀態，故采用莖葉處理劑或滅生性除草劑不會對茭白產生藥害，而且除草效果好。可選用的除草劑有百草枯（克蕪蹤）、草甘膦和精氟吡甲禾靈（精蓋草能）等莖葉處理劑。
2．蓮藕田化學除草技術
一般要在蓮藕栽後7～10d，氣溫升至25℃以上，水溫穩定在20℃時，以藥土法將藥劑均勻撒於田中，可選用的藥劑有撲草淨、丁草胺。
（1）撲草淨。50％撲草淨可濕性粉劑40～50g／畝，與15～20kg細潮土拌成毒土，於栽藕後7～10d撒入田中。撒藥時田間應保持3～5cm水層，用藥後保水5～7d；藕芽不可浸在水中。
（2）丁草胺。60％丁草胺乳油100mL／畝，與15～20kg細潮土拌成毒土，於栽藕後7～10d撒入田中。撒藥時田間應保持3～5cm水層，用藥後保水5～7d；藕芽不可浸在水中。
3．慈菇、芋頭田化學除草技術
這兩種水生蔬菜田化學除草，也可以藥土法撒施藥劑，一般使用丁草胺。60％丁草胺乳油100mL／畝，與15～20kg細潮土拌成毒土，於移栽後7～10d撒入田中。撒藥時田間應保持3～5cm水層，用藥後保水5～7d。