傑克跑出了食堂，羅伯特、丹尼和勞拉看見向外瘋跑的傑克，不知道發生了什麼，丹尼說傑克和賽門肯定是鬧翻了，然後喊著傑克追了過去，勞拉看看傑克又看看羅伯特不知道該如何是好，羅伯特沉默著，臉色蒼白。傑克一直向飛機場跑去，他跑著跑著，終於氣喘籲籲地停了下來，他看著遠方的天空上飛翔的飛機正準備著陸，空曠的機場讓他倍感孤獨，他想念父母，不知道賽門說的是不是真的，他決議要弄清真相，看看羅伯特是不是真的在騙他。
“傑克！發生了什麼事？”丹尼氣喘籲籲地趕了過來，兩人歇了好一會。
“丹尼！我們是克隆人對嗎？”傑克。
“對，怎麼，賽門說了什麼歧視的話？克隆人怎麼了？克隆人沒什麼不好，我們擁有和他們相同的一切，而且我們都是成功者，比他們優秀，他是在嫉妒我們，如果他膽敢歧視克隆人，我們就聯合起來控告他，或是狠狠揍他一頓。”丹尼。
“不，不是歧視!”傑克。
“那是什麼？”丹尼問完，傑克一言不發，這時羅伯特和勞拉坐車過來了，丹尼向車輛示意他們在這裏，車輛停了過來，羅伯特下車走向傑克。
“不知道怎麼了，賽門好像說了歧視克隆的話人，他傷到了傑克。”丹尼解釋到。
“傑克，我們回家吧！”羅伯特對傑克說道，傑克看著羅伯特，心情複雜。
飛機上，丹尼和勞拉輪番安慰沉默不語的傑克，不一會兒兩人又開始對一些不同的觀點喋喋不休地討論起來，傑克始終雙目無光，大腦空白，隻想著去看看他的父母，看看他們是否真的存在，羅伯特在最後一排靜靜地坐著，目光凝重，然後他閉上了雙眼，似乎疲憊不堪。
飛機降落在了柏拉圖基地。夜晚，傑克一個人來到了克隆中心，進入了經常看父母的那間H8連接室，這裏沒有監測人員，傑克緩緩走向了那個熟悉位置，他依然能透過連接艙上麵的一個小窗口模模糊糊看見父親的臉，而左邊的連接艙是他母親，傑克看著連接艙上紅色的按鈕，他伸出了伴隨緊張的心跳而顫動的手，緩緩伸向了按鈕，他鼓起勇氣地按了下去，可是連接艙並沒有自動打開，而是什麼反應都沒有，傑克連續的按著依然沒有反應，他又試了試另一台，同樣沒有反應，他發瘋一般狂躁的擺弄著連接艙，正在這時，羅伯特來了進來了，傑克看見羅伯特，向他大喊。
“我要打開它！現在就要打開！不然我就要用暴力了！”傑克憤怒地吼道。
羅伯特什麼話都沒有說，隻是走了過來，他站到了兩台連接艙的中間，然後同時伸出雙手分別按在了紅色按鈕上麵，他低著頭軟弱的站在那裏，就像個釘在十字架上的罪人，數秒後，兩個連接艙的紅色按鈕都亮了起來，連接艙門緩緩抬起。傑克頓然一驚，連接艙蓋頭部位置上的小窗口中父母的臉居然和蓋子一起掀開了。傑克詫異的走向了另一側，他看見原來兩台連接艙竟然都是空的，艙蓋上的小窗口隻不過是顯示器罷了。
“這是為什麼？”傑克問這低頭不語的羅伯特，聲音顫抖。
“為了能讓你安心工作，暫時沒有告訴你實情！這一切都是為了你，為了人類！”羅伯特。
“你一直在騙我！可我是那麼敬重你！”傑克。
“抱歉，傑克！”羅伯特。
“為什麼我是個克隆人！原本正常的生活都是騙局！這一切都是你造成的！我恨這裏！我恨這裏所有的一切！”傑克失控地喊道，羅伯特隻是呆呆地看著傑克，
“抱歉是我喚醒了你，改變了你原有的命運，那邊有輛輪椅，帶上上麵的頭盔你就可以進入夢裏見你父母了，以後你隨時可以回到夢裏去看你的父母了！”羅伯特。
“不！”傑克非常悲痛。
“我懇求你不要告訴其他幾個克隆人！”羅伯特低聲懇求到。傑克用傷心的眼睛看著羅伯特左右搖頭，然後跑了出去。羅伯特依然站在那裏顯得非常自責。
傑克獨自躺在床上，濕潤的雙眼一眨不眨。傑克和其他克隆人的關係都恨要好，他沒想要泄露這一秘密，他覺得克隆人非常可憐，背負著如此沉重的重任，還要被人類欺騙蒙在鼓裏，他非常同情丹尼、勞拉和埃裏克與自己有著同樣不公的命運，傑克此時的心情消沉到了極點。
正在這時，手環顯示有電話呼入，是賽門，傑克沒有接通，一會兒，發亮的手環停止了震動，然後變成了了橙色，手環上顯示有一條新的留言。傑克按了播放鍵。
“嘿，傑克，還好嗎，我是賽門，我知道今天的事也許有些突然，但希望你能冷靜麵對，你放心我是不會告訴別人。你知道嗎，我父母在我年幼時就都死了，我父親臨死前對我說：‘隻要你活著，我就永遠存在！’而我現在知道了，隻要那些該死的蟲子還活著，我們就得死！過去的事就讓它過去吧，重要的是我們需要你，方舟需要你。”留言播放結束了。傑克聽完緩緩閉上了眼睛。
傑克在疲倦和悲痛中睡著了，他不恨羅伯特，他恨他自己，恨他的過去，恨人類的過去，恨這個變態的世界，此時他心中最大的願望就是盡快結束這一切。
第二天，傑克與賽門通了電話，表示自己願意全力配合賽門的行動，進軍美國，但是申明這是工作，不代表就和賽門是一夥的，隻自己的目標與賽門一樣而已，賽門說可以理解，畢竟傑克也知道賽門也不是善類。賽門接著說道：“對了！羅伯特沒有告訴你這件事，看來其他克隆人也都蒙在鼓裏，你要小心別讓羅伯特知道你已經發現了這個秘密，這會對你不利的，據我所知他已經在夢中開始尋找新人了，好像是和你同樣專業的，為了你的安全，你還是小心點吧！”
“謝謝你的忠告，羅伯特已經知道了，他也恨傷心，這不怪他！我自己的事情我會處理好的。”傑克。
“那就好，傑克，我有個提議！把整個實驗室搬到波塞頓基地來，這樣方便工作，而且……”賽門。
“不必了！在這裏工作沒什麼不好！”傑克。
“好吧！”賽門。
忙碌工作的一天結束了，傑克埋頭研究針對蚜蟲的基因武器，他偶爾碰見羅伯特也家裝沒有看見。一旁的丹尼和勞拉也不知道發生了什麼，問傑克，傑克也不說話。
晚上，傑克入睡了，在半夜裏，他的眼珠微微動力動，一個夢開始進入了他的大腦。傑克夢見他躺在一個打開的連接艙裏，渾身麻木，四肢動彈不得。突然，上麵有一個人伸過頭來在看著他，那是羅伯特的臉，他麵無表情，雙手扶著連接艙蓋緩緩向下壓去，艙蓋漸漸蓋了下來，黑暗籠罩在四周，傑克仿佛要被埋葬……這時，傑克猛然驚醒，呼吸急促，滿頭大汗，他意識到隻是場噩夢，此時夜晚依然漆黑一片，傑克漸漸放鬆下來，躺下後繼續睡去。
一天早上，傑克、賽門和幾個士兵一同走進了辦公中心，羅伯特正在一個工作人員那裏看數據，他看見他們走來，不知道發生了什麼！
“羅伯特，消滅蚜蟲計劃批準了，為了能抓到更多昆蟲用於實驗，我決定要把整個實驗室搬去波塞頓基地！”
“什麼！你要搬走！這不行，我拒絕執行這一計劃！”羅伯特板著臉說道。
“恐怕不由你了，羅伯特教授！現在傑克是這裏的一把手了，你現在隻負責克隆中心了。”賽門說著，把一個GID點亮，放在了桌子上，GID顯示了國防部的人事變動文件。傑克目光鎮定地看著羅伯特，而羅伯特半張著嘴，一臉茫然說道：“這……你們不能這樣！”
不久，實驗樓與其他建築物的連接通道收了起來，成了一個獨立的建築，一架大運輸從天降落，在整棟實驗樓頂的半空中懸停了下來，然後從飛機上放下了許多鋼筋繩索，幾名士兵把繩索固定在了建築的多個掛點。
實驗樓裏的大部分科研人員也都隻好隨傑克一起搬去波塞頓基地，隻有羅伯特、丹尼和勞拉留了下來，他們三人站在外麵，看著自己熟悉的實驗樓要被搬離，心裏很不是滋味，傑克勸說丹尼和勞拉也一同過來，但是他們不願意與賽門合作，依然要留在羅伯特這邊，傑克在實驗樓裏原來羅伯特的那間辦公室中透過窗戶看著下麵的三人，然後轉身離開了窗戶。這時，樓頂的士兵已經掛接完成，他們做出示意的手勢，大型運輸機開始緩升，所有鋼筋繩索漸漸地被拉緊，發出嘣嘣響聲，整頓樓被拉了起來，升至距離地麵5米高。然後砰地一聲巨響，建築物底部的引擎開始點火，數個推進器開始工作，實驗樓就像個粗壯的火箭一樣開始懸浮，底部藍紫色的火光射向地麵，騰起一股塵埃，就這樣，飛機開始把整頓樓帶離裏這裏，飛往波塞頓空軍基地。
羅伯特三人無助地站在地麵抬頭望著飛機，實驗樓底部的推進器噴射出的強烈氣流吹得他們三人眼睛眯成了一條縫，頭發也亂飄不止。一會兒，實驗樓遠去了，他們隻好回到了空蕩蕩的柏拉圖基地的辦公中心。
兩個小時後，實驗樓穩穩的落在了波塞頓基地裏，傑克開始潛心研究針對蚜蟲的基因武器，波塞頓基地為他抓了各種各樣的變異昆蟲供他研究。一切都不停地運轉忙碌著，傑克在瘋狂忘我的工作中似乎找到了新的自我，其他科研同事看到傑克如此玩命的工作也都各個奮力工作，埃裏克曾經勸過傑克，也建議讓他多聯係聯係羅伯特他們，可是傑克根本聽不去。
不久，對付蚜蟲的基因殺蟲劑研發出來了，並且經過了實驗，效果很好。賽門馬上組織飛機開始對新西蘭的大蚜蟲進行大麵積噴灑，不出1個月，蚜蟲被消滅了，大量的植物重新供應了新西蘭的養殖業，一切都很順利。
傑克馬不停蹄開始繼續研發其他品種的基因武器，他現在完全認為生命和物種就是要優勝劣汰，弱肉強食，不論再冒出什麼怪物出來，他都要把他消滅。