從10月6日起至12月5日。中心任務是反“掃蕩”。我各地軍民普遍實行堅壁清野，以正規軍和遊擊隊相結合、遊擊戰和運動戰相結合，轉戰於群山峻嶺之間，到處打擊敵人。敵如盲人騎瞎馬，處處挨打，苦不堪言。10月26日，敵36師團岡崎大隊600餘人竄至武鄉關家堖一帶，被我385旅、386旅、新10旅和決死縱隊兩個團的絕對優勢兵力所包圍。彭德懷副總司令、劉伯承師長、鄧小平政委等親臨前線指揮，經兩晝夜激戰，四次肉搏，將敵大部殲滅。敵遺屍280具、屍灰3大堆，隻有據守核心陣地的殘敵在援軍接應下倉皇逃走。“掃蕩”太行區的敵人，遭到了極為沉重的打擊。“掃蕩”我晉察冀平西、北嶽和晉西北、大青山、冀中、冀南等地之敵，也都遭到了相同的下場。至12月5日，敵人的報複“掃蕩”被粉碎，曆時三個半月的百團大戰至此結束。在此期間，蘇、魯、皖、豫境內的八路軍自戰役第二階段開始，也向各自境內的敵交通線和據點進行了襲擊，配合了百團大戰。
百團大戰共進行大小戰鬥1824次，斃傷日偽軍約25800餘人，破壞鐵路470多公裏、公路1500百多公裏，破壞火車站和橋梁200多座，摧毀200多個據點和大量敵堡，繳獲各種火炮50多門、各種槍支5800多件以及一批軍用物資。
百團大戰，是八路軍在華北地區發動的一次大規模的進攻戰役。它使全國軍民看到，八路軍在極為困難的條件下，不僅發展壯大起來，而且能夠給敵人以強有力的打擊。這次戰役振奮了全國人民爭取抗戰勝利的信心，以事實駁斥了頑固派對共產黨、八路軍“遊而不擊”的誣蔑，鍛煉了人民軍隊，提高了共產黨和八路軍的威望，對堅持抗戰、爭取時局好轉發揮了積極作用。
艱苦卓絕的中國戰區
在中國大陸地區，日軍殘酷的大掃蕩反複在華北中共軍隊的根據地進行，敵後抗戰進入最為艱苦卓絕的時期。
1941年前後，日軍對華北地區連續5次實施了治安強化運動。日軍所到之處，燒殺搶掠，無惡不做，殘暴的“三光”政策(燒光、殺光、搶光)使許多原本富饒繁華的村莊變成了斷壁殘垣的“無人區”。對此，他們沒有退縮，同日軍進行不屈不撓的戰鬥。
盤山抗日根據地的鞏固和發展
麵對盤山抗日根據地殘酷的鬥爭形勢，冀東軍分區堅決執行中共晉察冀分局和軍區的指示，以內外線配合的有效方式，不斷給敵人以重大打擊，粉碎敵人的“掃蕩”。
1940年底到1943年初，敵人對盤山根據地進行了多次大規模的摧殘，在盤山周圍製造了花峪慘案、聯合村慘案、五盆溝慘案、辛莊子慘案、吳家窪慘案、小現渠慘案、雙楊樹慘案、上倉慘案、竄嶺廟慘案等等。
1940年底，敵人每天出動數架飛機，狂轟濫炸，盤山周圍的數10個村莊，及1000多間民房毀於戰火，山上曆代修建的近百座名刹古寺蕩然無存。
1941年初，駐平穀日偽軍到盤山花峪搜查八路軍，敵人對群眾用盡了酷刑，但是花峪人民始終沒有暴露一個字。最後，敵人將花峪僅有的八間民房全部燒毀，又把群眾逼進三間草房，四麵堆上幹柴，隻見濃煙滾滾，烈火衝天，48名群眾全部遇難。這就是聳人聽聞的花峪慘案。時隔半年，敵人又製造了聯合村慘案，6月18日，13團政治處主任洪濤和10名戰士隱蔽在聯合村，被敵特探悉，敵人將未能突圍的3名戰士和15名群眾捆綁在樹幹上，澆上汽油，活活燒死。這是侵略者對盤山人民欠下的又一筆血債。然而，敵人的野蠻殘暴，並沒有嚇倒盤山人民，他們掩埋了親人的屍體，繼續同敵人鬥爭，不少青壯年帶孝參軍，石匠們冒著生命危險，在盤山的巨石上刻出了“打倒日本帝國主義”、“誓雪國恥”等豪言壯語。我主力部隊為了保衛根據地，同敵人展開了浴血奮戰。從1941年到1942年秋，僅一年多的時間內就發生了大現渠戰鬥、十棵樹戰鬥、丈煙台戰鬥、果河沿戰鬥、南賈莊戰鬥、木馬莊戰鬥、洪水莊戰鬥等規模較大的保衛戰，攻克了數十處敵偽據點。在果河沿戰鬥中，我軍全殲了號稱“模範治安軍”的第四團，擊潰了增援的第三團，俘敵千人，繳獲軍用物資數車。這次戰鬥，使偽治安軍一蹶不振。
盤山前有個小孫各莊據點，坐落在京（北京）喜（喜峰口）公路上，扼守東西要道，是盤山通往平原的關卡，敵人在這裏重兵把守，經常出擾盤山，我軍13團決心拔掉這顆釘子。1941年4月25日夜，包森率兩個連對敵人據點發起攻擊，40名守敵憑碉堡頑抗，我軍用炮火猛烈轟擊，經過艱苦的奮戰，最後用土坦克將敵人碉堡炸毀，全部殲滅敵人。這次戰鬥，掃除了盤山與平原之間的障礙，進一步加強了根據地與基本區之間的聯係。在這期間，我軍主力部隊與地方武裝並肩作戰，粉碎了敵人一次又一次的掃蕩，使盤山根據地巍然屹立在冀東敵後。