江戶的警察、特工
之前不止一次提到，德川家康經過“平生第一艱難之事”的伊賀越之後，為了表彰服部半藏正成及伊賀忍者的巨大功勞，挑選出200餘名忍者組成諜報機關“伊賀同心組”，並由伊賀上忍服部半藏正成任組頭。而至此，被後世所周知的“忍者”這一稱謂，終於正式被德川家康確立了下來。德川家康為什麼要將這些人命名為“忍者”呢？這與德川家康得到天下最主要的一個因素有關——忍耐。
由此看來，《多啦A夢》中的機器貓的“忍術即是忍耐之術，忍者即是忍耐之人”的說法也頗有道理。
德川家康可謂一生波瀾不驚，前半生完全是在忍耐中度過的。雖然生於大名之家，但自幼便過著屈辱的人質生活；之後雖然終與織田信長同盟而得以獨立，但也依舊不過是屬下身份；本能寺之變織田信長隕落之後，天下又落於豐臣秀吉之手，他依舊在秀吉手下忍耐；攻下小田原城後受封至關東地區，人生地不熟，他依舊在默默忍耐。忍耐中伺機而動，不斷地壯大自己的勢力，最終他終於在忍耐中取得了機會，稱霸天下。雖然很多人都把德川家康蔑稱為老烏龜，諷刺他是等待強勢之人相繼故去後借助長壽的原因才湊巧獲得了天下，但也有一部分智者，把德川家康比喻為杜鵑，久居他人巢穴之中，待羽翼豐滿之後一鳴驚人。
巧合的是，忍者的處世哲學也是如此——所有的精髓都集中在一個忍字。在黑暗中、在艱苦的環境中，忍者默默地隱藏忍耐，觀察敵人並伺機而動，當時機成熟時，一鼓作氣完成任務。或許，德川家康比其他大名更加偏愛忍者的原因，正是因為這種奇妙的處世原則而產生的惺惺相惜吧。
經過關原大戰，德川家康開創了德川幕府，日本也進入了相對和平的江戶時代。服部半藏正成所帶領的“伊賀同心組”，戰後也逐漸將工作的重心從謀略諜報轉移到了警衛密探。一大部分忍者，被派往各藩負責監視偵察的工作。隻要有人膽敢不利於將軍或反叛幕府，這部分忍者會馬上將消息反饋給幕府，將謀逆者逮捕並處理掉。而另外又有相當一部分忍者，被委派在江戶城內從事保護幕府安危的警衛工作。在德川家康搬至江戶城之後，服部半藏正成帶領“伊賀同心組”一直負責著江戶城西門的警備，也因為這個原因，西門到現在都還有“半藏門”的稱呼。
服部家的敗落
1596年12月23日，傳奇忍者服部半藏正成離世。正成的長男，服部正就繼承了父親半藏和石見守的稱謂，成為服部家的家督，繼續領導伊賀同心組成員共200餘人。然而，正就不同於他的父親正成，生性昏庸自大。在戰國時期赫赫有名的忍者家族——上忍服部家，也因此逐漸敗落。
服部正就的昏庸自大，源自他對局勢的錯誤認知。江戶時代與戰國時代完全不同，早已不是原本的雇傭軍製度，忍者被幕府劃分為一個官僚機構。而服部正就卻依舊認為自己身為上忍服部家的家督，其他忍者都是自己的家臣，所領導的“伊賀同心組”完全屬於自己的私物。
正因為服部正就錯誤的定位，他與“伊賀同心組”眾忍者的距離越來越遠，矛盾也越來越深。終於，因為服部正就的昏庸自大，最後爆發了忍者的政變。
1605年，“伊賀同心組”發動了反對服部正就的騷亂，“伊賀同心組”的成員、家人親戚近千人集結據守在四穀長善寺，要求德川幕府罷免正就的職位並解除他的上忍地位。服部正就最後在強大的政治壓力下，不得不請辭。家康同意了服部正就的辭職，解除了他的兵權，改封了領地，將正就貶為平民，寄食於正就的夫人——家康的侄女鬆尾家。而在這之後，這場騷亂中“伊賀同心組”的10個主謀忍者被幕府處以死刑。
服部正就畢竟是被迫辭職，他心中還是依舊向往著曾經的名利地位。於是，服部正就為了挽回曾經的名譽與地位，參加了德川幕府與豐臣家最後的決戰——大阪之陣。但是，在冬之陣與夏之陣這兩場激烈的戰役之後，服部正就失蹤，下落不明。一般都認為正就是在與豐臣的真田忍者軍團的戰鬥中被殺陣亡，但在戰役過後，人們卻沒有在陣亡者中找到服部正就的屍體。服部正就究竟是生還是死，至今也是一個謎，就如同他的忍者身份一樣。
之後，服部正就的胞弟服部正重繼承了服部家的家督地位和半藏的稱號。服部正重的各方麵能力，要遠強於他的哥哥正就。早在1600年關原大戰的初次上陣，他就深受德川家康的賞識。據史料記載，在關原大戰的前一天晚上，家康眾重臣在帳內接受招待。在酒宴之中，服部正重聽說了自己的父親正成在初次上陣的活躍後，暗中下定了決心。在翌日的合戰中，服部正重獨自一人侵入敵陣，出其不意攻其不備，摘取了對方侍大將的首級。由此足見服部正重和他的父親一樣，也擁有著很強的能力和謀略。