50餘人竟然能使約12萬的明軍閉門不戰！究竟是怎樣的神兵能有如此震懾力？這個場麵，與當年伊勢義盛13騎降伏3000騎一樣，被曆史的洪流衝刷得撲朔迷離，化作忍者傳說中又一個無法解開的謎團。
為何忍者突然興起
通過這些與忍者有關的史料，我們不難看出：作為出色的戰爭兵種，忍者在鐮倉末期、室町南北朝時期這些戰爭不斷的年代卻沒有太大的作為。在這些時代，武士作為戰爭和亂世傳說中主角的地位一直延續到室町時代末期也都沒有改變。然而，在1467—1477年的這10年時間，一個曆史事件成為後來忍者興盛的開端。之後，忍者開始正式登臨曆史舞台，以一種獨特姿態活躍在各種事件中，在戰爭中的重要作用也開始真正展現出來。
作為忍者興盛開端的，正是室町幕府第八代將軍足利義政在任時所發生的“應仁之亂”。
應仁之亂是應仁元年至文明九年（1467—1477年）發生於日本室町幕府第八代將軍足利義政在任時的一次內亂。主要是幕府三管領中的細川勝元與四職中的山名持豐等守護大名的爭鬥。其範圍除九州等部分地方以外，戰火遍及其他日本國土。這一動亂，也使得日本迎來了長達一個世紀的戰國亂世。
日本自鐮倉時代後期開始，以名門武家、公家為首的舊勢力，不斷被隨生產力上升而壯大的商人、地主等社會階層取代已有權益。由守護大名合議製組成的聯合政權室町幕府中，除了三代將軍足利義滿以外，權力基礎都十分脆弱，同時守護大名也自身難保，他們的權力漸漸受到守護代或家臣的削弱。
亂世之源
“應仁之亂”的起因，也正是因為新舊勢力的更替所造成的。這個貫穿整個室町時代的矛盾，也隨曆史積累而爆發了出來。室町幕府統治時期，三代將軍足利義滿、四代將軍足利義持，他們不但平定了守護大名的叛亂，還成立了擁護將軍統治的宿老政治。
1441年六代將軍足利義教在嘉吉之亂中被殺，其子足利義勝9歲便接替成為七代將軍。
足利義勝在任不到一年便去世，結果義勝的二弟足利義政被管領家的富山持國推選，在8歲繼承了將軍的職位。
1449年，足利義政成為室町幕府第八代將軍，他耽於酒色，不理政事，導致社會動蕩，各地不斷發生暴動，將軍權力逐漸衰落，幕府實權旁落重臣和實力強大的守護大名細川勝元、山名持豐（又名山名宗全）等手中。義政早年無子，1464年以弟義視為繼嗣，以細川勝元為保護人。次年其妻日野富子生子義尚，以山名持豐為保護人。二者爭奪繼嗣地位的鬥爭，使中央勢力發生分裂。在守護大名各領國內，地方領主力量也不斷擴大，並幹預守護大名的繼承糾紛，因而守護大名的勢力也發生分裂。以細川勝元和山名持豐的對立為中心，中央與地方封建勢力的分裂日趨激化。1467年1月18日，山政長和山義就在京都發生武裝衝突，山名持豐獲勝。以此為導火線，細川勝元和山名持豐各自調集援軍進入京都。細川方麵有斯波義敏、山政長、赤鬆政則、京極持清等，大本營在將軍駐地幕府，稱東軍。山名方麵有斯波義廉、山義就、一色義直、六角高賴等，大本營在幕府以西的山名持豐邸，稱西軍。5月26日，兩軍開始大戰。最初東軍稍強。8月，大內政弘率軍2萬東上京都，支援西軍，10月激戰於相國寺，未決勝負。此後京都地區的戰鬥進入膠著狀態，戰亂逐漸波及地方。戰爭中，東軍控製將軍足利義政、後土禦門天皇和後花園上皇，西軍則控製義視和南朝的後龜山天皇之重孫，雙方均以自己為正統，稱對方為賊軍。
長期戰亂極大地消耗了雙方的實力。地方武士則借機擴大自己的領地，爭奪領國統治權，有的甚至企圖奪取守護大名的地位，在京都作戰的守護大名對此深感不安，因而出現厭戰情緒。1472年，兩軍首腦開始和談。1473年，持豐和勝元相繼死去，和談加速進行，次年4月一度達成和議。但因赤鬆政則、畠山義就和大內政弘反對，未能實現。1477年9月，畠山義就由於領國不穩率軍返回河內。大內政弘也在幕府重新承認他對周防、長門、豐前、築前等領國的統治權後，於11月率軍退出京都，戰亂基本結束。在應仁之亂中，京都大半化為焦土，相國寺等古建築與許多藝術珍品遭到破壞，人民飽嚐離亂之苦。戰亂後，幕府將軍、守護大名和莊園領主貴族的力量更加衰弱，日本曆史進入新興的戰國大名互相混戰的戰國時代。
“應仁之亂”——忍者興起的深層原因
這長達10年的“應仁之亂”，徹底改變了日本的曆史走向，帶來的社會波動之大也是空前絕後的。除了九州等部分地區以外，戰火蔓延至全日本。也正因為這一動亂，使得幕府、守護大名等的政治地位與政治格局產生了巨大的變化：幕府將軍和幕府分封在各地的擔任守護職務的大名威信下降，原本輔佐守護大名的守護代、各地土豪甚至平民崛起成為大名。各地大名進而稱霸一方，甚至於成為掌控天下的“天下人”，一時間群雄四起，各自占地為王。這種稱為下克上的效應不斷在全國擴散，守護大名們轉化為戰國大名，日本的室町時代逐漸步入戰亂期，時人稱為戰國時代。殘存下來的莊園製度等舊製度開始迅速瓦解，新的勢力逐一登場。