一個清晨，代表一個新的開始。
關東地區的某個小鎮，也就是真新鎮。
真新鎮的某處草原上，一棟木屋裏，住著一人一神奇寶貝。
房間內，一個長相普通的黑發少年靜靜地正躺在他的床上，而他正是本篇故事的主角，夜神。
清晨的太陽光從房間的窗戶照射了進來，為房間內的萬物做出新一天的開始。
「嗚……早上了嗎？」
夜神睡眼惺忪的睜開他那紫色的雙眼，感受著太陽光。
夜神今年的年齡為17，是個正直青春年華的年紀，然而他的願望是「跟一大群蘿莉有不健全的關係！」，簡單來說，他就是一名蘿莉控變態！（夜神：「剛剛的語氣是在鄙視我嗎？！絕對是在鄙視我沒錯吧！！」）
他同時也是擁有一身奇特能力的穿越者，不管是劍術、法術、武術，他都有學到高峰『過』。
沒錯，剛剛用的就是『過去式』。
──14年前，他還呆在自己原本的世界的時候，夜神曾想要去有蘿莉的世界好收齊一大堆可愛的蘿莉，然而他一開始所想的就是要去『零之使魔』的世界。
但是這也隻是空想，因為他知道自己根本就沒有能力，自己也長的一張普通的臉蛋，想要可愛的小女孩迷上他，根本就不可能。
雖然這樣，不過當時的夜神卻是知名的漫畫家，他的漫畫『我與蘿莉的戀愛之旅』成為大眾喜愛的漫畫，特別是在青年之間特別有名。
這樣的他，有一天收到了奇怪的匿名信。
信上寫說是神仙寄來的，並且還說要讓夜神成為穿越者。
半信半疑的他，獨自來到信上所指定的地點，然而就開始半信半疑的接受各路神仙的指導，而變的聚集一身神奇能力的奇能異士。
然而就在他17歲的時候，花了7年的時間終於全部都學到頂峰，神仙們說他已經可以用自己的能力打開時空之門來穿越到自己想要的世界，不過正當神仙們要說穿越時會有什麼代價的時候，夜神就一股興奮的腦充血，直接打開時空之門進行穿越。
神仙們還來不及阻止（其實是他們不想阻止，因為他們都認為就算阻止了，夜神也堅持要穿越），夜神直接一下子跳進穿越之門。
他進入穿越之門才剛想說「蘿莉們！我來了！！」，結果底下一道白光閃現，穿越之後他立刻發覺自己的衣服有點寬鬆，低頭一看才發現自己被縮小了！（當時的夜神表示：「你他喵的給我縮小！這樣我要怎麼泡蘿莉！！」）
不過幸好的是，他被村子的好心人所發現，由於看到一個小孩子穿著寬鬆的衣服，再加上又是在森林中，所以大家都認為這孩子一定是從一個恐怖的地方逃出來的，畢竟身穿比自己還要大很多號的衣服，看的出來對方慌慌張張的模樣，因為是小孩子，所以看的出來並不是有人故意遺棄的。
雖然不知道這小孩子從哪來的，不過大家還是決定要收留他。
長年的生活下來，村子的大家對夜神有著非常獨特的看法。
「是個非常勇敢的孩子。」這是村民A的看法。
「非常的獨立，不管做什麼都會想到要怎麼做。」這是村民B看到夜神用著小小身軀在蓋木屋時的看法。
「是個非常溫柔的孩子，雖然個性怪了點，不過對人和神奇寶貝都很溫柔。」這是村民C的看法。
綜上所敘，大家對夜神的觀念就是：「一定是經過非常痛苦的過去，因為有痛苦的過去才會如此獨立。」
不過當時夜神知道這裏是神奇寶貝世界的時候，有種想要找那些神仙痛打一頓的感覺，不過錯在於自己沒有聽完全部的話而跳進時空之門。
然而最重要的是，他一聽到自己所處在『真新鎮』，突然想大喊：「喵的哩！真新鎮沒有可愛的妹子和蘿莉！把我的身體變這麼小，至少讓我落在『蘿莉鎮』吧！雖然有沒有那個鎮都是個問題。」
──回到現在。
來到神奇寶貝的世界後，夜神也已經經過了7年，在這裏，雖然沒有遇到蘿莉，但是也過了很多驚奇的事情。
第一件，就是發現自己的武術、劍術、法術等能力都非常的低弱，可能是因為穿越之後的副作用之一。所以這7年，夜神一直沒辦法轉移到其它的世界，所以隻能在這裏重新開始修煉，然而現在已經恢複了一半的實力（由於當初在鍛煉的時候有神仙教導，所以7年才能峰頂。所以現在人在神奇寶貝世界，沒有神仙教導，所以隻能練成一半的實力）。
夜神看著明媚的陽光照射進屋子，伸了個懶腰，打算起床。
翻開棉被，印入夜神眼簾的是一個有著一頭美麗紫發的蘿莉，蘿莉的頭發雖然有點睡亂，不過那柔順的長發還是很美麗。而蘿莉的身上可以說是一絲不掛，簡單的說就是裸體。（係統判斷：「昨天這名騷年一定推倒了這名蘿莉。」夜神：「去你喵的判斷！我根本就沒推！」）
夜神看著這名可愛的蘿莉，他伸出了自己的一條腿接著────
「雪莉亞！我跟你說過別睡在這了！」
──用力的把蘿莉踢下床！！
因為痛而起床的叫做雪莉亞的蘿莉，頂著她那一頭淩亂的頭發，毫不生氣的抬起頭看著夜神。
「早上好。」
「早上好──你喵啦！這是你第幾次爬到我的床上了啊！」
「4555次。」雪莉亞說著她這樣睡的次數。
「去你喵的！從我來到這世界幾乎就是每天了嘛？！」
一場鬧劇結束後，夜神手放額頭的歎氣。
「算了，今天是我要成為訓練家的日子，我就不跟你多說什麼了，你趕快穿好衣服整理好頭發，拿上行李之後我們趕快去大木博士的家。」
訓練家，也就是指『神奇寶貝訓練家』，要成為訓練家並沒有年齡限製，唯一的限製就是要學習過全部神奇寶貝的知識，例如基本的育成、感情的培養、人與神奇寶貝之間的合作信賴等知識。
一般的孩子從小就5歲開始接受知識的教育，通常10歲就可以得到畢業的認可，然後成為訓練家。
不過由於咱們的主角夜神是10歲到這世界，再加上發生了許多事，導致了自己花了2年的時間做學習準備（建造木屋、與村民之間的認識與活動等故事），然後花了5年得到認可，所以在今年17歲得以開始成為訓練家。
整理好自己的衣裝與頭發，刷牙洗臉完畢，走到自家的客廳從抽屜中拿出關東地圖確認真心鎮與最近的城鎮（常盤市）的距離，雖然聽說隻要一天的時間內就能抵達，不過夜神還是喜歡自己實際去走一遍。