據《洞玄本行經》，靈寶天尊以靈寶之法，隨世度人。自元始開光，至於赤明元年，經九千九百億萬劫，度人有如塵沙之眾，不可勝量。凡遇有緣好學之人，請問疑難，靈寶天尊即不吝教誨。天尊有三十六變、七十二化，人欲見之，隨感而應，千萬處可分身即到。
道教宮觀裏的三清殿中，靈寶天尊常以手捧如意之像居元始天尊之左側位,手持太極圖或玉如意。在道教大型齋醮禮儀中，也多設有三清神位，以靈寶天尊居元始天尊之左位。靈寶天尊之神誕日為夏至日，約在農曆五月中。民間於夏至日之供奉常以靈寶天尊為主神。
道德天尊
道德天尊即太上老君，居“三清尊神”的第三位，是道教初期崇奉的至高神。原為春秋時思想家、道家學派創始人老子。東漢明帝、章帝之際（58～88），益州太守王阜作《老子聖母碑》雲：“老子者，道也。乃生於無形之先，起於太初之前，行於太素之元，浮遊六虛，出入幽冥，觀混合之未別，窺濁清之未分。”將老子神化為先天地之神物，並與“道”相等同。順帝時（126～144）張陵在巴蜀鶴鳴山創立五鬥米道，即奉老子為教主。據傳張陵在傳教布道時作的《老子想爾注》稱：“一者道也。……一在天地外，入在天地間，但往來人身中耳。……一散形為氣，聚形為太上老君，常治昆侖，或言虛無，或言自然，或言無名，皆同一耳。”首次在道書中出現了太上老君的名號。至魏晉南北朝，太上老君之名益顯。北周武帝建德三年五月“初斷佛、道兩教，經像悉毀，罷沙門、道士，並令還民”。據道書稱，當時太上老君曾遣使顯靈。時過一月，武帝即又下詔曰：“至道弘深，混成無際，體包空有，理極幽玄。……今可立通道觀於都城……並宜弘闡，一以貫之。”說明當時已經開始利用太上老君幹預朝政了。
至唐，太上老君之威靈更盛。他不僅被奉為李唐王朝的始祖，幫助唐高祖李淵平定天下，據稱當武則天篡奪李唐王朝後，又顯靈降世，謂“武後不可革命”，“不得輒立異姓。……武後亦終懼此言，不敢立武三思”。因此，天寶年間，玄宗最後為他上“大聖祖高上金闕玄元天皇大帝”尊號。宋大中祥符六年（1013）八月加號為“太上老君混元上德皇帝”。“一氣化三清”最早出自許仲琳著的《封神演義》，寫的是太上老君與通天教主鬥法時，太上老君用一氣化出三個法身的故事。
道教三清原指玉清、上清、太清三位尊神，全稱為太清境大赤天道德天尊，簡稱道德天尊，又稱太上老君，是道教最早祟奉的至尊之神，或說化身老子，後因出現“一氣化三清”之說，由一尊神變為三尊神，以太上老君列三清第三位神。老子者，老君也。
《雲笈七簽》又用之以寫三清之產生，“原夫道家由肇，起自無先，垂跡應感，生乎妙一，從乎妙一，分為三元，又從三元變生三氣，……三元者，第一混洞太無元，第二赤混太無元，第三冥寂玄通元。從混洞太無元化生天寶君，從赤混太無元化生靈寶君，從冥寂玄通元化生神寶君。”
"老君修得氣分身,一體玄功各揚名;同拜鴻鈞修道德,原是一氣化三清!"
既然三元變生三氣，又化生三位天神，此三位天神自然即為三氣所化或為三氣之體現者。這三位天神實即後世所稱之三清尊神。故後世有”一氣化三清“之說，表明”氣“是構造道教最高神的基本要素。同樣，最高神之下的眾神仙，也由“氣”所構成。如“玉帝，在道教即三清之化。”即三清祖氣所化，“五老上帝者，五氣之根宗，五行之本始也。表明玉皇大帝、五老君的“氣”是直接源自根宗.
《道德經》第四十二章曰：
“道生一，一生二，二生三，三生萬物，萬物負陰而抱陽，衝氣以為和。”由無名大道化生混沌元氣，由元氣化生陰陽二氣，陰陽之相和，生天下萬物。第十四章又說：“視之不見名曰夷，聽之不聞名曰希，搏之不得名曰微。此三者不可致詰，故混而為一，”認為一化為三，三合為一，“用則分三，本則常一”。後來道教以此衍化出居於三清勝境的三位尊神。因此“三清”尊神在道教神仙體係中位為最尊，《道教義樞》卷七引《太真科》說：“大羅生玄元始三氣，化為三清天也：一曰清微天玉清境，始氣所成；二日禹餘天上清境，元氣所成；三曰大赤天太清境，玄氣所成。從此三氣各生，”
據《雲簋七籖》和《道法會元》等道書記載，清微天玉清境，混洞太無元，其氣始青，真道升聖境，天寶尊(元始天尊)治之；禹餘天上清境，其氣元黃，仙道升真境，靈寶尊治之；大赤天太清境，其氣玄白；人道升仙境，道天尊居之。文曰：“此四種民天，即三界之上，災所不及四種民天上有三清境。三清之上即是大羅天，元始天尊居其中，施化敷教。天寶君治在玉清境，清微天也。靈寶君治在上清境，即禹餘天也，神寶尊(道德天尊)治在太清境，即大赤天也。”
(《雲簋七籖》卷三《道教本始部》)又據《集說詮真》引《讀書紀數略》雲：“三清者玉清聖境，元始居之；上清聖境，道君居之；太清仙境，老君居之。”同時，道教的三清尊神還反映了道教“三洞真經”的神化。《雲簋七籖》卷六《三洞經教部》說：“《道門大論》雲三洞者，洞言洞也。通玄達妙，其統有三，故雲‘三洞’。第一洞真，第二洞玄，第三洞神。乃三景之玄旨，八會之靈章。”
根據《道法會元》卷一《清微道法樞紐》關於清微神位的記載；清微聖祖玉清元始妙道上帝代表洞真經部，太玄輔之，傳道教清微派；清微玄祖上清靈福玉雇大道君，代表洞玄經部，太平輔之，傳靈寶派；清微始祖太清道德五靈玄老君代表洞神經部，太清輔之，正一盟威之道通貫三洞，傳道德派和正一派。三清是道教對其所崇奉的三位最高天神的合稱。這三位最高天神指：“玉清境清微天元始天尊、上清境禹餘天靈寶天尊，太清境大赤天道德天尊。其中所謂玉清境、上清境、太清境是所居仙境的區別，清微天、禹餘天、大赤天是所統天界的劃分，而天尊的意思則是說，極道之尊，至尊至極，故名天尊。
元始天尊約在晉代才在道教神係中出現。它被說成是由赤混洞太無元的青氣化生的。每到劫數終盡，天地初開，就出來傳授秘道，開劫度人。靈寶天尊在道教神係中出現，則晚於元始天尊，是南北朝時才有的。它被說成是由混太無元玄黃之氣所化生，又稱太上道君，也隨劫運出法度人。
道德天尊即老子?，又稱太上老君。為了構成三清尊神的等級序列，它被說成是由冥寂玄通元玄白之氣化生的。事實上，道教從創立之時起，就尊奉老子為教主，進而說他上處五京，為神王之宗；下在紫微，為飛仙之主，成了至尊天神，而且常常分身降世，無世不存。但在三清中，其地位處於最低層，顯然不合所有道教徒的信仰，所以到後來，又產生了老子一氣化三清的說法。