1688年，英國國會發動宮廷政變，迎取荷蘭奧蘭治親王威廉為英國國王，建立了君主立憲製政體。1695年，俄國沙皇彼得一世為了加速國內改革步伐，組織大批使團出訪西歐；1700年，彼得一世為奪取波羅的海出海口，發動了對瑞典的“大北方戰爭”。
明末清初，中國北方的蒙古族分為漠南、漠北和漠西蒙古三支。漠西蒙古是明代瓦剌的後代，遊牧於天山以北地區，又分為四部，其中準噶爾部最為強盛，先後驅逐或征服了其他三部。
1671年，準噶爾部落內部發生動亂，噶爾丹奪取了汗位。噶爾丹執政後，便大舉南犯。1677年，攻占了青海的和碩特部；次年，又攻占了天山南路地區。隨著勢力範圍的逐漸擴大，噶爾丹企圖分裂割據的野心也越來越大。而此時，沙皇俄國正企圖侵占中國的蒙古地區，便極力拉攏噶爾丹，支持他的分裂活動，這就更加助長了噶爾丹分裂祖國的野心。
1690年，噶爾丹以追擊蒙古喀爾喀三部為名，率領2萬多人，向漠南進軍。清朝理藩院尚書阿爾尼連忙集合內蒙古各部兵馬阻擊，但在烏爾會河交戰中被噶爾丹打敗。6月，為平定噶爾丹叛亂，康熙皇帝決定親征。7月，清軍兵分兩路北進。8月，清軍在烏蘭布通大敗噶爾丹，噶爾丹倉皇率領殘部逃往漠北。隨後，康熙皇帝班師回朝。
噶爾丹於烏蘭布通失敗後，向清廷請降，以為緩兵之計。為預防噶爾丹再次進攻，康熙皇帝加強了邊境防禦。1694年，康熙皇帝召噶爾丹來京，噶爾丹不但不來，而且還策動漠南蒙古各部背叛清朝。漠南科爾沁部親王沙律向清廷報告了這種情況，康熙皇帝密諭科爾沁諸部假裝同意作噶爾丹內應，以誘其東來，一舉殲滅之。1695年9月，噶爾丹果然率領3萬騎兵從科布多東進，並揚言從沙俄借到6萬鳥槍兵，將大舉進攻清朝。康熙皇帝大為惱怒，決定再次親征噶爾丹。
1696年2月，康熙皇帝命黑龍江將軍薩布素率領東三省清軍與科爾沁諸部兵馬約9000多人為東路，命撫遠大將軍費揚古、振武將軍孫思克率領陝甘清軍約4萬多人為西路，親自率領3萬多清軍為中路，大舉征討噶爾丹。三月，康熙皇帝率領中路軍出發，到五月初逐漸逼近了敵軍。噶爾丹在巴彥烏蘭遠遠看到康熙皇帝親征，氣勢恢宏，便連夜率軍向西逃去。
五月中旬，噶爾丹軍到達土刺河上遊的昭莫多。而此時清朝西路軍已經先期到達，西路軍主將費揚古鑒於清軍長途跋涉，十分疲憊，便根據昭莫多的地形，將豐力隱藏於樹林之中，扼守中央的派孫思山頭，準備克將軍采取以逸率兵待勞、設伏阻擊的戰術對付敵軍。噶爾丹企圖集中力量打敗西路軍，首先想搶占清軍控製的山頭，結果進入了清軍的伏擊圈。孫思克率軍嚴守山頭，向噶爾丹軍發起猛攻；費揚古則指揮主力繞到敵軍背後。噶爾丹軍腹背受敵，迅速敗退，噶爾丹僅率數十騎西逃。清軍取得了昭莫多之戰的巨大勝利，俘獲、殲滅敵軍數千人，並將噶爾丹之妻擊斃。
噶爾丹於昭莫多之戰失敗後，已是走投無路。早在噶爾丹率軍侵略喀爾喀的時候，漠西準噶爾部早已經被康熙皇帝冊封的新汗控製，青海和碩特部和天山南路地區也都被清朝收複。在這種情況下，康熙皇帝又於九月親赴歸化城，一麵部署兵力圍殲噶爾丹，一麵采取政治策略招撫，允許噶爾丹入朝謝罪，並讓理藩院專門設立驛站接待。但一直到了12月，噶爾丹仍然沒有入朝覲見。
1697年2月，康熙皇帝鑒於噶爾丹終無投誠之意，又率軍親征。噶爾丹終於在眾叛親離、走投無路的情況下，服毒自殺。至此，康熙皇帝平定噶爾丹叛亂戰爭勝利結束，漠北整個喀爾喀地區又重新歸清朝統治。但是，清朝平定準噶爾部落貴族反叛的戰爭還遠沒有結束，因為，準噶爾部新的統治者隨著統治地位的鞏固和勢力的不斷增加，也開始滋生了分裂祖國的野心，清朝接下來的雍正皇帝和乾隆皇帝又展開了平定他們的戰爭。