混沌有仙，自封為天，以蒼生為芻狗；古有後凡，采九天之火，焚天煉體，以道成神，後收弟子三千，斬仙破魔。
始仙天尊塵封千古，被迫出世，與後凡交手，那一戰昏天暗地，地裂天崩，虛空破碎，六界顛覆，五行混亂，人魔不分，仙神不清，六道輪回崩塌，一時間眾生如處水火，天地正氣浩然無存，道之法則動蕩。
天道護道者元嬰震蕩，尋創世鏡一觀，隻見鏡麵混沌，如創世之初，期間又有強光閃爍，混沌暫得清明，隻瞧鏡中二人，一人仙風道骨，舉手投足間帶著無盡的滄桑，如星辰已逝的千古時代；一人老態龍鍾，沐浴於火海之中，烈炎灼天，龍鳳齊舞，麒麟咆哮；二人一交手，霎時間，山海崩塌，星辰破碎，觀世鏡頓時幽暗。
護道者大驚，忙去紫霄宮，尋創世元靈。
創世元靈名鴻鈞，端坐黃蒲團，守護者先行後輩禮，將所見一一稟報。
鴻鈞尋來創世鏡，法眼在其上看著鏡中爭鬥的二人，隨後道袍一拂，鏡麵少頃飛出兩道強光，待光輝消散，隻瞧驚疑的二位強者，環顧四周，而後狐疑地盯著鴻鈞與守護者。
鴻鈞看著二人與護道者，對三人說了一番話語，收三人為徒，令其三人下界，將此刻已經混沌世界分開，三人共同施展神通，撐天踏地，引海入川，劃分六界，魔進魔界，仙神歸一，鬼入冥道，重塑輪回，人掌凡間，從此世間清明。
後世稱其三人為三清，尊後凡為太上老君，敬始仙天尊為元始天尊，因護道者身居天道，便稱通天教主。
而後三人奉鴻鈞之命立教，傳六界長生之法——太上老君身降凡塵，元始天尊下昆侖，通天教主臨蓬萊，妖、人、魔因此得以窺探天機，得長生妙法，而因長生之法極玄，故此後的修仙門派又被稱玄宗，尊三清為祖師。
北鬥星移，逝者如斯，混沌時代已被歲月湮沒，後世無數俊傑群起，玄宗林立，在昆侖山的引領下，一切井然有序，修仙派又迎來了一個全盛的時代——仙古。
仙古時期，三清已離世而去——太上老君留一道殘身在九重天，為天帝東皇太一煉製仙藥，自身回紫霄宮，潛行修煉，不問世事；元始天尊建立昆侖山玉虛宮，把掌門之位傳給下任有為弟子，統領混沌群仙，隱入九天之上，避世不聞；通天教主建立碧遊宮，受太上老君之請，將混沌古神帶入蓬萊島，用無上仙法將蓬萊留下一鱗半爪，便領混沌古神將蓬萊島本體打入混沌虛空，不理後世。
混沌仙神離世，後仙神崛起，而一古魔，曾元神分為六，遁入六界輪回，曆經萬世而不滅，逢混沌亂戰、六道重塑，至天地清明，元神已雜亂不堪，然又逢三清傳道，六神各有所悟，隱世修煉，終至後世；不染紅塵惡俗，不理是非正邪，待其出世，六神歸一，已有混沌仙神之能，後世人嫉之，群起而伐，古魔怒，單手一揚，九州雷鳴，掀起腥風血雨，九州之地血流成海。
九天之帝東皇太一為後世仙神，有幸在三清門下修煉，因資質聰慧，深得真傳，待三清飛仙之時，已有混沌仙神之威，故命掌九天；時古魔殺伐，血衝蒼穹，便命天將下界擒拿，豈想有去無回，而下界玄門之師昆侖山又傳急訊，昆侖掌教親臨九天，請帝下界除魔。
東皇太一迫於群威，率領九天之師，偕昆侖掌教與玄門群傑，共討古魔。
大批仙俠之士雲貫而來，殺氣連綿，上古仙法、奇門古陣如狂風暴雨傾瀉而下，落到古魔身軀，古魔震怒，更勝一籌的殺氣拔地而起，九天之師與群傑中法力低微者，不可近其百裏，而其魔軀又因曆經萬世混沌，摻雜輪回五行，近身者又似墜森羅之獄。