蒙卡篇（漫畫：1－7話／動畫：1－3話）
受到海賊紅發傑克的影響，草帽小子蒙其?d?路飛開始出海當海賊。不久，他遇到一隻海怪和海賊亞爾麗塔，但是很快就擊敗了他們，然後認識了一個誌向當上海軍的男孩克比。其後他們來到海軍蒙卡控製的城鎮，在那裏遇到因為攻擊蒙卡兒子而被抓起來的海賊獵人羅羅亞?索隆。
巴其篇（漫畫：8－21話／動畫：4－8話）
劍士索隆成為魯夫的第一個夥伴，他們來到海賊小醜巴其控製的城鎮，在那裏遇見痛恨海賊的小偷娜美。
克洛篇（漫畫：22－41話／動畫：9－18話）
之後娜美作為他們的航海士與他們兩人合作（不過她強調不是他們的夥伴），他們來到一座島並尋找可以使用的船，在那裏他們遇到了愛說謊話的騙人布。然而他們卻發現騙人布的朋友可雅的管家克拉巴特爾（克洛船長）欲殺害可雅，魯夫等打敗了克洛後，可雅將黃金梅利號贈予他們。
克利克篇（漫畫：42－68話／動畫：19－30話）
狙擊手烏索普成為魯夫的夥伴，一行人來到海上餐廳巴拉蒂，希望能找一個廚師夥伴。但是餐廳卻受到提督克利克的攻擊，原來克利克從偉大航道回來後，船已破損不堪使用，他想要奪取巴拉蒂，再度返回偉大航道。
惡龍篇（漫畫：69－95話／動畫：31－45話）
來自巴拉蒂的廚師香吉士加入草帽海賊團，但是娜美卻偷了他們的船，他們尾隨娜美，來到魚人海賊惡龍所控製的島嶼。娜美坦承她是惡龍海賊團的一員，幫助魯夫他們隻是為了偷取黃金。但實際上，娜美是為了從惡龍手上買下她的村子而忍辱在惡龍揮下工作。後來，魯夫打倒惡龍後，航海士娜美加入了草帽海賊團，正式成為他們的夥伴。
羅格鎮篇（漫畫：96－100話／動畫：48－53話）
草帽海賊團一行人來到進入偉大航道之前的最後一個城鎮羅格鎮，那是海賊王哥爾?d?羅傑的故鄉，同時也是海賊王被處刑的地方，所以羅格鎮又被稱為開始與結束的城鎮。在那裏他們不僅得應付海軍上校斯摩格，還要應付其他來尋仇的敵人，而魯夫在那裏受到其父親蒙其?d?多拉格的幫助得以脫身（但路飛並不知情）。
顛倒山篇（漫畫：101－105話／動畫：62－63話）
草帽海賊團一行人來到偉大航道的大門雙子岬，在那裏遇到一隻島嶼鯨拉布。
威士忌山峰篇（漫畫：106－114話／動畫：64－67話）
在神秘的mr.8和miss星期三的帶領下，草帽一行人來到威士忌山峰，在那裏市民舉行派對歡迎他們的到來。但後來得悉威士忌山峰是巴洛克華克的地盤，並發現miss星期三和mr.8的真實身分其實是阿拉巴斯坦王國的公主和護衛隊長。
小花園篇（漫畫：115－129話／動畫：70－77話）
魯夫一行人來到小花園，那裏是一個仍然保存著史前時代景觀的巨大島嶼。但在那裏有著比恐龍更加恐怖的東西，那就是已經在島上決鬥超過100年的兩位巨人―青鬼東利和赤鬼布洛基，眾人更在此遇上了巴洛克華克的高級特務mr.3和miss黃金周。(注:mr.5和miss情人節為了追殺草帽等人從威士忌山峰來到小花園與mr.3搭檔會合)
磁鼓島篇（漫畫：130－154話／動畫：78－91話／劇場版9）
由於娜美得到一種不知名的病，使得全員必須前往磁鼓島尋找醫生。不巧的是，磁鼓島因為先前統治者的關係，使得島上隻剩下一個醫生，那就是住在山上的魔女dr.古蕾娃，魯夫和香吉士為此踏上征山之途。與此同時，前統治者瓦爾波剛好回到磁鼓島來搶回他的國家。魯夫等人並在此遇見了幫助他們治療和與瓦爾波戰鬥的醫生多尼多尼?喬巴。
阿拉巴斯坦篇（漫畫：155－216話／動畫：92－130話／劇場版8）
喬巴以船醫身份加入草帽海賊團，一行人和公主薇薇來到了阿拉巴斯坦平亂。雖然在他們趕到皇宮時，內戰已經開始了，但最後的一場雨，使得薇薇可以向大家說明七武海之一沙鱷魚克洛克達爾的陰謀，內戰亦隨之結束。其後薇薇（和跑得快）向魯夫等人道別，就算脫離了海賊團但仍是夥伴之一。接著，新成員考古學家妮可?羅賓亦加入了草帽海賊團。
加雅篇（漫畫：217－236話／動畫：144－152話）
由於紀錄指針異常地指向天空，他們來到加雅島尋找關於“空島”的線索。
空島篇（漫畫：237－302話／動畫：153－195話）
乘著巨大海流，一行人來到了積帝雲上的“白白海”。他們發現天空的居民並不像表麵上的那樣和平，空島原住民與香狄亞之間紛爭不斷，而“神艾涅爾”卻打算將空島打落藍海。魯夫擊敗艾涅爾後，敲響巨大的黃金鍾，並解開了島民與香狄亞兩個種族的心結，也終結了曆經戰爭四百年的故事。