如果不同意或者隻是部分同意下級機關的意見，就需要簡要說明情況或原因，以便下級機關重新考慮其他的解決辦法。
三、寫作要求
1.慎重及時
批複既是上級機關指示性、政策性較強的公文，又是對下級單位請求指示、批準的答複性公文，因此，撰寫批複要慎重及時。批複機關收到請示後，要及時進行周密的調查了解，掌握有關情況，根據現行政策法令及辦事準則，經認真研究後，及時給予答複。
2.針對請示答複
請示要求一文一事，批複也應有針對性地一文一批複，請示要求解決什麼問題，批複就答複什麼問題，上下行文互相對應。
3.明確態度
批複意見不管同意與否，必須十分清楚明白，態度明朗。不能含糊其詞，模棱兩可，以免下級無所適從。
批複的主送機關明確隻有請示機關一個，如果所請示問題有普遍性，或需告知其他一些機關，可用如下辦法處理：一是除批複原請示單位外，並轉有關單位。二是將批複抄送有關單位。三是將有關意見另用“通知”行文。將本機關對一些普遍性問題的意見及時傳達下去。
4.不同指示、複函混用
批複與指示同為下行文，均對有關事項提出原則、要求，但兩者的區別還是明顯的，不能混用。首先是內容不同，指示是對下級機關布置工作，闡明工作活動的原則。而批複事項較窄，隻能針對請示事項作出具體答複，多屬個別性問題，不涉及麵上的工作。其次是受文對象不同。指示的受文對象一般不是某個機關，而是有關的機關單位，受文對象甚至不確定。而批複有特定的受文單位，隻給原請示機關發批複。再次是製發動因不同。指示根據需要而作，屬主動行文，批複是針對下級機關請示而發的，屬被動行文。
批複與複函由於都是回複來文的公文，有時也會被混用。兩者的區別在於：從行文關係看，批複是上級機關向下級機關答複用文，屬下行文；複函一般是向不相隸屬機關答複用文，屬平行文。從行文內容看，批複多屬於對重大原則和政策性問題作出決定、批複，複函多用於一般性事項的回複。
範例
關於江蘇省撤銷南通縣設立通州市的批複
民政批〔1993〕4號
【noindent】江蘇省人民政府：
你省1992年10月8日《關於撤銷南通縣設立通州市的請示》和1992年11月12日的補充請示收悉。經國務院批準，同意撤銷南通縣，設立通州市（縣級），由省直轄，以原南通縣的行政區域為通州市的行政區域，不增加機構和人員編製。
民政部1993午1月8日關於對泰山中天門索道改建問題的批複
建城函［2000］247號
山東省建設廳：
你廳“關於泰山風景名勝區中天門索道改建工程的請示”收悉。經研究，現批複如下：
一、泰山索道改建工程，明顯違背了國務院批準的《泰山風景名勝區總體規劃》，也違反了《國務院辦公廳關於加強和改進城鄉規劃工作的通知》（國辦發［2000］25號）精神和建設部《風景名勝區建設管理規定》等規定的程序，造成了不良的社會影響，應追究決策人的責任。請你廳對此進行調查處理，並將處理結果報我部備案。
二、鑒於短期難以解決拆除中天門索道所帶來的旅遊安全、經濟損失和由此引發的社會問題，原則同意中天門索道設備更新改造方案，明確該工程為臨時工程，將來必須拆除。
三、請你廳進一步組織修改工程設計方案，嚴禁擴大中天門索道下站的站外廣場，防止對景觀環境的新的破壞。要對中天門索道改建工程設計方案提出的環境和保護措施作進一步研究論證，環境整治的措施必須同步實施。應責成泰山索道股份有限公司負責修複原索道修建時破壞的景觀和環境，請你廳對此實施同步檢查和監督。
四、請你廳盡快組織修編泰山風景名勝區總體規劃，統籌解決保護與開發之間的矛盾和問題。