宗教內部的分裂已經不可避免，不過結局是注定的，發展科技的支持者們大獲全勝，堅定的宗教支持者遭到放逐。
恰好此時，電磁能終於被科技人員徹底掌握，以磁歐石為中心的能源係統被發明出來，緊接著一艘能夠橫渡宇宙的巨型飛船被製造出來，它立刻成為了放逐這批宗教支持者的最佳工具。最終，十二名大祭司，帶著一萬多名忠誠的手下或信徒，開始了長達千年宇宙流浪……
剩下的十六名大祭司雖然支持科技，但是他們同樣不願意看到自己的統治被削弱，經過一番激烈的辯論，最終決定向全民公開靈魂的秘密。這一舉動的確挽回了宗教的頹勢，當所有人都開始修煉心靈力量的時候，宗教的統治地位變的牢不可破。
有了宗教的支持，科技開始了突飛猛進的發展，在一萬六千七百多年前，結合了磁歐石與靈魂力量的第一台智腦誕生了，隨之誕生的是智能機器人，社會生產力極度發達，人們再也無需親自勞動，全都開始盡情地享受生活。
在接下來的幾百年，人們對世界的認識漸漸局限於滿足自己的物質生活，自上而下，從統治者大祭司到普通民眾，全都陶醉在滿足自己的各種欲望中。科學家們不去研究宇宙的奧秘，而是通過基因工程，造出美人魚用於觀賞，造出卡美拉用於玩樂，****－交、迷－幻藥，在當時的社會中變得極為平常，亞特蘭蒂斯人徹底墮落了……
仿佛是天神的懲罰，也許是附近某個超新星爆炸了，也許是太陽突然打了個“噴嚏”，一場突如其來的宇宙風暴襲擊了地球……
高能射線引發了幾個磁歐石內部的不穩定因素，原本緩慢而穩定的核能釋放變的狂暴。很快，第一枚磁歐石爆炸了，同時釋放出更多的高能射線，於是，一日之內，無數磁歐石連環爆炸，最終引爆了大西洲太陽宮中央能源所內的巨型磁歐石……
（小磁歐石爆炸摧毀了亞特蘭蒂斯人在亞、歐、美、非等陸地上的所有文明痕跡，巨型磁歐石的爆炸直接炸坍了地殼，失去了地殼的支撐，大西洲在岩漿和海嘯肆虐中，緩慢地沉入了如今的大西洋中。）
紀錄片到這裏就完全結束了，接下來發生的事孟平已經猜到了，失去了機器人，幸存的亞特蘭蒂斯人幾乎什麼都不會，在野獸的威脅下，文明又退回到了原始社會，超文明亞特蘭蒂斯逐漸成為了一個傳說。
孟平看著克裏斯，無言地詢問著他是否就是被放逐的那批亞特蘭蒂斯人的後裔。
“真是不可思議，原來我們真的是同族。”克裏斯看著孟平，眼中再也沒有了高傲，“我想我們真的可以交個朋友了。”
“你好，我叫孟平。”
“你好，我叫克裏斯。”
兩人雙手一握，相視一笑……