福康安對成德進行斥責後，另謀他法攻打要塞。二十日，都司什格蒲益章率所部於寨西挖掘地道；張占魁率所部則於東、南兩麵佯攻。二十四日，清軍由地道送藥，炸毀石碉西牆，乘勢撲上碉寨，消滅寨內100名廓兵。至此，清軍經一個月圍攻，收複聶拉木城。戰後，成德、鄂於木薩橋、拍甲嶺等處分兵防守，而福康安則積極謀劃，開始對其他地區進行收複。
此次作戰嘉慶下了重大決心，要求福康安務必打出軍心士氣和大清天威。單單是作戰力量上，福康安所率的清軍，就遠勝翻山越嶺入侵的廓爾喀軍隊。清軍在西藏前線包含原本的藏兵以及駐藏漢兵，還有福康安從四川帶來的西南新軍一鎮，嘉慶還為了保險，特別調了一營的禁衛軍給福康安，福康安手中兵力多達兩萬三千人。而廓爾喀人一路在宗喀附近，兵力約在貳二千之數，另一路在定結，有三千餘人，聶拉木的廓兵三千餘人也已經被擊敗，開始撤回本土。戰術上，地形已經幫助福康安將敵人一左一右切成了兩個部分，而且在任意部分，福康安都具備優勢的兵力和火力。如何施為都是輕鬆寫意，幾乎沒有什麼難度。
而廓爾喀人在聶拉木敗給了清軍，雖然損失並不大，但是同時廓爾喀又遭到了武毅軍在東部的入侵，不僅派出的一支試探性部隊被打得打敗，而且緊急集合起來的二千多的兵力也在西裏古裏以東被武毅軍聯合絞殺，廓爾喀人前後兩麵受敵，舉國震動。
在知曉了南麵的軍隊同樣屬於清國，並且得到了唐人的支持，廓爾喀人才知道自己捅了一個天大的馬蜂窩。國王拉納?巴哈都爾?沙阿連忙遣使向福康安求和，可是福康安直接拒絕了。