這場亂戰武衛軍沒有參與，居然生生地打了一整個晚上。江寧八旗折損相當嚴重，至少有八九百人死在了江寧，江南軍損失也不小，而且打到後來，很多人都逃散了。由於江寧城門洞開，很多江南軍的民勇就扮作普通人，丟了武器，從江寧逃了出去，由於很多江寧人為了躲避戰亂也都跑了，所以分辨不出誰是兵誰是民。
第二天清早的時候，陳國治才知道薩載已經自焚死在了總督府。江南軍也基本上被城內的八旗兵和其他反正軍隊肅清。陳國治倒也心裏亮堂，江寧八旗這一番雖然死了不少人，但是卻保住了江寧的滿人。他們在最後關頭撥亂反正，而且姑且算得上是出力不少，自然嘉慶要體恤他們，不至於將他們處置，甚至有些人還要嘉獎慰勞。
江寧被攻破後，清國國內最大的一個割據力量算是被消滅了。薩載對於整個江南的控製力是極為有限的，原本很多地方官都沒有跟著薩載對抗朝廷，薩載一倒更是順水推舟的向朝廷表忠心。大批江南官員都托稱自己之前是跟薩載虛與委蛇，身在曹營心在漢。嘉慶也不傻，對於這些人大都溫言撫恤，並沒有嚴厲處置，不過這些人名他都記下來了，恐怕未來他們都不太可能獲得升遷，或者找個什麼理由之後就辦了他們。
紀昀在江寧城被武衛軍接管的第三天後，來到了江寧擔任江蘇巡撫。他的首要任務是恢複江蘇的治安和穩定，同時跟唐人進行合作。江南要想穩定，沒有唐人的支持是顯然不可能的。唐軍就駐紮在上海，這次江南之戰中，隨意地出兵，想攻占哪裏就攻占哪裏，看得人心驚肉跳。
嘉慶給紀昀的密旨中提到，表麵上敷衍唐人，如果唐人提出什麼要求，如果不太過分就滿足他們，另外盡快地恢複江南的生產，確保朝廷得到這一財稅重地的收入，同時敦促唐軍盡快撤離清國領地，返回上海進行駐紮。
紀昀對此也隻能苦笑了，新朝廷的官不好當，得伺候好皇帝不說，還得伺候好唐人。唐人語言文字跟清人無異，可是做事方法上卻讓很多清朝官員很不適應。紀昀也很明白，讓唐軍撤回上海不難，但是唐人仍舊可以對江南產生巨大的影響力，因為此時江南掌握在武衛軍的手上，而武衛軍名義上屬於朝廷，但卻受唐人那個總督節製。
嘉慶跟唐人相處日久，也很明白唐人的尿性了，他猜得也沒錯。很快，唐人就提出了新的要求，中華聯合特區總督在給嘉慶的信件中表明，此次江南地區的叛亂，有一批人起到了很壞的影響，對於皇帝陛下的不忠，應該遭到嚴厲處置。在此，他建議嘉慶皇帝陛下，將涉世的叛亂士子、叛軍民勇，以及他們的家人，進行流放，而唐國將具體為此負責。
說白了，唐人又是把念頭打到了人口上麵。