亞曆山大想要為他的造訪以弗所留下永久的紀念，下令重建阿提米斯神廟，根據傳說，它是在亞曆山大降生的那晚，被一個想要名留青史的瘋子希羅史垂特斯燒成灰燼（他成功了）。但是以弗所以外交辭令“神不當賜給別人神廟”，拒絕了他的提議。亞曆山大在被迫解放的普裏尼城有比較好的運氣，他捐助興建新的雅典娜波裏亞斯神廟，而且他的功德還被記錄在一塊大的碑刻上（現在收藏在大英博物館中）。
米利都也不願解放，而希望能夠保持中立地位，但亞曆山大的圍城器械很快就使他們改變心意。這一次沒有任何波斯軍隊的活動，而隻有邁農的軍隊從海路襲擊亞曆山大。亞曆山大的小艦隊擊敗了每一支來襲的軍隊，因此邁農的出現顯然毫無影響。這似乎是亞曆山大之所以決定不靠艦隊，並解散艦隊的原因。維持艦隊的費用昂貴，而且是由忠誠程度堪慮的希臘人來駕駛。這個決定使他必須占領所有東地中海的港口，以確保後方的安全，而這也是他正在進行的工作。不過，不靠艦隊的決定則終將證明是短視的做法。
亞曆山大前進到卡瑞亞。邁農旗下的波斯人已經重新在其首府哈裏卡納索斯集結，這裏是由一位卡瑞亞王公統治。其合法的女王阿達，被她的兄弟皮克索達拉斯驅逐。不過皮克索達拉斯剛剛過世，現在統治權則落入他的女婿波斯人歐戎托巴提斯手中。亞曆山大的“解放”策略使亞曆山大到阿達所在的阿林達要塞請求她的協助，而她也收亞曆山大為養子。其他的卡瑞亞城市在亞曆山大經過歐羅木斯，來到海岸地區，從西北方接近哈裏卡納索斯的城牆與衛城時，都張開雙手歡迎他。亞曆山大在等待補給船將圍城器具運來時，延遲了一點時間。器具運到後，城牆很快就被摧毀。許多守軍被殺。雖然邁農和歐戎托巴提斯仍然掌握著衛城的控製權，但他們在當天晚上，燒了殘存的建築物，然後撤出這座城市。亞曆山大摧毀了這座城市，複立阿達為女王，並建立一支龐大的防衛部隊。他認為這樣應該可以安全地向前邁進了，不過邁農的勢力仍然很大。
下一個階段的目標，是要建立對小亞細亞南岸的控製，並殲滅敵軍所有的力量。但帕曼紐還是被派到薩地斯同安那托利亞中部的民族作戰。在公元前334年到333年的仲冬，亞曆山大在發西利斯度過。這時帕曼紐送來了一份奇怪的情報。帕曼紐俘虜了一個名叫西西尼斯的波斯人，他把一封大流士的信帶給林西斯的亞曆山大（當時正在帕曼紐的部隊中服務），以1000泰倫的價錢要他謀殺亞曆山大國王。當西西尼斯將他的故事告訴亞曆山大後，亞曆山大並不確定是否應該相信。它是否可能隻是帕曼紐消除可能對手的陰謀？或者它是真的？亞曆山大後來宣稱奧林匹婭斯曾經寫信警告他注意林西斯家族的行動。亞曆山大采取了預防措施，逮捕這個和他同名的人，並嚴加看管，但他一直到公元前330年底，才因牽連到所謂的菲羅塔斯叛亂案而被處死。
在處理了這個問題之後，亞曆山大沿著海岸行進，進入潘菲裏亞。部隊沿著一條由前鋒特地開辟的道路，越過了克萊馬斯山，但亞曆山大和他的隨員則沿著海岸旅行。海水拍打著峭壁，覆蓋了狹窄的通道，往北吹的風則為國王清理出道路。史家卡裏西尼斯把這個事件看作是它們臣服於新主人的表示。
這個地區其他的城市——太米薩斯、阿斯潘達斯、佩爾格、塞爾吉、薩加拉蘇斯——很快就被征服，亞曆山大現在準備越過山脈到戈爾迪烏姆與帕曼紐會合。他必須通過凱萊奈，這是禦道的一段，並且必須保持它的安全。但是這座城市易守難攻，而且也準備好麵對圍城的狀況。亞曆山大急於前進，於是他留下一個將軍，獨眼安提哥納，負責該地區的防守事宜。自己走過130英裏的路程，在公元前333年抵達戈爾迪烏姆，而這座城市馬上就投降了。帕曼紐的部隊大約在4月時抵達，馬其頓軍隊再次會合。
不過，西方傳來不好的消息。邁農重新占領了許多愛琴海島嶼，並且可能已經在計劃經由攸卑亞直接入侵希臘。亞曆山大被迫建立一支新的艦隊——這是他曾經想要節省下來的花費——並派遣指揮官回希臘戰場。
在戈爾迪烏姆的時候，他得到了一次做宣傳戰的好機會。在傳說中的福瑞吉亞王國的高地亞斯王宮裏，有一輛從頭到尾都被山茱萸繩結捆住的戰車，但卻找不到繩結的頭在什麼地方。
有一個古老的傳說，也許是為這個場合發明的，說什麼人如果能夠解開這個結，就可以成為全亞洲之王。亞曆山大想了一下，就以他慣有的衝動來撇開小困難，他用劍斬斷了這個結。卡裏西尼斯馬上就歡呼這項成就將是神聖力量為本次戰役所作的保證。
更進一步展現上天眷顧的當然是邁農在這時突然因病暴斃。結果使大流士無心進行歐洲的戰事。波斯人仍然控製愛琴海，但波斯人現在的策略則是要在陸上殲滅亞曆山大，而這也是一種適合亞曆山大的戰法。