朝鮮使者評價紀昀等說：“朝臣中，一辭公論，剛文正直推劉墉，風流儒雅推紀昀。而墉則見其為人視下而步徐，一入班行，位著為之肅然。去年傳禪時，臨當受賀，高皇帝不肯與大寶，則墉止賀曰：古今安有無大寶之天子？遂即入奏高宗曰：陛下不能無係戀天位之心，則傳禪可已，傳禪而不與大寶，則天下聞之，謂陛下何如？半日力爭，卒得大寶而出，始行賀禮。故今皇帝以定冊元老待之。昀則近以中原學術，類皆以聲律書畫為粉飾塗澤之具，而稍進於是者，不過叢書小品之博洽而已。今行購求時，當世所稱藏書名儒，多與之往複質問，則自內閣書下之書目間，或不辨其何等義例，何人編刻，而獨昀一人取諸腹笥，年經月緯，始終源流，洞如燭照。所著古文，本之以經術，繩之以檢押，純正優餘，無愧為當世名家。”(《朝鮮李朝實錄中的中國史料》第12冊，第5004頁。)
嘉慶五年庚申1800年
四月，雲南倮黑起事經年，至是敗降。因貴州發生紅案陋規案，禁貴州學政收紅案陋規。
五月，因浙江海盜蔡牽勢力不斷增大，命浙江截堵蔡牽等。
六月，四川總督魁倫以貽誤軍機被賜死。
是年，紀曉嵐仍在禮部尚書任上。汪德鉞曾就屬吏見長官半跪問題上書禮部尚書紀昀要求廢除此製，其中談到劉墉：“老夫子大人鈞座：竊聞劉塚宰(墉)之掌吏部也，與屬相見，複舊製惟長揖而已，德鉞聞而慶之。夫跪拜細事耳，而所關甚巨。自古宗社之鞏固，由士大夫之有氣節。氣節之能植，由士大夫之識廉恥。廉恥何謂？不苞苴饋餉以營利達，不脅肩諂笑以羞妻妾而已矣。今劉塚宰既已複之於吏部，吾師獨不可複之於禮部乎？大抵屬吏之於長貳，苟非喪心病狂，誰敢侮倨？故不患其不能屈，患其屈而習為脂韋，流為苟賤，此則君子之所隱憂也……”(《四一居士文鈔》卷三《上大宗伯紀曉嵐師書》)。
嘉慶六年辛酉1801年
正月至八月，白蓮教起義軍遭受重大損失，首領張世龍、徐萬富、王士虎、高三、馬五、張允壽、徐天德、王鎮賢、冉天四、冉學勝或戰死，或被俘。十一月，洋盜陳天保率部投降，繳呈安南所給總兵印敕。因攻白蓮教軍事活動已近尾聲，令籌劃安插鄉勇事宜。
是年，紀曉嵐仍在禮部尚書任上。
嘉慶七年壬戌1802年
二月，雲南維西彝人及僳僳人聯合起事，閏二月失敗。
三月，白蓮教首領張天倫、魏學盛、龔其堯戰死，老教師李世漢等被俘。申禁州縣征收漕糧私行拆色，諭曰：“各省征收漕糧禁止折色，定例綦嚴，朕親政以來，於漕務事宜大加整頓，期積弊漸就肅清。乃近聞有漕省分，尚不免有浮收及得受漕規者，是積習仍未悛改。並聞各州縣往往於開倉時逾額浮收，迨米數既足，遂私行折色，竟公然設局定價。並有於開倉之始即先行折色，虛報滿廒，自用賤價買補，於兌糧時兼有折色之弊，劣衿刁民之把持，皆由此而起，其受累者惟在安分貧民”雲雲。(《實錄》卷九十六)
七月，嘉慶帝秋獮木蘭，駐避暑山莊。
八月，安南阮福映政權入貢，解送阮光纘等所委總兵等廣東洋盜三人入京。定巡查中俄邊界卡倫製度。廣東天地會在博羅等地起事反清，重創清軍。十月，禁番役子孫出仕應試。十二月，以白蓮教起義軍基本潰滅，清廷對鎮壓白蓮教有關人員大行封賞。安南請“南越”封號，清廷以其包會甚廣，改封越南國。是年，紀曉嵐仍在禮部尚書任上。四月會試，充正考官，有《壬戌會試錄序》。
嘉慶八年癸亥1803年
二月，有陳德順貞門行刺嘉慶事件，紀曉嵐參與會審。陳德後被處死。
是年，紀曉嵐仍在禮部尚書任上。六月十五日，紀曉嵐八十生辰，嘉慶皇帝特命上駟院卿常貴頒賜珍品，紀曉嵐有謝恩折子。並署理兵部尚書。教習庶吉士。七月，因辦理孝淑皇後奉安典禮，紀曉嵐被革去兵部尚書、文淵閣直閣事、教習庶吉士，仍帶革職留任，八年無過，方準開複。十月，免於處分。
曾為劉墉臨王右軍帖書作記：“石庵今年八十四，餘今歲亦八十，相交之久，無如我二人者。餘不能書，而嘉聞石庵論書……詩文晚境多頹唐，書畫則晚境多高妙。倪迂寫竹似蘆，石庵翁題詠之筆每侵畫位，脫略畦封，獨以神運，天機所觸。別趣橫生，幾乎不自覺也……蓋其始點畫規矩，餘見之；久而擬議變化，擺脫蹊徑，餘亦見之。今則手與筆忘，心與手忘，雖石庵不自知亦不能自言矣。此所臨摹為寄焉耳，勿以似不似求之。”(《紀曉嵐文集》卷十一)