明萬曆七年，李時珍帶著作品四處聯係出版事宜。最後，李時珍懷著一線希望，到江蘇太倉去找王世貞。
王世貞曾任過湖廣按察使，是一個學識淵博、談吐風雅，思想開放的文人。李時珍曾為他看過病，兩人頗談得來。
到了王世貞家，李時珍說明來意，打開自己的行囊，將書稿放在書案上，請王世貞過目。
李時珍向王世貞詳細陳述了自己重修《本草》的緣由與目的，介紹了全書內容及27年來的寫作經曆，懇求王世貞以他的名望鼎力扶植、推薦，使《本草綱目》得以印刷發行，流布天下，造福世人。
王世貞打開書稿，仔細閱讀。《本草綱目》包羅萬象、博大精深、豐富多彩的充實內容，高屋見瓴、綱舉目張、眉目清楚的編排方式，每味藥物所作的詳盡介紹，既典雅又通俗的文筆，以及精美細致的一千多幅插圖，深深地吸引住了他。
王世貞心想，這需要作者付出多少的心血啊！
王世貞抬起頭來打量李時珍，隻見李時珍雖年過花甲，但麵色紅潤而有光彩、談吐幽默而富風趣，不由暗暗稱讚說：
真可稱得上是南國第一人啊！
王世貞由衷地希望，這部著作能盡早地刻版印刷成書，供人們學習研讀，並用來濟世救人，可惜他力不從心，刊刻這麼一部巨著是需要很多錢的。
王世貞的父親被奸臣嚴嵩所害，他自己也因對朝廷發表了不滿言論，被免職還家，家產被抄一空，自己平時也隻能靠賣字畫糊口度日，對於李時珍，真如常人所說的那樣：自顧不暇，愛莫能助。
王世貞隻好挽留李時珍在家住了幾天，懷著十分遺憾的心情，送走了李時珍。
臨行前，王世貞一再囑咐說：“千萬不要急躁，不妨在南京長住下來，慢慢尋找機會出書。”
李時珍帶著兒子在南京住了下來，一邊為人看病，繼續搜集從外國流傳進來的藥物，一邊尋找機會出書。
當時，正是三寶太監鄭和七下西洋凱旋歸來，被任命為南京守備太監的時候。鄭和在南京獅子山興中門外，建造靜海寺和天妃宮，作為他晚年的休養處所。
鄭和把從南洋帶回的大部分珍貴奇物，貢獻給皇帝玩賞，將大部分藥用植物，種植在靜海寺內，這些都是李時珍研究番藥的絕好材料。
所以，李時珍在南京時，常到靜安寺實地觀察、鑒別，加以分析和總結。
李時珍在南京一住就是幾年，沒有尋找到願意刻書的書商，但是經過幾個春秋的努力，他搜集了幾十種番藥，充實進了《本草綱目》。
像珊瑚、玳瑁等可入藥的珍寶，伽藍香、降真香、黃連香、金銀香等香藥，蘆苔、胡椒、革投、奇捕香等名貴藥材，都是李時珍在南京幾年新搜集到的。
李時珍在南京沒有找到刻印書商，隻好失望而歸，回到蘄州度晚年。
李時珍晚年在家，繼續以高超的醫術為人民造福，間或與師友往來，飲酒賦詩自娛。