序：CE190年，居住在阿爾法人馬座潘多拉星球上的人迫不得已離開了自己的家鄉，環境的惡化,人類無法再居住下去，由於居住的星球很難尋找，人類被迫住進還在試驗中的空間站，但是空間站數量有限並不是所有的人都進入。於是在CE196年，潘多拉的大國便聯合起來，組成一個殖民衛星聯盟，致力於空間站的長期發展。然而那些有能源卻沒有資金的國家（例如尤裏烏斯共和國）隻好跟殖民衛星簽訂了一份協議－－以能源交換技術。才得以住進空間站（那些什麼也沒有的國家隻好組織起來成立一個潘多拉統一聯合王國，致力於把國民安置到地底下去，勉強解決生存問題）。
尤裏烏斯共和國是一個多民族國家，本身的經濟並不怎麼發達，而且政局不穩定，但依靠豐富的能源所換取的巨大經濟效益，矛盾並沒有進一步激發。但是在移民到殖民衛星後的第十年，對於是否繼續和殖民衛星合作的問題，當局的保守派與急進派產生了裂痕。保守派認為以繼續和殖民衛星合作，這樣既可產生經濟效益，以緩和高失業率所帶來的其他一係列問題；急進派則認為長期和殖民衛星合作，得到他們的技術支持固然是好事，但對本國長期的經濟發展和科技力量創新能力的發展是有百害而無一利。
爭論持續了很久，CE208年在哥白尼市談判中被認為是最有希望解決爭端的一次談判，然而，同年7月5日，談判被一個恐怖襲擊打亂了。激進派的代表幾乎都葬身火海中，而保守派雖然也有傷亡，但大部分因航天飛機故障而遲到逃過一劫。這一場大災難是導致爭論擴大至全麵戰爭的板機。
戰爭開始時，激進派以精良的裝備打得保守派毫無還手之力，保守派不得不向殖民衛星求救，殖民衛星為了能長期占有尤裏烏斯的能源答應出兵。然而戰爭持續了好幾個月（一方麵殖民衛星隻是想以最小的代價換取對激進派的勝利，一方麵激進派在戰爭中獲得了大量的經驗），保守派還是未能取得對激進派的勝利，弄得殖民衛星臉麵盡失，於是便想出一個特別的作戰計劃……
第一章:激戰
CE206年，銀色的智慧女神號在漆黑的宇宙中急速地行駛著，與以往不同的是，在它的尾部多了一個特殊的裝置。在戰艦的作戰平台那裏，大副托爾正在向艦長卡馬爾報告著情況：“還有五百秒才能進行下一次空間跳躍。”
“還有五百秒就會到達敵方軍事基地，”艦長卡馬爾對這艦內通用對講機大聲宣布，“全體隊員進入一級戰鬥狀態，駕駛員待命。”
在戰艦的機庫內工作人員正在進行著最後的調試，而ZGMF–X24大地，ZGMF–X88混沌，ZGMF–X31深淵一字排開，在他們的對麵還有三台紮古：ZGMF–1000紮古勇士、ZGMF–1001紮古幻影、ZGMF–2000老虎，放置高達組件的四層甲板處，坐在核心戰機裏的希羅·尤爾好像一點反應也沒有，冷峻麵孔上綠色的眼眸正盯著前方，仿佛迫不及待地要飛出去。
這是一次名為“黎明前的曙光”的秘密軍事行動，為了結束殖民衛星與尤裏烏斯共和國的長久的戰爭，並對尤裏烏斯的資源進行有效控製，殖民衛星決定派出智慧女神號這個MS小分隊，同時為了測試空間跳躍技術的進行第十五次試驗（在《厄瑞涅條約》裏這是一個禁止在戰爭中使用的技術），對尤裏烏斯的軍事基地進行突擊，從而迫使他們投降。
看起來不錯，但一點也馬虎不得。因為通常情況下飛行器需要加速脫離行星的重力陷，並且在目的地找到一個點與飛行器所在點位於等勢時空平麵上，打開飛行器的跳躍引擎才可以無需飛行而穿越兩點。可現在問題：一、在於跳躍得越遠，目標點狀態偏離預期值越大（這越是為什麼要分階段跳躍的原因）；二、誰去設置這個目標點；三、跳躍引擎會在時空等勢之間形成一個隧道，一旦某次跳躍計算失誤，你就可能回到相對於起點與終點都是絕對過去的時間。
當距離下一次空間跳躍還有一百二十秒時，智慧女神號的雷達上卻突然顯示出兩個不明物體。