馬士英獨掌大權以後，第一件事就是極力舉薦其死黨阮大铖。
弘光政權建立伊始，史可法、高弘圖、薑日廣、張慎言等一批名臣，四處招納賢士，“引海內人望”，以圖重振國威，東山再起。馬士英也在四處為自己網羅“人才”，其中最重要的就是要把阮大铖網羅在自己名下。
馬士英心裏十分明白，阮大铖作為閹黨成員，名聲很臭，要想保舉他，就得師出有名。幸好阮大铖肚裏還有點貨色。他自幼讀過一些兵書，對兵法略知一二。馬士英便抓住這一點大肆吹捧阮大铖知兵善戰，提出要讓他出任兵部侍郎。
馬士英心裏也十分清楚，舉薦阮大铖最大的障礙是東林黨官員。果然，馬士英剛把問題提出來，便立即遭到許多大臣的強烈反對。
馬士英沒想到東林黨官員反對態度如此強硬和堅決，一時不知如何是好。雙方遂出現僵持局麵。事情久拖不決，對馬士英是很不利的。他一下子又想起了高弘圖。高弘圖曾經因與東林黨政見不一，詆毀過東林黨。馬士英於是攜帶大量錢銀財物，前往拜訪，企圖拉攏他。馬士英假惺惺地說：“現在國難方殷，正是用人際，不能因小節問題埋沒了人才……”馬士英話未說完，高弘圖就迎頭給澆了一瓢冷水：“逆案是先帝欽定的，任何人都不能擅自改變。”
馬士英黔驢技窮，遂鋌而走險。他背著皇帝，私自撰擬聖旨，矯詔賜阮大铖“冠帶陛見”。阮大铖於是得以親自麵見皇帝。他拋出一套早已炮製好的所謂“守江策”，提出聯絡、控扼、進攻、接應等一整套攻防策略，這對於岌岌可危的弘光政權來說無疑具有很大吸引力。因此一開始，便引起了弘光帝的濃厚興趣。接著阮大铖鼓動他那三寸不爛之舌，陳三要、兩合、十四隙，雖為書生之見，但其口若懸河，宏論滔滔，頗合皇帝胃口。弘光帝高興得連連擊掌叫好，於是當即命人起草詔書，授阮大铖江防兵部尚書，後又很快擢升其為兵部侍郎。
阮大铖出任兵部侍郎，猶如一石擊起千重浪，舉朝為之嘩然。許多官員紛紛告退。呂大器、薑日廣先後辭官罷歸。馬士英則乘機安插心腹，填補空缺。他聽從阮大铖計謀，全部起用了逆案官員，甚至對死者也給予贈恤。這樣閹黨勢力再度得勢，使得朝政更為腐敗黑暗。
經過阮大铖事件的折騰，東林黨元氣大損，其活動漸趨沉寂。而馬士英、阮大铖已緊密地勾結在一起，正策劃著一場更大的陰謀。
弘光元年（公元1645年）冬，南京發生了一樁離奇的案件，即大悲案。大悲姓朱，安徽懷寧人，出家為僧。他來到南京，到處散布聳人聽聞的謠言，一會兒自稱是親王，一會兒又說潞王賢明，弘光帝應當讓位，弄得滿城風雨，議論紛然。大悲案牽扯到弘光帝朱由崧，顯然是一個很敏感的政治案件。馬、阮便借此案大做文章，“欲假以株東林及素所不合者”，妄圖把東林黨和其他清流人士一網打盡。他們捏造了所謂十八個羅漢，五十三個參目，對照早已編製好的所謂“蝗蝻錄”（即指東林黨為“蝗”，複社為“蝻”）黑名單，寫上史可法、高弘圖、薑日廣等人姓名，一起藏在大悲衣袖中，誣陷此案係東林黨人指使。由於構陷過於露骨，未能得逞。但其狼子之心，已昭然若揭。