胡承龍為《本草綱目》得以付樣而感到欣慰。他覺得美中不足的是，在書商的書坊裏刻印，成書後發行量有限，最多不能超過500套，而且要價偏高，平民百姓買不起，自然難得一睹。因而李時珍打算把這部書獻給朝廷、呈現給神宗皇帝，企盼能夠得到最高統治者的青睞，那樣就可以在全國範圍內廣泛流行。
由於身體健康狀況不良的原因，已無法夢想成真。
從萬曆二十年（1592年）開始，重病在身卻還心係百姓，教誨兒孫們不要忘記村民老少對李家的恩情。
李時珍第二年（159年）的病情繼續惡化。恰在這時，南京方麵傳來喜訊，《本草綱目》的刻印進程已經過半，出書之事已是板子釘釘兒，不會有變。李時珍露出了幾分笑容，彌留之際還叮嚀兒孫們尋找一切機會將《本草綱目》進獻給皇上，爭取廣泛流傳。是年僅76歲的李時珍在初秋的某一天病故。
李時珍不幸逝世，蘄州百姓陷入了萬分悲痛之中，聞訊前來吊唁的人絡繹不絕。他被安葬在雨湖南岸的土耳地，與其父李言聞的墓緊緊相倚。隨著《本草綱目》書的廣泛流傳，人們更加景仰這位醫藥之聖、民族精英，歌頌他的不朽業績。公元（1949）年，新中國成立後，政府撥專款將李時珍與夫人吳氏的合葬墓以及他的父母李言聞與張氏的合葬墓修繕一新，並建造了一係列碑、亭、塔等紀念性建築物，塔前雕刻著李時珍的半身塑像。
墓門用花崗石砌成，橫梁上鐫刻著“科學之光”四個大字。
1956年2月，一代大師郭沫若先生為修建李時珍墓親筆題詞：
醫中之聖，集中國藥學之大成，《本草綱目》乃一八九二種藥物說明，廣羅博采，曾費三十年之殫精。
造福生民，使多少人延年活命！偉哉夫子，將隨民族生命永生。
並在碑文附注中寫道：
李時珍乃十六世紀中國偉大醫藥家，在植物學研究方麵亦為世界前驅。
1963年12月14日，郭沫若先生在湖北省博物館參觀後再度揮筆為李時珍題詞：
李時珍是偉大的自然科學家，他在藥物學中尤其有特出的成就。他的《本草綱目》記載藥物近兩千種，具有總結性與創造的特色，使中國醫術得以推進，人民健康有所保障。他已被公認為世界第一流科學家中一位顯著的人物，當永遠向他學習。
李時珍墓被列為全國重點文物保護單位。當年李時珍用以栽培藥物的“紅花園”已開辟為“李時珍藥圃”，並在李時珍隨父施診的玄妙觀遺址上建起了一座新型的“李時珍醫院”，門上方刻印著郭沫若先生的墨跡——“蘄春縣李時珍醫院”幾個蒼勁有力的大字，這一切都說明李時珍的名字已經根植於人們心底，將隨民族大運永生！
《本草綱目》是李時珍在醫藥學研究方麵所取得的最突出的成就，也是他的成名之作。他一生還著有十多部醫學著作：
《瀕湖脈學》；
《奇經八脈考》；
《脈訣考證》；
《命脈考》；
《李瀕湖氏時珍脈詩》；
《李瀕湖脈學詩四言舉要便談》；
《五髒圖論》；
《三焦客難》；
《蘄蛇傳》；
《天傀論》；
《瀕湖醫案》；
《瀕湖集簡方》。
李時珍是一位才思敏捷、醫術高超、醫德高尚的名醫。
李時珍不僅是一位醫藥學家，而且也稱得上是一位文學家。他從小就愛看《爾雅》，熟讀過四書五經，篤好詩歌文學，崇拜屈原、司馬遷、李白、杜甫、白居易、王安石和蘇東坡等人，文學功底相當深厚，留下的作品有《詩話》、《唐律》和《艸過所館詩》。他的文學才能在《本草綱目》中體現得十分明顯，讓人讀起來膾炙人口，毫無枯燥之感覺。
《本草綱目》一書是李時珍讀萬卷書、行萬裏路，多方走訪，反複考察，字斟句酌，不斷補充新的內容，先後經過三次較大規模的修改，曆時27年才完成的一部醫藥學巨著。全書共計52卷，190餘萬字，收入藥物1892種，其中植物藥1094種，動物藥444種，礦物藥275種，其他藥79種。與舊“本草”中最完善的《證類本草》對比，新增藥物374種。書中插入1160幅繪圖，附有藥方11096首，是一部融理論與實用性於一身的科學著作。