1942年1月1日，第一個反抗組織在維爾納建立，150名年輕的猶太複國主義者號召“自衛”：“我們決不是供德國人屠宰的羊。”猶太人地下組織中心在幾個星期內製定了正式的法律章程，勸告區內的猶太人不要做德國人的走狗，號召猶太人殺死猶太警察首領。號召猶太人盡量把自己武裝起來，例如，斧頭、刀、腐蝕性物質、易燃物質等。在東歐各地，猶太人采取的抵抗行動力量很小，但是如果情況允許可以對孤立的德國人進行攻擊，切斷電訊線路、破壞軍事設施。
猶太人麵臨的主要問題是缺少武器，沒有武器而對德國進行反抗隻會自取滅亡。1942年末至1943年的1月22日，波蘭猶太抵抗運動中心獲得59支手槍和50顆手榴彈的援助。猶太人通過各種手段從波蘭人那裏購買武器。在西裏西亞，猶太人從意大利士兵那裏購買武器。各地猶太人委員會為猶太人抵抗組織提供軍事援助，為其運送手榴彈和炸藥，華沙猶太人委員會秘密募集100萬茲羅提捐給抵抗組織。
在德國人對猶太人隔離區進行圍剿的所到之處，幾乎都受到猶太人的反抗，猶太人利用地形或高大的建築物攻擊德國人。
1942年12月12日，德國人屠殺全體猶太勞工時，勞工們用路障擋住了德國人的裝甲車，用自製手榴彈攻擊德國人。德國人放火燒毀了整個建築物，猶太勞工集體跳進火海。
在普通猶太人隔離區內，猶太人采取躲藏的方法來對付德國人的屠殺。很多人在地下挖掩體，可供百餘人在裏麵生存幾個月。有些掩體裏接上自來水管道，設有食物庫房。很多掩體都有通道來往，在隔離區的地下，形成了四通八達的居住場所。
1943年1月18日，德國人突然包圍了華沙猶太人隔離區，猶太複國主義聯盟第5支隊反抗，打死打傷50多個德國士兵，搶來部分輕型武器。3天後，德國人的驅逐行動停止了。這次戰鬥，鼓舞了猶太人的士氣，麵包店老板給他們送去麵包，皮革工人為武器製作了皮套。
此後，華沙猶太複國主義聯盟由6個支隊發展到10個支隊，並配備了一些槍支。許多隊員用木棒等作為武器。
華沙猶太人抵抗組織通過無線電於1943年1月21日向紐約的國際猶太人總部領導人發出呼籲：“目前數百萬猶太人正受到最殘酷的死亡威脅，仍幸存的猶太人委托我們向你們表明立場：堅決向德國人複仇；阻止德國人的大屠殺；團結眾多的國家；提供50萬美元的援助。
2月7日，崩得派地下抵抗組織的領導人通過無線電向在英國的波蘭政府報告情況。3月14日，猶太工人搗毀工廠、燒毀車間、破壞機車的行動此起彼伏。
1943年4月，華沙猶太區隻剩7萬人了。為了滅絕猶太人，德國竟決定把猶太人都送進死亡營。
4月19日，華沙猶太戰鬥組織在波蘭人民近衛軍和波蘭國家軍的援助下，領導猶太人舉行了二戰期間規模最大的起義。當天淩晨2時，黨衛隊和立陶宛、烏克蘭自衛隊包圍了華沙猶太人隔離區。6時，2000名黨衛隊衝進隔離區。猶太複國主義聯盟抵抗支隊與擁有坦克、裝甲車的德軍相對抗。
猶太複國主義者視死如歸，用燃燒瓶摧毀了坦克，殺死德國人。傍晚5時，200多德軍死亡，被迫撤離。盡管猶太人最終會繼續遭到屠殺，然而，猶太人仍然狂歡著。
4月19日成為猶太人的節日。4月20日，猶太複國主義者向黨衛軍增援部隊投擲手榴彈和爆炸物，炸死了約300名德軍中的100多名。午後，德軍動用了坦克、野戰炮和高射機槍。德國人向建築物開炮，不再供應電、氣和水。猶太人把路障和建築物點燃，阻擋德軍的坦克。
4月21日，德國人調來大批坦克、野戰炮和高射炮。猶太人躲進地下。整個華沙都被戰火吞噬著。
4月22日，上百萬猶太人從地下掩體中逃出來。德軍土兵用火焰噴射器和警犬去搜捕猶太人。被德國人抓住的猶太人遭到毒打後，被押進集中營。
4月23日，戰鬥轉向波蘭北部的波尼亞圖夫，8000名工人參加了起義。他們渴望得到飛機、大炮和機槍。
猶太抵抗運動中心向全體波蘭人發布公告：“從現在起，讓波蘭的每個地方都變成堡壘。我們寧願全部犧牲，也不屈服。”波蘭各地爆發起義。
4月29日，斯契烏爾茨工廠的抵抗組織戰鬥隊員和工人把設備搬到路上，阻止德軍的進攻。5月8日，100多名德軍衝了進來，開始了血腥屠殺。5月10日，整個華沙猶太人隔離區變成了一座公墓。
11月，猶太幸存者大大減少，在特拉夫尼基和波尼亞圖夫，猶太人隻剩下1000人左右；在波羅的海沿岸森林隻剩下15000人左右……